260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0046 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  372  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  58.43 
 
 		 175 aa  185  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  47.92 
 
 		 168 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 169 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 172 aa  110  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  44.83 
 
 		 183 aa  105  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 172 aa  92.4  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 183 aa  92.4  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  42.45 
 
 		 184 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 160 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 181 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 158 aa  90.9  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 160 aa  89.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  30.94 
 
 		 160 aa  89  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 226 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  30.94 
 
 		 160 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  49.53 
 
 		 154 aa  87.8  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  48.45 
 
 		 191 aa  87  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  30.94 
 
 		 160 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  48.45 
 
 		 191 aa  87  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  48.45 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 160 aa  86.3  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 160 aa  85.9  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 160 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 160 aa  86.3  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  30.22 
 
 		 160 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 155 aa  85.9  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 158 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 185 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 182 aa  85.1  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 157 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 169 aa  85.1  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 169 aa  85.1  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 179 aa  84.3  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 237 aa  84.3  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  46.53 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  42.99 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  36.22 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  46.53 
 
 		 167 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  42.99 
 
 		 163 aa  80.5  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  44.33 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 145 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  32.03 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  29.46 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4350  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 		 161 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 182 aa  52  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  40 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  45.31 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 		 140 aa  49.3  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  34.41 
 
 		 150 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  37.65 
 
 		 158 aa  48.9  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2642  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 143 aa  49.3  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 146 aa  48.9  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  38.46 
 
 		 157 aa  48.5  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 152 aa  48.1  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 186 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  36.56 
 
 		 144 aa  47.8  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  37.68 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  39.18 
 
 		 154 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  30.17 
 
 		 149 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 		 161 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 146 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  40.3 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 314 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 141 aa  46.6  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  38.46 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 309 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 143 aa  46.2  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 159 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  29.46 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 144 aa  46.2  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0875  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445474 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  34.41 
 
 		 143 aa  45.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>