More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0017 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0017  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
327 aa  650    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0512561 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2668  alpha/beta hydrolase fold  44.73 
 
 
280 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105125  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2639  alpha/beta hydrolase fold  44.36 
 
 
280 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2684  alpha/beta hydrolase fold  44.36 
 
 
280 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9064  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  37.1 
 
 
310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1790  alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 
287 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.333084  hitchhiker  0.00365614 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  34.09 
 
 
279 aa  169  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  37.68 
 
 
272 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  34.82 
 
 
323 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  33.55 
 
 
326 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  33.84 
 
 
265 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2025  alpha/beta hydrolase fold protein  33.96 
 
 
276 aa  157  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0737  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 
273 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755425  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  33.84 
 
 
265 aa  152  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  32.95 
 
 
259 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5863  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 
265 aa  145  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4208  alpha/beta hydrolase fold protein  35.12 
 
 
268 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  34.32 
 
 
284 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  35.82 
 
 
284 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  32.96 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1106  alpha/beta hydrolase fold protein  35.45 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.112481  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  35.07 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  32.24 
 
 
263 aa  132  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 
273 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  29.59 
 
 
286 aa  123  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  30.5 
 
 
279 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 
279 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1470  alpha/beta hydrolase fold protein  35.4 
 
 
315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1367  alpha/beta hydrolase fold  34.89 
 
 
310 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1299  hypothetical protein  27.8 
 
 
262 aa  116  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000570356  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  31.62 
 
 
279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1509  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 
261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.725835  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
283 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5414  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 
261 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  28.45 
 
 
284 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.466438 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  31.92 
 
 
270 aa  92.4  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3585  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 
270 aa  90.9  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  25.78 
 
 
285 aa  86.3  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  38.84 
 
 
425 aa  86.3  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
270 aa  85.9  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
280 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  31.65 
 
 
265 aa  84  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  31.63 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  31.63 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  29.41 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  30.12 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  27.41 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  31.05 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 
276 aa  79.3  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  38.46 
 
 
268 aa  79  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 
282 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  34.72 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  29.89 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  23.08 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  38.6 
 
 
226 aa  77  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  22.65 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  30.06 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  28.26 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
272 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
275 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  27.07 
 
 
233 aa  75.5  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  22.38 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  30.06 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  29.48 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  40.95 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  23.13 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  29.29 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  29.29 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1534  lipolytic enzyme  26.37 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.277395  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  29.29 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.29 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  29.29 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  29.29 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  28.45 
 
 
281 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  29.89 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  39.17 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  39.17 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.8 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  30.06 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  40.94 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  40.78 
 
 
255 aa  72.4  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  28.9 
 
 
261 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  28.9 
 
 
261 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4734  alpha/beta hydrolase fold  37.3 
 
 
285 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  28.9 
 
 
261 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  34.51 
 
 
258 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  29.04 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7902  alpha/beta hydrolase fold protein  40.87 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3907  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804884  normal  0.943348 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4021  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000197083  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>