More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0082 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
269 aa  528  1e-149  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.18 
 
 
271 aa  331  7.000000000000001e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.07 
 
 
265 aa  315  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.15353 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.15 
 
 
285 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.16 
 
 
271 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.47 
 
 
281 aa  298  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.47 
 
 
281 aa  298  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.699263 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.38 
 
 
266 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177624  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4474  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.36 
 
 
270 aa  298  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000662369 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.33 
 
 
269 aa  297  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.356237  normal  0.14087 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.25 
 
 
266 aa  297  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.662669  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1706  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.69 
 
 
266 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951732  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.85 
 
 
266 aa  296  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498015  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.11 
 
 
270 aa  296  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3566  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.26 
 
 
269 aa  295  6e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.46 
 
 
269 aa  294  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.674583 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.49 
 
 
266 aa  291  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308915  normal  0.0922746 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.91 
 
 
270 aa  287  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312813  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.37 
 
 
266 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642907  decreased coverage  0.0040913 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1901  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.62 
 
 
266 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.47 
 
 
266 aa  275  5e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3264  putative oxidoreductase protein  55.51 
 
 
264 aa  271  6e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.39 
 
 
262 aa  267  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418257  normal  0.135019 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.13 
 
 
271 aa  265  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59 
 
 
262 aa  262  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.128983  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.31 
 
 
265 aa  263  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.98 
 
 
270 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.69 
 
 
263 aa  261  8e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2716  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.05 
 
 
265 aa  256  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.39 
 
 
265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0355963  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4040  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.87 
 
 
264 aa  251  7e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128419  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63890  putative short-chain dehydrogenase  50 
 
 
265 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5551  putative short-chain dehydrogenase  50.38 
 
 
265 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.97 
 
 
264 aa  235  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.576998  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3183  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.13 
 
 
260 aa  231  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.47 
 
 
262 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2174  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
261 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.30567  hitchhiker  0.00567391 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.5 
 
 
269 aa  226  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.590645  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.98 
 
 
260 aa  224  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.47 
 
 
262 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.31 
 
 
266 aa  221  9e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.130238  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.36 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.49 
 
 
266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341044  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2478  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.49 
 
 
262 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3539  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.14 
 
 
262 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.69 
 
 
266 aa  215  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
287 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.06 
 
 
266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.63 
 
 
264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2989  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.63 
 
 
264 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0851531 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1864  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  44.36 
 
 
262 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.66 
 
 
264 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
262 aa  206  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.511264  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0995  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
267 aa  205  6e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5566  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.12 
 
 
199 aa  202  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0343056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5145  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.56 
 
 
267 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.23 
 
 
268 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00272439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
264 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.241971  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
257 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0958  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.75 
 
 
263 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
269 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 
283 aa  159  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38500  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  39.82 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.61 
 
 
253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0605466  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.05 
 
 
259 aa  145  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0124  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
269 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.61 
 
 
250 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.92313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.16 
 
 
269 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05610  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  36.36 
 
 
296 aa  135  6.0000000000000005e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100134  normal  0.886117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 
252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.092001  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 
258 aa  133  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  37.61 
 
 
266 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.17 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3647  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.12 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
258 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
258 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.354983 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.11 
 
 
271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.757683  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.01 
 
 
261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.4 
 
 
262 aa  129  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2426  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
269 aa  129  7.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.316114 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
255 aa  128  9.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000634692  hitchhiker  0.00117931 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.56 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.84 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.16 
 
 
249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.617745 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.27 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.9 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000620196  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1382  hypothetical protein  32.62 
 
 
259 aa  123  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01284  dehydrogenase  34.36 
 
 
266 aa  122  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 
262 aa  122  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
258 aa  122  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.381329 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.84 
 
 
258 aa  122  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.28 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.485174  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25790  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  34.39 
 
 
282 aa  120  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1378  hypothetical protein  32.03 
 
 
259 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35320  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  34.21 
 
 
249 aa  119  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135035  normal  0.316469 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>