140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1669 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  37.33 
 
 		 1132 aa  709    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  42.59 
 
 		 1154 aa  798    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  100 
 
 		 1209 aa  2457    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  42.62 
 
 		 1177 aa  718    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  37 
 
 		 1338 aa  614  9.999999999999999e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  32.88 
 
 		 1076 aa  537  1e-151  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  32.8 
 
 		 1120 aa  478  1e-133  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  34.88 
 
 		 1039 aa  420  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  33.13 
 
 		 1244 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  31.2 
 
 		 1257 aa  385  1e-105  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  27.84 
 
 		 1147 aa  331  7e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  29.85 
 
 		 995 aa  310  8e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  29.55 
 
 		 1426 aa  278  4e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1299 aa  269  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  33.73 
 
 		 1159 aa  239  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  27.53 
 
 		 1036 aa  222  3e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1178 aa  214  7.999999999999999e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  30.04 
 
 		 974 aa  200  2.0000000000000003e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  24.62 
 
 		 1252 aa  186  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  25.33 
 
 		 1256 aa  184  9.000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  23.59 
 
 		 1210 aa  166  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  23.25 
 
 		 1184 aa  160  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  22.14 
 
 		 1170 aa  152  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  23.4 
 
 		 1432 aa  144  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1298 aa  141  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  24.15 
 
 		 1058 aa  141  8.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  27.37 
 
 		 1089 aa  139  5e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1104 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.24 
 
 		 1194 aa  128  7e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  26.46 
 
 		 410 aa  125  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3411  type II restriction-modification enzyme  32.85 
 
 		 247 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  25.42 
 
 		 1088 aa  110  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  24.45 
 
 		 1612 aa  98.2  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  23.95 
 
 		 1020 aa  98.2  8e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  26.22 
 
 		 404 aa  95.1  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  23.89 
 
 		 562 aa  93.6  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  22.6 
 
 		 518 aa  90.9  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  28.01 
 
 		 1186 aa  86.3  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  21.65 
 
 		 950 aa  85.5  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  20.13 
 
 		 882 aa  82  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  22.46 
 
 		 629 aa  79.7  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  27.43 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  23.62 
 
 		 557 aa  79.3  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  25.43 
 
 		 838 aa  79  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1338 aa  77.4  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  22.61 
 
 		 1339 aa  76.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  22.61 
 
 		 1339 aa  76.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  26.19 
 
 		 1277 aa  74.3  0.00000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  31.65 
 
 		 694 aa  73.9  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  25.82 
 
 		 652 aa  72  0.00000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  23.47 
 
 		 1125 aa  71.2  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  29.91 
 
 		 1278 aa  70.5  0.0000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  22.42 
 
 		 836 aa  69.7  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  31.71 
 
 		 423 aa  70.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1339 aa  68.9  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1333 aa  67  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1422 aa  65.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  21.39 
 
 		 1241 aa  65.1  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0004  type II DNA modification methyltransferase  22.71 
 
 		 570 aa  64.3  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.606152  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  22.43 
 
 		 1209 aa  63.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  26.57 
 
 		 1318 aa  63.2  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  23.22 
 
 		 1189 aa  63.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  22.29 
 
 		 1347 aa  62.4  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  23.27 
 
 		 1336 aa  62.4  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  22.24 
 
 		 1098 aa  62.4  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  21.22 
 
 		 493 aa  61.6  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  24.38 
 
 		 1319 aa  61.6  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  26.55 
 
 		 1751 aa  60.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  24.91 
 
 		 1441 aa  60.1  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  26.22 
 
 		 1332 aa  60.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  20.85 
 
 		 1324 aa  60.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  22.56 
 
 		 1343 aa  59.7  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  31.45 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  42.11 
 
 		 466 aa  58.5  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1459 aa  58.5  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  26.05 
 
 		 1709 aa  57.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  22.15 
 
 		 1180 aa  57.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  26.99 
 
 		 522 aa  57  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  23.02 
 
 		 1373 aa  57.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  21.54 
 
 		 1243 aa  57.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  22.15 
 
 		 1321 aa  56.2  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  21.18 
 
 		 1353 aa  56.6  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  24.08 
 
 		 1358 aa  55.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  28.4 
 
 		 504 aa  55.5  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  27.13 
 
 		 595 aa  55.5  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  21.32 
 
 		 1222 aa  54.3  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  22.03 
 
 		 1354 aa  54.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  20.48 
 
 		 1195 aa  54.3  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1609  hypothetical protein  26.19 
 
 		 521 aa  54.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.160321  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  25.6 
 
 		 1338 aa  53.5  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  23 
 
 		 1205 aa  54.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1282 aa  53.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  21.74 
 
 		 1306 aa  53.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  21.07 
 
 		 1322 aa  52.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1363 aa  52.4  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  30.39 
 
 		 1131 aa  52.4  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  25.98 
 
 		 523 aa  52.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  20.36 
 
 		 1425 aa  52.4  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  24.72 
 
 		 1250 aa  52  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  24.16 
 
 		 1250 aa  52  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>