More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1765 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  100 
 
 		 207 aa  424  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  51.44 
 
 		 214 aa  238  4e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  53.43 
 
 		 213 aa  238  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  51.71 
 
 		 211 aa  226  1e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  51.71 
 
 		 211 aa  226  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  51.71 
 
 		 211 aa  226  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  50.24 
 
 		 213 aa  226  2e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  52.68 
 
 		 210 aa  225  3e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  51.03 
 
 		 200 aa  220  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  52.2 
 
 		 222 aa  218  3.9999999999999997e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  48.06 
 
 		 210 aa  210  1e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  38.81 
 
 		 221 aa  175  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  38.58 
 
 		 246 aa  174  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  41.06 
 
 		 248 aa  174  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  44.93 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  39.3 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  40.2 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  38.81 
 
 		 243 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  36.97 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  39.81 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5185  carbonic anhydrase  40.19 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.239383 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  38.81 
 
 		 242 aa  167  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  38.16 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  40.5 
 
 		 228 aa  165  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  42.13 
 
 		 225 aa  165  4e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  38.1 
 
 		 224 aa  164  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  42.57 
 
 		 267 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  37.31 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  42.57 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  36.82 
 
 		 239 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  40.82 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  39 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  36.82 
 
 		 239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  36.82 
 
 		 239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  38.73 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  40.69 
 
 		 233 aa  161  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3284  Carbonate dehydratase  37.5 
 
 		 227 aa  161  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  40.61 
 
 		 356 aa  160  9e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  39.8 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  36.23 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  34.15 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3371  carbonate dehydratase  39.3 
 
 		 219 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  39.3 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  39.3 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  36.27 
 
 		 216 aa  158  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  38.28 
 
 		 219 aa  157  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  38.28 
 
 		 219 aa  157  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2465  carbonic anhydrase  38.28 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3322  carbonic anhydrases  38.28 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1244  carbonic anhydrases  38.28 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858637  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0384  carbonic anhydrases  38.28 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  36.49 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  37.81 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  34.83 
 
 		 219 aa  154  7e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  34.83 
 
 		 219 aa  154  7e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  34.83 
 
 		 219 aa  154  7e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  34.83 
 
 		 219 aa  154  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  34.83 
 
 		 219 aa  154  7e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  34.83 
 
 		 219 aa  154  7e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4366  carbonate dehydratase  38.92 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4235  Carbonate dehydratase  37.86 
 
 		 213 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200227 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2289  carbonate dehydratase  39.8 
 
 		 221 aa  152  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  36.28 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  35.29 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  36.32 
 
 		 244 aa  152  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  37.44 
 
 		 217 aa  151  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  40.4 
 
 		 278 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3267  Carbonate dehydratase  34.33 
 
 		 219 aa  151  8e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3235  carbonate dehydratase  35.64 
 
 		 220 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  35.47 
 
 		 234 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  33.98 
 
 		 210 aa  150  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  37.44 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  34.83 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3608  Carbonate dehydratase  39.8 
 
 		 284 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.418746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5353  Carbonate dehydratase  35.78 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.599954 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  35.78 
 
 		 219 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  35.82 
 
 		 235 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1074  carbonate dehydratase  38.94 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.370997  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  35.68 
 
 		 219 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  35.68 
 
 		 219 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  35.32 
 
 		 211 aa  149  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0666  carbonate dehydratase  34.95 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  35.68 
 
 		 219 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2146  Carbonate dehydratase  35.61 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  33.33 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6589  carbonate dehydratase  37.07 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.022636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  37.06 
 
 		 272 aa  149  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6632  carbonate dehydratase  37.13 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  35.64 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  36.1 
 
 		 258 aa  148  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  37.24 
 
 		 231 aa  148  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3911  Carbonate dehydratase  36.23 
 
 		 213 aa  148  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  37.07 
 
 		 211 aa  148  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  33.01 
 
 		 211 aa  147  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  38.46 
 
 		 234 aa  147  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1256  carbonate dehydratase  35.29 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  35.61 
 
 		 251 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4148  carbonate dehydratase  35.44 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  35.82 
 
 		 211 aa  145  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  38.46 
 
 		 787 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0652695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>