150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0134 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  100 
 
 		 220 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  43.56 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  42.66 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  41.3 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  45.74 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  44.19 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  42.38 
 
 		 202 aa  112  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  37.31 
 
 		 227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  41.01 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  40.13 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  33.33 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  44 
 
 		 163 aa  99.8  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  36 
 
 		 161 aa  96.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  37.59 
 
 		 189 aa  95.9  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  37.59 
 
 		 189 aa  95.9  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  36.99 
 
 		 168 aa  95.1  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  36.91 
 
 		 185 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  36.36 
 
 		 167 aa  94  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  37.25 
 
 		 226 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  34.51 
 
 		 184 aa  93.2  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  40 
 
 		 176 aa  92.4  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  31.05 
 
 		 241 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  37.04 
 
 		 166 aa  92  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  35.26 
 
 		 171 aa  92  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2156  nuclease (SNase domain protein)  36.47 
 
 		 177 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  31.11 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  33.7 
 
 		 243 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  34.01 
 
 		 172 aa  85.5  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2471  nuclease (SNase domain protein)  34.42 
 
 		 177 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2193  nuclease  34.42 
 
 		 177 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  30.77 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  42.96 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  30.22 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  30.51 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  35.29 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  37.61 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  32.61 
 
 		 534 aa  75.1  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  31.52 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2052  succinoglycan biosynthesis protein  34.38 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  37.21 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2078  nuclease (SNase domain protein)  37.69 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  32.24 
 
 		 158 aa  72  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  36.43 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  63.04 
 
 		 331 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  63.04 
 
 		 332 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  63.04 
 
 		 333 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  63.04 
 
 		 333 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2154  excalibur domain family  64.58 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1973  hypothetical protein  64.44 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000663025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2180  hypothetical protein  63.04 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5258  nuclease  33.57 
 
 		 170 aa  67.8  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  60.42 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0136  Excalibur domain protein  65.31 
 
 		 382 aa  65.9  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  32.43 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5043  nuclease (SNase domain protein)  36.92 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1952  hypothetical protein  63.41 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  75 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  31.87 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  30.94 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  29.61 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  25.45 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  30.05 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4287  Domain of unknown function DUF1994  42.55 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.671447  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2752  hypothetical protein  34.35 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0504  Excalibur  49.35 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  27.85 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  28.48 
 
 		 175 aa  62  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  29.86 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1730  nuclease  33.6 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0510494  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6085  nuclease  36.89 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  38.17 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  34.56 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1032  SNase-like nuclease  32.68 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  27.15 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  42.11 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  32.34 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  28.77 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1886  nuclease  32.28 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0424  nuclease (SNase-like)  32.98 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445506  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  27.85 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1214  putative CheA signal transduction histidine kinase  59.09 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1131  nuclease (SNase-like)  33.08 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.844533  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  27.38 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4452  hypothetical protein  33.82 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  28.31 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3789  SNase-like nuclease  27.42 
 
 		 131 aa  53.1  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0300901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  32.67 
 
 		 169 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  25.88 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  27.1 
 
 		 166 aa  52.4  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4353  hypothetical protein  29.21 
 
 		 199 aa  52.4  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  26.99 
 
 		 221 aa  52  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0301  Excalibur domain protein  69.77 
 
 		 154 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4183  nuclease (SNase-like)  28.86 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283514  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  28.86 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  25.88 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2387  Excalibur domain protein  57.89 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000276627  hitchhiker  0.000344764 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0844  Excalibur domain protein  61.82 
 
 		 115 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  27.22 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  30.65 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>