70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0028 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0028  PepSY-associated TM helix  100 
 
 		 362 aa  719    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.522005  normal  0.11263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3919  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  59.76 
 
 		 330 aa  343  2e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0667  PepSY-associated TM helix  32.13 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2775  PepSY-associated TM helix  27.49 
 
 		 393 aa  95.1  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0714  hypothetical protein  29.18 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0335793 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1819  PepSY-associated TM helix  27.76 
 
 		 370 aa  91.7  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0029007  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5168  PepSY-associated TM helix domain protein  25.27 
 
 		 380 aa  89.4  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.02 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  28.57 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4253  PepSY-associated TM helix  24.1 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  24.75 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  24.05 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0322  PepSY-associated TM helix  26.41 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0764  PepSY-associated TM helix domain protein  23.56 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.346881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2360  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.08 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.917069 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2260  iron-regulated membrane protein-like protein  23.53 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1239  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.07 
 
 		 570 aa  57.8  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0137948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.04 
 
 		 840 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  24.45 
 
 		 385 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1143  PepSY-associated TM helix  22.34 
 
 		 377 aa  53.9  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.193504  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  23.18 
 
 		 380 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0607  PepSY-associated TM helix domain protein  23.57 
 
 		 408 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.861518  normal  0.0104892 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53880  hypothetical protein  23.83 
 
 		 506 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0684  hypothetical protein  22.89 
 
 		 406 aa  53.5  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.15671  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  24.02 
 
 		 844 aa  52.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0233  oxidoreductase, FAD-binding, putative  25.33 
 
 		 734 aa  52.8  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4717  hypothetical protein  24.27 
 
 		 506 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.49 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  21.98 
 
 		 381 aa  50.4  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0971  hypothetical protein  23.81 
 
 		 381 aa  50.1  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2666  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  24.79 
 
 		 382 aa  50.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0181017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.16 
 
 		 571 aa  50.1  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.442593  normal  0.404376 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1998  amino acid carrier family protein  23.66 
 
 		 361 aa  49.7  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1027  hypothetical protein  24.66 
 
 		 444 aa  49.7  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203435  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0847  PepSY-associated TM helix  26.51 
 
 		 505 aa  49.7  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2884  hypothetical protein  23.53 
 
 		 371 aa  49.7  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179346  hitchhiker  0.000404668 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  24.46 
 
 		 840 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  21.39 
 
 		 394 aa  49.7  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1370  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.99 
 
 		 562 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0583943  normal  0.13833 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0244  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.41 
 
 		 412 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4600  PepSY-associated TM helix domain protein  21.24 
 
 		 538 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3238  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.38 
 
 		 359 aa  47.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3757  iron uptake protein  24.71 
 
 		 459 aa  47  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0769  PepSY-associated TM helix domain protein  27.78 
 
 		 384 aa  47  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1181  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.58 
 
 		 376 aa  46.6  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3346  uncharacterized iron-regulated membrane protein  24.11 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  20.99 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2856  PepSY-associated TM helix  23.77 
 
 		 539 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3075  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.65 
 
 		 557 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267998  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3413  putative iron-regulated membrane protein  25.82 
 
 		 356 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.715022 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4558  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.57 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179796 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4119  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.5 
 
 		 530 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.442292  normal  0.809833 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4267  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.91 
 
 		 482 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.230745  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4487  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.96 
 
 		 530 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.568718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0949  PepSY-associated TM helix domain protein  24.9 
 
 		 560 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3721  PepSY-associated TM helix  24.8 
 
 		 519 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.5 
 
 		 844 aa  44.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2949  hypothetical protein  24.18 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.94 
 
 		 539 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2773  hypothetical protein  23.23 
 
 		 382 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  20.3 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11438  putative sulfite reductase flavoprotein component  21.86 
 
 		 381 aa  44.3  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4111  hypothetical protein  22.25 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0153  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.95 
 
 		 412 aa  43.9  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  22.64 
 
 		 425 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1822  PepSY-associated TM helix family protein  24.72 
 
 		 504 aa  42.7  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  24.32 
 
 		 380 aa  42.7  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170457 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4265  PepSY-associated TM helix domain protein  24.32 
 
 		 380 aa  42.7  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.312937 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0900  nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component, putative  31.2 
 
 		 756 aa  42.7  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.638423  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4883  hypothetical protein  25.95 
 
 		 457 aa  42.7  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>