More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1672 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  100 
 
 		 77 aa  149  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  74.67 
 
 		 77 aa  115  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  71.23 
 
 		 78 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  68.49 
 
 		 78 aa  107  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1852  acyl carrier protein  68.42 
 
 		 76 aa  104  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2430  acyl carrier protein  68.42 
 
 		 76 aa  102  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000123335  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  69.44 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  68.92 
 
 		 81 aa  102  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  64.94 
 
 		 77 aa  103  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  68.06 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 78 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 76 aa  101  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  67.12 
 
 		 82 aa  100  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 78 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  64 
 
 		 79 aa  100  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  66.67 
 
 		 78 aa  100  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  64.86 
 
 		 79 aa  100  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  64.86 
 
 		 79 aa  100  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 78 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  64.86 
 
 		 79 aa  100  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  64.86 
 
 		 79 aa  100  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3099  acyl carrier protein  64.47 
 
 		 76 aa  100  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179771 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  62.67 
 
 		 78 aa  100  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1648  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 80 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00355954  normal  0.46932 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 83 aa  99.4  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  68.06 
 
 		 78 aa  99.4  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  64.86 
 
 		 79 aa  99.8  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  65.28 
 
 		 79 aa  99.8  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  64.86 
 
 		 81 aa  98.6  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  64.79 
 
 		 78 aa  99  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  68.57 
 
 		 73 aa  99  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0975  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 80 aa  99.4  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.553759  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  64.86 
 
 		 79 aa  98.6  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3788  acyl carrier protein  65 
 
 		 87 aa  98.6  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 77 aa  99  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 82 aa  98.6  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01090  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 78 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000166866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2553  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 78 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2507  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 78 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996587  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3831  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 78 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1266  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 78 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000383773  normal  0.0632427 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1310  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 78 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000174722  decreased coverage  4.37915e-18 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  68.06 
 
 		 79 aa  98.2  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01098  hypothetical protein  61.84 
 
 		 78 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000144532  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  63.51 
 
 		 79 aa  98.6  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1990  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 78 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1215  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 78 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000103813  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1216  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 78 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.59624e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1295  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 78 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000656136  decreased coverage  3.5580799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1473  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 78 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000839248  hitchhiker  0.00000000000000262365 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2230  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 78 aa  98.6  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.78439e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  63.51 
 
 		 79 aa  98.6  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2033  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 78 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.00000256014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2173  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 78 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000401427  hitchhiker  0.000000000000202194 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 79 aa  97.8  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 79 aa  97.8  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 79 aa  98.2  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  63.51 
 
 		 79 aa  97.8  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 78 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  66.2 
 
 		 77 aa  97.8  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  62.67 
 
 		 79 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0066  acyl carrier protein  62.67 
 
 		 76 aa  97.4  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  62.67 
 
 		 79 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  62.67 
 
 		 79 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  62.67 
 
 		 78 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  62.67 
 
 		 78 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3105  acyl carrier protein  64.79 
 
 		 77 aa  97.4  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000128081  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 78 aa  97.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 77 aa  97.4  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  64.79 
 
 		 77 aa  97.4  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0436  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 76 aa  97.4  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.20002  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4156  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 78 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.035668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3460  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 81 aa  97.1  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  67.14 
 
 		 77 aa  97.1  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  62.67 
 
 		 77 aa  97.1  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 79 aa  97.1  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 79 aa  97.1  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 79 aa  97.1  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 79 aa  97.1  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 79 aa  97.1  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 79 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 79 aa  97.1  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 79 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 79 aa  97.1  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 79 aa  97.1  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  70 
 
 		 77 aa  97.1  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 78 aa  97.1  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 79 aa  97.1  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 79 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 79 aa  97.1  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 79 aa  97.1  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 79 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 79 aa  97.1  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 79 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 79 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 79 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1873  acyl carrier protein  64.29 
 
 		 78 aa  97.1  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  62.67 
 
 		 77 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  64.79 
 
 		 77 aa  96.7  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1090  acyl carrier protein  63.38 
 
 		 77 aa  96.7  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.343466  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>