196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0060 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  100 
 
 		 358 aa  732    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  39.47 
 
 		 351 aa  253  3e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  46.58 
 
 		 320 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  38.83 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  36.42 
 
 		 325 aa  216  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  37.28 
 
 		 326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  39.6 
 
 		 317 aa  209  9e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  42.31 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  40.11 
 
 		 339 aa  207  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  41.52 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  34.49 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  32.86 
 
 		 338 aa  194  3e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  36.78 
 
 		 340 aa  193  4e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  40.07 
 
 		 330 aa  190  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  38.91 
 
 		 297 aa  189  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  35.79 
 
 		 319 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  38.33 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  35.94 
 
 		 326 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  31.62 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  31.62 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  30.66 
 
 		 326 aa  172  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  34.59 
 
 		 331 aa  156  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  31.44 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  31.69 
 
 		 372 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  29.58 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  27.66 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  33.81 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  30.36 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  33.98 
 
 		 353 aa  106  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  31.75 
 
 		 354 aa  105  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  30.19 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  26.64 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  30.13 
 
 		 334 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  32.62 
 
 		 361 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  28.43 
 
 		 338 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  31.41 
 
 		 336 aa  102  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  27.6 
 
 		 316 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.39 
 
 		 339 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.82 
 
 		 342 aa  96.3  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.96 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  26.07 
 
 		 366 aa  92.8  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  27.98 
 
 		 312 aa  92.8  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  29.86 
 
 		 378 aa  90.9  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  24.83 
 
 		 348 aa  91.3  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  31.9 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  29.37 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  28.87 
 
 		 365 aa  86.7  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  25.37 
 
 		 341 aa  86.3  9e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  32.43 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.43 
 
 		 339 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  28.29 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  26.97 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  29.24 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  27.14 
 
 		 334 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  30 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.61 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.37 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  28.18 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.98 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  24.42 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  28.28 
 
 		 629 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2730  amidohydrolase 2  27.05 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  25.98 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  26.4 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.8 
 
 		 383 aa  76.3  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  23.46 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  28.47 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  27.72 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  30.05 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  25.87 
 
 		 364 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  25.44 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  27.47 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.15 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  26.25 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4901  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.76 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  24.92 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  26.32 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  26.58 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.4 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.85 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  23.19 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  25.99 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  25.17 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  25.58 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2489  amidohydrolase 2  23.84 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.426187 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  25.08 
 
 		 343 aa  67  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03601  conserved hypothetical protein  26.14 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3686  amidohydrolase 2  24.39 
 
 		 380 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3759  amidohydrolase 2  24.39 
 
 		 380 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3699  amidohydrolase 2  24.39 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6117  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  21.4 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  24.51 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4165  amidohydrolase 2  24.03 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  25.42 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  23.26 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.36 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2697  4-oxalomesaconate hydratase  23.33 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  32.94 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  25.67 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>