26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0092 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0092  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  285  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125559  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20960  putativ isomerase  40.8 
 
 
141 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3023  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.109621  normal  0.240834 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2983  phenazine biosynthesis protein  41.9 
 
 
131 aa  88.2  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.543755  hitchhiker  0.00301559 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1346  hypothetical protein  36.72 
 
 
147 aa  87.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199001  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3054  hypothetical protein  39.2 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3008  hypothetical protein  39.32 
 
 
131 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184191  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1489  hypothetical protein  31.25 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2584  hypothetical protein  34.62 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3328  hypothetical protein  37.39 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0918311  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5173  hypothetical protein  34.17 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0013731  hitchhiker  0.00383993 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1487  Ketosteroid isomerase-related protein-like protein  37.17 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.71632 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4686  hypothetical protein  29.46 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1709  hypothetical protein  30.4 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4294  putative phenazine biosynthesis protein  30.17 
 
 
143 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.762733  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4177  hypothetical protein  30.84 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1957  hypothetical protein  31.78 
 
 
182 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6124  hypothetical protein  32.14 
 
 
143 aa  58.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532323  hitchhiker  0.00265373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3126  hypothetical protein  26.05 
 
 
125 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4413  hypothetical protein  28.57 
 
 
194 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7476  Limonene-12-epoxide hydrolase  32.52 
 
 
143 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0495264  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0569  phenazine biosynthesis protein  34.55 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2083  hypothetical protein  33.06 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24149  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6461  hypothetical protein  30.97 
 
 
144 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3733  hypothetical protein  27.2 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5298  hypothetical protein  28.7 
 
 
135 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406321  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>