More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0045 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0045  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
286 aa  553  1e-157  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1142  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.57 
 
 
269 aa  181  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4472  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.02 
 
 
268 aa  152  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.432942  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1362  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.81 
 
 
272 aa  152  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65645  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0881  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.2 
 
 
277 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120962  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0151  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.29 
 
 
269 aa  145  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.779735  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1258  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.53 
 
 
276 aa  145  9e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00981476 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4024  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.98 
 
 
276 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.363297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4063  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.14 
 
 
277 aa  142  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3328  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.11 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.639937 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3769  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.79 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.790636 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3281  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.17 
 
 
274 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.07 
 
 
273 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2645  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.39 
 
 
273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2198  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.64 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00651972  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.41 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1627  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.16 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310738 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.5 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2265  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.6 
 
 
293 aa  133  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.739581 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0677  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.38 
 
 
260 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  37 
 
 
271 aa  132  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  37 
 
 
271 aa  132  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.88 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1138  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.49 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268881 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.23 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.82 
 
 
274 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2668  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.31 
 
 
259 aa  130  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4946  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.03 
 
 
277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.891745  hitchhiker  0.000000908822 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.12 
 
 
289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2938  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.55 
 
 
273 aa  129  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
289 aa  129  7.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1323  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.22 
 
 
273 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.709486  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.18 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.43 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.49 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4871  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.03 
 
 
268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.552368 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0623  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.45 
 
 
271 aa  126  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2538  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.85 
 
 
278 aa  126  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.71 
 
 
271 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9249  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.36 
 
 
300 aa  125  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0562195  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0764  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.39 
 
 
280 aa  125  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.09 
 
 
273 aa  125  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.92 
 
 
270 aa  125  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.4 
 
 
301 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.18 
 
 
281 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3963  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.79 
 
 
280 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.93073  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3746  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.8 
 
 
273 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.891447  normal  0.288204 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3276  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.41 
 
 
274 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215376  hitchhiker  0.00496059 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.99 
 
 
279 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.9 
 
 
277 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3009  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.03 
 
 
273 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575876  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.81 
 
 
271 aa  123  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3795  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.81 
 
 
269 aa  123  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.322832 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1591  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.78 
 
 
271 aa  122  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.542634  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.67 
 
 
273 aa  122  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1560  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.78 
 
 
271 aa  122  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.87 
 
 
266 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.8 
 
 
270 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.88 
 
 
274 aa  122  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.51 
 
 
282 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.85 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.45 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1065  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.21 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.378355  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.43 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.42 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2466  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.76 
 
 
266 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.391449  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.96 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.4 
 
 
276 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4171  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.9 
 
 
281 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.6 
 
 
264 aa  119  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.21 
 
 
270 aa  119  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.58 
 
 
264 aa  119  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.72 
 
 
285 aa  119  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.36 
 
 
273 aa  119  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.96 
 
 
279 aa  119  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.275974  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2802  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.59 
 
 
278 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.45 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2325  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.1 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.58 
 
 
274 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.2 
 
 
267 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.72 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.58 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0475  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.98 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0937  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.86 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.69 
 
 
269 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.6 
 
 
274 aa  116  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3146  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.86 
 
 
277 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.59 
 
 
271 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.69 
 
 
275 aa  116  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.45 
 
 
270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.45 
 
 
270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.16 
 
 
270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.32 
 
 
267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.45 
 
 
270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.08 
 
 
280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.69 
 
 
273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3018  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.27 
 
 
275 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1680  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  33.7 
 
 
289 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185194  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.59 
 
 
280 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>