123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0006 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 240 aa  472  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  62.26 
 
 		 106 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  55.65 
 
 		 162 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  51.43 
 
 		 132 aa  98.6  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  38.82 
 
 		 189 aa  88.2  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  45.53 
 
 		 145 aa  87.4  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  52.22 
 
 		 149 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0068  ribonuclease P protein component  35.78 
 
 		 242 aa  85.1  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190277  decreased coverage  0.00398675 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  44.62 
 
 		 137 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  48.08 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  48.08 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  58.21 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0641  ribonuclease P protein component  38.26 
 
 		 148 aa  68.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244598  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0439  hypothetical protein  42.06 
 
 		 119 aa  67.8  0.0000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00442765  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0356  ribonuclease P protein component  50.96 
 
 		 116 aa  67.8  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274871  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0584  hypothetical protein  41.67 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000877288  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  37.29 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  37.1 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  40.57 
 
 		 113 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  38.1 
 
 		 150 aa  64.7  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  41.74 
 
 		 122 aa  64.3  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  35.92 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  36.28 
 
 		 130 aa  61.6  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  35.92 
 
 		 145 aa  61.2  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  36.29 
 
 		 116 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  37.17 
 
 		 133 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0375  ribonuclease P  45.83 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.174091  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  44.29 
 
 		 110 aa  57.8  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  49.33 
 
 		 119 aa  58.2  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5080  ribonuclease P protein component  36.45 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.479331 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  37.37 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  41.11 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  42.65 
 
 		 111 aa  54.3  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3075  ribonuclease P protein  43.4 
 
 		 111 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  27.06 
 
 		 109 aa  53.5  0.000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  38.95 
 
 		 132 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  40.28 
 
 		 115 aa  53.1  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  36.14 
 
 		 121 aa  52.8  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  41.43 
 
 		 119 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  41.43 
 
 		 119 aa  52.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  41.43 
 
 		 119 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  41.43 
 
 		 119 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  41.43 
 
 		 119 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  41.43 
 
 		 115 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  35.16 
 
 		 116 aa  52.4  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  41.43 
 
 		 115 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3704  ribonuclease P protein component  45.1 
 
 		 111 aa  52  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  45.45 
 
 		 114 aa  52  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  34.62 
 
 		 118 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  34.62 
 
 		 118 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  34.62 
 
 		 118 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  41.43 
 
 		 115 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 		 130 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38050  ribonuclease P protein component  39.53 
 
 		 91 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1922  ribonuclease P protein component  39.81 
 
 		 187 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.239501  normal  0.549748 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  40 
 
 		 115 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  40 
 
 		 115 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  43.06 
 
 		 136 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  44.62 
 
 		 147 aa  49.7  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  39.73 
 
 		 115 aa  49.3  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  34.91 
 
 		 129 aa  49.3  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  37.31 
 
 		 120 aa  49.3  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  40.3 
 
 		 116 aa  49.3  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  40.3 
 
 		 116 aa  49.3  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3729  ribonuclease P protein component  46.05 
 
 		 112 aa  49.3  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  41.76 
 
 		 116 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  37.66 
 
 		 227 aa  48.9  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  42.86 
 
 		 116 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0684  ribonuclease P protein component  38.6 
 
 		 113 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.820887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  35.96 
 
 		 93 aa  48.5  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4622  ribonuclease P  36.36 
 
 		 134 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7325  ribonuclease P protein component  41.18 
 
 		 136 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  41.18 
 
 		 121 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4486  ribonuclease P protein component  42.05 
 
 		 132 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000175876  hitchhiker  0.00000000129187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5376  ribonuclease P protein  33.64 
 
 		 141 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827192  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5745  ribonuclease P  35.96 
 
 		 133 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936025  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  35.85 
 
 		 124 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  36 
 
 		 117 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  36 
 
 		 117 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0637  ribonuclease P protein component  35.96 
 
 		 113 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150092  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  41.76 
 
 		 116 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7099  ribonuclease P protein  41.67 
 
 		 81 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  37.31 
 
 		 109 aa  47  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  40 
 
 		 159 aa  47  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  38.46 
 
 		 117 aa  47  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1362  ribonuclease P  35.9 
 
 		 141 aa  47  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  32.77 
 
 		 131 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  34.41 
 
 		 115 aa  46.2  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  39.13 
 
 		 123 aa  46.6  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5614  ribonuclease P protein component  34.83 
 
 		 133 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  35.85 
 
 		 119 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0300  ribonuclease P protein component  45.24 
 
 		 134 aa  46.2  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5136  ribonuclease P  34.83 
 
 		 133 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6486  ribonuclease P protein  44.74 
 
 		 89 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00207284  normal  0.0833987 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  44.44 
 
 		 135 aa  45.4  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0857  ribonuclease P protein component  31.4 
 
 		 113 aa  45.4  0.0008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  36.67 
 
 		 113 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  37.31 
 
 		 117 aa  44.7  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13958  ribonuclease P  35.71 
 
 		 125 aa  45.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0001  ribonuclease P  35.96 
 
 		 134 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>