More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0078 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 283 aa  559  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.406068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.93 
 
 		 289 aa  219  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.6 
 
 		 290 aa  205  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.4 
 
 		 293 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.426918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.6 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.935944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 		 293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 		 276 aa  199  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 		 278 aa  198  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 		 291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 		 291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 		 291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.22 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.7 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.04 
 
 		 274 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 		 282 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 		 291 aa  191  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 		 282 aa  191  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.55 
 
 		 279 aa  191  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.93 
 
 		 282 aa  189  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  40.22 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.69 
 
 		 292 aa  186  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.6 
 
 		 277 aa  186  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 		 286 aa  185  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  41.76 
 
 		 280 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  41.09 
 
 		 283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 		 280 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 		 273 aa  176  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  41.03 
 
 		 280 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.29 
 
 		 276 aa  176  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 286 aa  175  9e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  39.34 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  39.05 
 
 		 285 aa  172  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 		 274 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.93 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 		 279 aa  169  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 		 276 aa  169  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 		 285 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 280 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  37.23 
 
 		 284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 		 279 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1152  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 		 258 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 		 286 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  36.5 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 		 275 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.99 
 
 		 274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  0.0715195 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  39.48 
 
 		 303 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 		 285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 		 272 aa  162  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 282 aa  162  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 288 aa  161  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0971  Short-chain alcohol dehydrogenase  38.87 
 
 		 287 aa  160  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.32 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  36.78 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 		 280 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 		 279 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  35.92 
 
 		 276 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  37.05 
 
 		 278 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.57 
 
 		 280 aa  156  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0057  short chain dehydrogenase  34.56 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.551816 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0757  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  33.72 
 
 		 282 aa  156  5.0000000000000005e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0227485  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 		 283 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.83 
 
 		 271 aa  155  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 		 273 aa  155  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135056  normal  0.0706675 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  36.26 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 284 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.77 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  35.83 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966352 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl173  dehydrogenase  33.2 
 
 		 278 aa  153  4e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3237  short chain dehydrogenase  35.6 
 
 		 274 aa  152  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.996911 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  43.41 
 
 		 284 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6770  short chain dehydrogenase  36.8 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.01823 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.09 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 		 284 aa  149  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1825  short chain dehydrogenase  35.57 
 
 		 278 aa  149  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 		 277 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>