25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0044 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0044  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 
561 aa  1130    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2790  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  50.67 
 
 
565 aa  496  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0567243  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1377  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  42.67 
 
 
562 aa  349  7e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2397  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.8 
 
 
581 aa  268  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300063  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3004  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.47 
 
 
562 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1665  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.39 
 
 
568 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.785614  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07660  putative alkaline phosphatase  26.02 
 
 
556 aa  157  5.0000000000000005e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0307929  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0023  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.17 
 
 
539 aa  151  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0724  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.62 
 
 
545 aa  150  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2275  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.57 
 
 
544 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1818  hypothetical protein  28.2 
 
 
545 aa  147  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3006  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.67 
 
 
541 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3007  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.36 
 
 
557 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2981  putative alkaline phosphatase  28.18 
 
 
571 aa  144  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882941  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1357  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.49 
 
 
552 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.882864 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1819  hypothetical protein  28.11 
 
 
545 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3360  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.69 
 
 
548 aa  141  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.263432  normal  0.164885 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1165  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.35 
 
 
555 aa  140  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0390  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.41 
 
 
531 aa  140  8.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  normal  0.642333 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1743  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.29 
 
 
577 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0812023  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4606  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.41 
 
 
583 aa  94.4  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0515  hypothetical protein  22.71 
 
 
531 aa  55.1  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00486744 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4875  phosphonoacetate hydrolase  30.56 
 
 
424 aa  45.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  33.88 
 
 
455 aa  45.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20320  uncharacterized AP superfamily protein  33.91 
 
 
427 aa  43.9  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.291938  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>