More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0223 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0223  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
267 aa  537  9.999999999999999e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0502  enoyl-CoA hydratase  58.58 
 
 
268 aa  294  9e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1870  enoyl-CoA hydratase  56.83 
 
 
270 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3284  enoyl-CoA hydratase  58.36 
 
 
277 aa  287  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1966  enoyl-CoA hydratase  54.24 
 
 
270 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.56 
 
 
271 aa  283  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.940148  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2926  enoyl-CoA hydratase  54.24 
 
 
269 aa  277  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3598  enoyl-CoA hydratase  55.35 
 
 
270 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1678  enoyl-CoA hydratase  54.61 
 
 
270 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.02 
 
 
270 aa  271  9e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  54.89 
 
 
280 aa  260  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2234  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.77 
 
 
275 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4481  enoyl-CoA hydratase  55.06 
 
 
273 aa  258  6e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.189541 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4615  enoyl-CoA hydratase  55.06 
 
 
273 aa  258  6e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2637  putative enoyl-CoA hydratase  48.3 
 
 
266 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1674  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.43 
 
 
269 aa  216  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.573511  normal  0.0329528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2539  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.61 
 
 
266 aa  203  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1980  enoyl-CoA hydratase  48.67 
 
 
265 aa  203  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40988  enyol-coa hydratase  36.2 
 
 
356 aa  164  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.569479  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  41.3 
 
 
268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0571  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
273 aa  163  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3457  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 
268 aa  158  8e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0572  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 
268 aa  158  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0572  enoyl-CoA hydratase  35.58 
 
 
268 aa  156  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0573  enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 
268 aa  155  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3510  enoyl-CoA hydratase  36.43 
 
 
268 aa  150  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4327  enoyl-CoA hydratase  37.04 
 
 
299 aa  149  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164377  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3304  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
268 aa  148  9e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0623  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
278 aa  148  9e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0388  enoyl-CoA hydratase  37.07 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165934  unclonable  0.000000000539782 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0533  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 
268 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3918  enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 
268 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0454  enoyl-CoA hydratase  36.86 
 
 
269 aa  143  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3792  enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 
268 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3735  enoyl-CoA hydratase  36.86 
 
 
268 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3709  enoyl-CoA hydratase  36.43 
 
 
268 aa  142  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0348  enoyl-CoA hydratase  35.44 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0382  enoyl-CoA hydratase  35.44 
 
 
270 aa  140  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3135  enoyl-CoA hydratase  36.1 
 
 
268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.95 
 
 
967 aa  125  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 
273 aa  123  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1409  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 
263 aa  122  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2168  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.35 
 
 
284 aa  122  9e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  31.2 
 
 
270 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  29.84 
 
 
270 aa  115  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  30.38 
 
 
270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  31.06 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1507  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.84 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.415213  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  31.89 
 
 
257 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16135  predicted protein  31.56 
 
 
278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  30.8 
 
 
279 aa  112  7.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  30.2 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0249  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.59 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.282458  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.77 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.360826  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5074  enoyl-CoA hydratase  30.94 
 
 
271 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5367  enoyl-CoA hydratase  30.94 
 
 
271 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4986  enoyl-CoA hydratase  30.94 
 
 
271 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906298  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  29.7 
 
 
280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  31.06 
 
 
270 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  28.41 
 
 
280 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  32.21 
 
 
263 aa  108  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0665  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 
250 aa  108  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.103858  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  29.7 
 
 
270 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  28.57 
 
 
270 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5498  enoyl-CoA hydratase  34.12 
 
 
253 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  30.68 
 
 
270 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  29.1 
 
 
260 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2008  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.83 
 
 
276 aa  105  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  29.43 
 
 
262 aa  105  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.71 
 
 
269 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02529  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G14520)  29.56 
 
 
280 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.221324  normal  0.697318 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  28.73 
 
 
260 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.62 
 
 
274 aa  102  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
287 aa  102  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.35 
 
 
265 aa  102  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5512  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.02 
 
 
286 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 
275 aa  102  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396573  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  28.51 
 
 
287 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  31.76 
 
 
264 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  28.57 
 
 
266 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3232  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.38 
 
 
274 aa  101  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0265787  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28497  delta-3,5-delta-2,4-dienoyl-CoA isomerase  31.28 
 
 
291 aa  101  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  31.76 
 
 
290 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  31.76 
 
 
290 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  27.72 
 
 
253 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0413  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 
251 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613857  normal  0.169289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.45 
 
 
251 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3671  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 
270 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.222847  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.63 
 
 
260 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0067  enoyl-CoA hydratase  32.3 
 
 
256 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  29.37 
 
 
269 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  29.37 
 
 
269 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  29.37 
 
 
269 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  31.4 
 
 
263 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.96 
 
 
264 aa  99.8  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 
280 aa  99.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  31.8 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  30.19 
 
 
262 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  29.48 
 
 
263 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>