37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_R0010 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_R0010  tRNA-Tyr  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000653583  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0020  tRNA-Tyr  88.89 
 
 		 88 bp  60  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000168001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0051  tRNA-Tyr  88.89 
 
 		 88 bp  60  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0589159  unclonable  6.439e-24 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0013  tRNA-Tyr  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000521392  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0010  tRNA-Tyr  85.94 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00640732  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0027  tRNA-Tyr  86.11 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.645758  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0021  tRNA-Tyr  86.44 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0029  tRNA-Tyr  86.44 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0022  tRNA-Tyr  86.44 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.322461  normal  0.0145309 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0065  tRNA-Tyr  86.44 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.560905  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0023  tRNA-Tyr  86.44 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280598  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0029  tRNA-Tyr  86.44 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.572111  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0015  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000666826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna4  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0033  tRNA-Tyr  88.68 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90982  normal  0.487146 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0109  tRNA-Tyr  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0037  tRNA-Tyr  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.216376  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0047  tRNA-Tyr  85.71 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0727081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0046  tRNA-Tyr  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0100  tRNA-Tyr  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0058  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna049  tRNA-Tyr  85.07 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000729989  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna126  tRNA-Tyr  85.07 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna127  tRNA-Tyr  85.07 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000596133  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna128  tRNA-Tyr  85.07 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000522671  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0037  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000333812  normal  0.463641 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3207t  tRNA-Tyr  86.57 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0563071  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01443  tRNA-Tyr  85.07 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01442  tRNA-Tyr  85.07 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01441  tRNA-Tyr  85.07 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01440  tRNA-Tyr  85.07 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00236  tRNA-Tyr  85.07 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0043  tRNA-Tyr  84.75 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0206397  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0054  tRNA-Tyr  83.87 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000756603  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0054  tRNA-Tyr  83.87 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000219013  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0062  tRNA-Tyr  85.71 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.101175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0011  tRNA-Tyr  85.71 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>