More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1730 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1730  30S ribosomal protein S9  100 
 
 
142 aa  289  1e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000261544  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1006  30S ribosomal protein S9  53.19 
 
 
146 aa  155  2e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000743986  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  54.26 
 
 
160 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0821  30S ribosomal protein S9  48.55 
 
 
149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.766995  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1018  30S ribosomal protein S9  47.86 
 
 
152 aa  133  7.000000000000001e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  50.76 
 
 
130 aa  131  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  53.49 
 
 
160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  53.49 
 
 
160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0244  30S ribosomal protein S9  48.53 
 
 
165 aa  130  6.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1384  30S ribosomal protein S9  53.49 
 
 
161 aa  130  9e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2970  30S ribosomal protein S9  51.94 
 
 
159 aa  130  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0570988  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_002978  WD0066  30S ribosomal protein S9  48.95 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  48.87 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2425  30S ribosomal protein S9  52.71 
 
 
164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  52.71 
 
 
164 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3025  30S ribosomal protein S9  50.36 
 
 
157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  49.24 
 
 
129 aa  127  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  49.64 
 
 
158 aa  127  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  49.24 
 
 
129 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  48.91 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  47.45 
 
 
180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0562  SSU ribosomal protein S9P  49.24 
 
 
131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000134066  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4594  30S ribosomal protein S9  50.36 
 
 
188 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1234  30S ribosomal protein S9  48.18 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745621  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1321  30S ribosomal protein S9  48.18 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243338  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  48.85 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0790  30S ribosomal protein S9  46.72 
 
 
158 aa  124  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552498  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0786  30S ribosomal protein S9  46.72 
 
 
158 aa  124  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.637937  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2496  30S ribosomal protein S9  46.72 
 
 
158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1163  30S ribosomal protein S9  48.18 
 
 
160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.456788  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0861  30S ribosomal protein S9  48.18 
 
 
155 aa  124  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0415089  normal  0.103809 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2249  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 
163 aa  123  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2672  30S ribosomal protein S9  46.04 
 
 
158 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569835  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  46.04 
 
 
160 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1681  30S ribosomal protein S9  46.72 
 
 
155 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00362695  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0902  30S ribosomal protein S9  45.99 
 
 
161 aa  122  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.829966  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  48.09 
 
 
130 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2708  30S ribosomal protein S9  44.6 
 
 
158 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421371  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  48.46 
 
 
130 aa  121  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  49.24 
 
 
130 aa  121  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1422  30S ribosomal protein S9  46.04 
 
 
158 aa  120  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2454  30S ribosomal protein S9  45.32 
 
 
158 aa  121  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0141  30S ribosomal protein S9  51.13 
 
 
130 aa  120  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4591  30S ribosomal protein S9  45.26 
 
 
160 aa  120  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  47.29 
 
 
130 aa  120  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  47.37 
 
 
130 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  42.42 
 
 
130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  46.62 
 
 
130 aa  118  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4345  30S ribosomal protein S9  45.26 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59912  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  49.23 
 
 
130 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  45.26 
 
 
162 aa  117  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  47.37 
 
 
130 aa  117  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1513  SSU ribosomal protein S9P  45.26 
 
 
165 aa  117  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.472306 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  46.92 
 
 
130 aa  116  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  43.94 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  46.62 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  46.62 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  46.62 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  46.62 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  46.62 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  46.62 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2697  30S ribosomal protein S9  43.8 
 
 
161 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145825  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  45.74 
 
 
130 aa  115  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  46.62 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  48.87 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf385  30S ribosomal protein S9  48.12 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0579956  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0746  ribosomal protein S9  50.38 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0839  ribosomal protein S9  41.18 
 
 
145 aa  115  3e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  48.82 
 
 
130 aa  114  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  45.86 
 
 
130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  49.23 
 
 
130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  46.21 
 
 
131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  43.07 
 
 
159 aa  114  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  44.53 
 
 
159 aa  113  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  45.86 
 
 
130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  45.86 
 
 
130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0945  ribosomal protein S9  48.84 
 
 
130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000533623  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  49.62 
 
 
130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  45.86 
 
 
130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  45.86 
 
 
130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  45.45 
 
 
130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  45.86 
 
 
130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  43.07 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  43.07 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  49.23 
 
 
130 aa  111  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  44.27 
 
 
130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  44.53 
 
 
162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  44.27 
 
 
130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  44.27 
 
 
130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  42.34 
 
 
161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  48.41 
 
 
133 aa  110  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  45.38 
 
 
130 aa  110  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  43.51 
 
 
131 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44376  Putative mitochondrial ribosomal protein S9  45.74 
 
 
137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.272268  normal  0.0615746 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  43.07 
 
 
162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  42.34 
 
 
161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  47.37 
 
 
131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  42.86 
 
 
130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1668  ribosomal protein S9  47.29 
 
 
130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000154129  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  44.62 
 
 
130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>