More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0009 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0009  glutathione S-transferase-like protein  100 
 
 
220 aa  448  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.607663  normal  0.0509198 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5453  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.58 
 
 
217 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0448477 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3314  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.58 
 
 
248 aa  202  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.443514  normal  0.158342 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4813  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.56 
 
 
219 aa  201  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488854  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4798  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.68 
 
 
219 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.427555  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5354  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.11 
 
 
219 aa  198  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3491  glutathione S-transferase  50.23 
 
 
217 aa  197  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0183  glutathione S-transferase-like protein  50.23 
 
 
219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220885 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1768  glutathione S-transferase, putative  49.77 
 
 
219 aa  196  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00268696  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5471  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.77 
 
 
219 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5390  glutathione S-transferase-like  49.77 
 
 
219 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.602647  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3446  putative glutathione S-transferase  49.78 
 
 
219 aa  193  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1033  Glutathione S-transferase domain  49.32 
 
 
219 aa  192  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.372971 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2930  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.33 
 
 
217 aa  193  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195248  hitchhiker  0.000964394 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2818  Glutathione S-transferase domain protein  48.39 
 
 
219 aa  192  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0951  putative glutathione S-transferase  49.32 
 
 
219 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550052  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2204  glutathione S-transferase-like protein  49.32 
 
 
219 aa  191  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000939621  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0858  putative glutathione S-transferase  49.32 
 
 
303 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.211682  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3110  putative glutathione S-transferase  49.33 
 
 
218 aa  190  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000803235  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5294  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.7 
 
 
219 aa  189  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.95189  normal  0.556954 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0827  putative glutathione S-transferase  48.87 
 
 
219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000433785  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3839  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.66 
 
 
226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0044  putative glutathione S-transferase  48.87 
 
 
303 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123051  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1576  putative glutathione S-transferase  48.87 
 
 
219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00035479  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1312  putative glutathione S-transferase  47.95 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.503911  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2570  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.49 
 
 
228 aa  176  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3477  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.75 
 
 
217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2887  glutathione S-transferase-like  42.73 
 
 
226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.862789  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3436  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.91 
 
 
215 aa  156  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2062  Glutathione S-transferase domain  40.74 
 
 
228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2295  Glutathione S-transferase domain protein  41.2 
 
 
228 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.902832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  43.32 
 
 
391 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1953  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.67 
 
 
224 aa  129  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal  0.0851297 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5077  Glutathione S-transferase domain protein  37.74 
 
 
211 aa  108  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4254  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.63 
 
 
215 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3840  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.47 
 
 
215 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1651  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.13 
 
 
261 aa  86.3  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.491053  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.47 
 
 
215 aa  85.9  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0148  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.75 
 
 
216 aa  85.5  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.959935  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4049  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.05 
 
 
215 aa  85.5  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0126  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.88 
 
 
215 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4215  Glutathione S-transferase domain protein  34.88 
 
 
215 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4390  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.88 
 
 
215 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3548  glutathione S-transferase  34.52 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0089  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.47 
 
 
215 aa  82  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0127  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.53 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0027  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.15 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0450096  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2873  Glutathione S-transferase domain  31.53 
 
 
260 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4063  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.16 
 
 
233 aa  77  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0803873  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4697  glutathione S-transferase  33.14 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2088  glutathione S-transferase-like protein  32.2 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.828063  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0139  putative glutathione S-transferase  29.94 
 
 
202 aa  68.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2688  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761571  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  27.86 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5247  putative glutathione S-transferase GSTF2 (GST-II)  31.71 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal  0.155796 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2890  glutathione S-transferase-like  27.54 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  27.86 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.95 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  32.43 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2358  Glutathione S-transferase domain protein  29.94 
 
 
205 aa  65.1  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.426471  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0663  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.21 
 
 
205 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0696  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.21 
 
 
205 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0792  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.42 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.654502  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2967  glutathione S-transferase-like  25.56 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0755  Glutathione S-transferase domain protein  24.42 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0212  glutathione S-transferase-like  29.21 
 
 
205 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0589  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.08 
 
 
204 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4007  putative glutathione S-transferase  30.29 
 
 
202 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.228817 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  28.43 
 
 
202 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1203  Glutathione S-transferase domain protein  26.74 
 
 
203 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0280  maleylacetoacetate isomerase  30.77 
 
 
215 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.676121  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.78 
 
 
202 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3898  putative glutathione S-transferase  30.86 
 
 
202 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3962  putative glutathione S-transferase  29.71 
 
 
202 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.470719  normal  0.386103 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4069  putative glutathione S-transferase  29.71 
 
 
202 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3782  glutathione S-transferase-like protein  28.36 
 
 
204 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0615  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.59 
 
 
203 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal  0.218032 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0356  Glutathione S-transferase domain  27.75 
 
 
200 aa  62.4  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.326677  normal  0.746823 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3884  putative glutathione S-transferase  30.29 
 
 
231 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0796916  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0177  glutathione S-transferase family protein  27.75 
 
 
200 aa  62.4  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2116  glutathione S-transferase-like protein  28.57 
 
 
203 aa  62.4  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.489753  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5500  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.14 
 
 
203 aa  62  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2142  glutathione S-transferase-like protein  25.85 
 
 
223 aa  62  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  25.12 
 
 
221 aa  61.6  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2922  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.59 
 
 
207 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2778  Glutathione S-transferase domain protein  29.72 
 
 
261 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3505  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.24 
 
 
229 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  31.22 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2957  glutathione S-transferase-like protein  27.14 
 
 
204 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.23 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0647  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.7 
 
 
230 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.474841  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3693  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.26 
 
 
203 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.87 
 
 
252 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3336  Glutathione S-transferase domain  29.67 
 
 
204 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3920  putative glutathione S-transferase  28.07 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.430255 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0824  glutathione S-transferase-like  23.26 
 
 
203 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.317861  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0319  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.49 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3090  glutathione S-transferase  25.15 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840634  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  25.15 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4963  putative glutathione S-transferase  28.07 
 
 
202 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.805647  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>