More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_R0035 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_R0035  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.84698e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0022  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.59989e-13  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0047  tRNA-Met  98.61 
 
 
74 bp  135  2e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182581 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14980  tRNA-Met  97.33 
 
 
77 bp  133  6e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.014365  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19050  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0024  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0023  tRNA-Met  97.22 
 
 
77 bp  127  4e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0020  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0013  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0557998  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0013  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.0245771 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0020  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0030  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0068  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  2e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0013  tRNA-Met  95.83 
 
 
77 bp  119  1e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0374183  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0042  tRNA-Met  95.83 
 
 
77 bp  119  1e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101529  hitchhiker  2.13655e-06 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0026  tRNA-Met  95.83 
 
 
77 bp  119  1e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19530  tRNA-Met  95.83 
 
 
77 bp  119  1e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241373  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13960  tRNA-Met  94.74 
 
 
77 bp  119  1e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0015  tRNA-Met  95.83 
 
 
74 bp  119  1e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.74865  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2751  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  4.74519e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2750  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.88112e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tMet01  tRNA-Met  93.51 
 
 
80 bp  113  6e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2747  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.77551e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0069  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0171  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.61498e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0077  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0040  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.51493e-05  hitchhiker  0.0001025 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0020  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0041  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000296842  normal  0.054295 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3184  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0043  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.399945  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5807  tRNA-Met  93.51 
 
 
79 bp  113  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00231597  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0039  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00627079  hitchhiker  3.21051e-05 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0027  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0054  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0094  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19946  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0020  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.152661  normal  0.0163497 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0021  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.097858  normal  0.0168782 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0282  tRNA-Met  93.51 
 
 
79 bp  113  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t022  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4773  tRNA-Met  93.51 
 
 
79 bp  113  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  6.65438e-06  hitchhiker  6.54659e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0306  tRNA-Met  93.51 
 
 
79 bp  113  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0604  tRNA-Met  93.51 
 
 
79 bp  113  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  9.69852e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5737  tRNA-Met  93.51 
 
 
79 bp  113  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.12746e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5710  tRNA-Met  93.51 
 
 
79 bp  113  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  9.1391e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5678  tRNA-Met  93.51 
 
 
79 bp  113  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5667  tRNA-Met  93.51 
 
 
79 bp  113  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  8.79492e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0096  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0052  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0858392  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0529  tRNA-Met  93.51 
 
 
79 bp  113  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.17979e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0865  tRNA-Met  93.51 
 
 
79 bp  113  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.13952e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0005  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.098649 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0057  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0078  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  6.12862e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0105  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0093247  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0127  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00272429  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0027  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0686525  normal  0.260083 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0026  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0368817  normal  0.25242 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0113  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000187631  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0076  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0262196  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0056  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4991  tRNA-Met  93.51 
 
 
79 bp  113  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5022  tRNA-Met  93.51 
 
 
79 bp  113  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00192595  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0011  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089204  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-2  tRNA-Met  93.51 
 
 
80 bp  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0383767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-3  tRNA-Met  93.51 
 
 
80 bp  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000267735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-5  tRNA-Met  93.51 
 
 
80 bp  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  5.20832e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-8  tRNA-Met  93.51 
 
 
80 bp  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt41  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt41  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0790  tRNA-Met  93.51 
 
 
79 bp  113  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3991e-32 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna116  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  4.57869e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna073  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  4.72118e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna069  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  3.97196e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-6  tRNA-Met  93.51 
 
 
80 bp  113  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.255e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-5  tRNA-Met  93.51 
 
 
80 bp  113  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.996221  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-4  tRNA-Met  93.51 
 
 
80 bp  113  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03940  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5667  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5675  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  3.76256e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5699  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  3.50684e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5720  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0159176  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0050  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-2  tRNA-Met  93.51 
 
 
80 bp  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0182265  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-4  tRNA-Met  93.51 
 
 
80 bp  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00179817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-7  tRNA-Met  93.51 
 
 
80 bp  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-3  tRNA-Met  93.51 
 
 
80 bp  113  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00436106  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna067  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  4.91703e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-4  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  7.68608e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0023  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205789  normal  0.0373381 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0019  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0746  tRNA-Met  94.81 
 
 
76 bp  113  6e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0073  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0010  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00010521  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0042  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0022  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136375  normal  0.0369046 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna065  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  5.22671e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0080  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00406069  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-2  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.527253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>