More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0084 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0084  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  397  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.382504  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4730  TetR family transcriptional regulator  59.49 
 
 		 197 aa  237  9e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.88373  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04117  predicted transcriptional regulator  59.49 
 
 		 197 aa  236  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1797  TetR family transcriptional regulator  61.03 
 
 		 196 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.125509  normal  0.0456013 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04081  hypothetical protein  59.49 
 
 		 197 aa  236  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4834  transcriptional regulator, TetR family  59.49 
 
 		 197 aa  236  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1859  TetR family transcriptional regulator  61.03 
 
 		 196 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1658  TetR family transcriptional regulator  61.03 
 
 		 196 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.166061 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1477  transcriptional regulator, TetR family  61.03 
 
 		 196 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1799  transcriptional regulator, TetR family  60.51 
 
 		 196 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5772  transcriptional regulator, TetR family  59.49 
 
 		 197 aa  234  6e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3746  transcriptional regulator, TetR family  58.46 
 
 		 197 aa  234  7e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3762  TetR family transcriptional regulator  58.97 
 
 		 197 aa  234  8e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4822  TetR family transcriptional regulator  58.97 
 
 		 197 aa  234  8e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4506  TetR family transcriptional regulator  58.97 
 
 		 197 aa  234  9e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165942  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2967  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.699652  normal  0.0717993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5542  transcriptional regulator, TetR family  34.66 
 
 		 194 aa  92.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789571  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2779  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  91.7  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3140  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 221 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.263348  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2298  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 219 aa  89  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0904  TetR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0824382  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3330  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 219 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7468  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 218 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23471  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 195 aa  84.7  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26140  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287141  normal  0.149256 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1901  TetR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.665453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1774  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3310  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0639272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2386  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0120  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.555065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0796  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.091153  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1233  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0636137  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  28.57 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283926 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3137  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  27.6 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5169  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4571  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1681  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2906  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0722139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5842  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25935  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4399  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4123  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3418  regulatory protein TetR  34 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  0.510685 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2227  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1620  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3244  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2927  regulatory protein, TetR  34.44 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8807  putative transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3046  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0960  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.115896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1348  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0959  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0839  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0293  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000668888 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3984  transcriptional regulator, TetR family protein  27.1 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5345  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.922777  normal  0.179588 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0493  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0833  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2754  hypothetical protein  30.1 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.575763  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0851  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0620  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>