296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1632 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1632  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 
257 aa  485  1e-136  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  32.32 
 
 
264 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  30.97 
 
 
264 aa  115  7e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  31.02 
 
 
265 aa  112  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  30.09 
 
 
264 aa  110  2e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  29.63 
 
 
261 aa  109  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  28.69 
 
 
261 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  29.08 
 
 
261 aa  105  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  27.2 
 
 
259 aa  104  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  30.2 
 
 
253 aa  101  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0657  type III secretion system inner membrane R protein  34.92 
 
 
258 aa  100  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  31.67 
 
 
257 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0373  flagellar biosynthetic fliR transmembrane protein  29.11 
 
 
262 aa  98.6  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4759  flagellar biosynthetic protein FliR  28.14 
 
 
262 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0696365  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3682  flagellar biosynthetic protein FliR  28.14 
 
 
262 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0756404  normal  0.879793 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  28.57 
 
 
261 aa  96.7  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  26.58 
 
 
261 aa  95.9  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  24.64 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0850  flagellar biosynthetic protein FliR  28.46 
 
 
254 aa  94  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  27.91 
 
 
253 aa  94  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  28.95 
 
 
255 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4407  flagellar biosynthesis protein FliR  31.08 
 
 
255 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605024  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  28.77 
 
 
265 aa  92.4  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0017  flagellar biosynthetic protein FliR  31.8 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0289665  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  29.33 
 
 
255 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0017  flagellar biosynthetic protein FliR  31.8 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  28.1 
 
 
261 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  29.91 
 
 
255 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  27.6 
 
 
255 aa  90.9  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  3.89137e-10  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1396  flagellar biosynthesis protein FliR  29.91 
 
 
256 aa  90.1  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401205  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  27.43 
 
 
255 aa  90.1  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  30 
 
 
255 aa  89.4  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  27.07 
 
 
258 aa  89.4  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  28.26 
 
 
256 aa  89.4  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  27.1 
 
 
255 aa  89  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  29.63 
 
 
260 aa  89  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0215  flagellar biosynthetic protein FliR  26.27 
 
 
260 aa  88.6  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598232  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  28.05 
 
 
256 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  26.94 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  28.57 
 
 
261 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1383  flagellar biosynthesis protein FliR  26.67 
 
 
251 aa  87.8  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588943  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  28.38 
 
 
260 aa  88.6  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1128  flagellar biosynthesis protein FliR  29.49 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  27.85 
 
 
259 aa  87.8  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2031  type III secretion system inner membrane R protein  25.6 
 
 
255 aa  87  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  30.27 
 
 
265 aa  86.3  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  27.36 
 
 
263 aa  85.5  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  29.87 
 
 
259 aa  84.7  1e-15  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  26.64 
 
 
261 aa  84.7  1e-15  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  27.69 
 
 
240 aa  85.1  1e-15  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  23.56 
 
 
257 aa  84  2e-15  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0085  flagellar biosynthetic protein FliR  27.19 
 
 
257 aa  84.3  2e-15  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  26.91 
 
 
263 aa  83.6  3e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31040  flagellar biosynthetic protein FliR  28.7 
 
 
252 aa  83.6  3e-15  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  27.1 
 
 
264 aa  82.8  5e-15  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  28.3 
 
 
261 aa  82.4  7e-15  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  24 
 
 
254 aa  82  9e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  28.25 
 
 
260 aa  82  9e-15  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  27.96 
 
 
257 aa  81.3  1e-14  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  27.27 
 
 
253 aa  81.6  1e-14  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1258  flagellar biosynthesis protein FliR  27.23 
 
 
253 aa  81.6  1e-14  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0798452  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1675  flagellar biosynthesis protein FliR  28.29 
 
 
260 aa  81.6  1e-14  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  28.7 
 
 
261 aa  80.5  2e-14  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  28.31 
 
 
260 aa  81.3  2e-14  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  26.67 
 
 
258 aa  80.5  3e-14  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  27.11 
 
 
254 aa  79.7  4e-14  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0577  flagellar biosynthesis protein  26.84 
 
 
256 aa  79.3  5e-14  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778054  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  27.85 
 
 
259 aa  79.3  6e-14  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24110  flagellar biosynthetic protein  25.74 
 
 
264 aa  78.6  9e-14  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  26.97 
 
 
258 aa  78.6  9e-14  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  26.42 
 
 
260 aa  78.6  9e-14  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  26.17 
 
 
253 aa  78.6  1e-13  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2009  flagellar biosynthetic protein FliR  29.44 
 
 
253 aa  78.6  1e-13  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  26.89 
 
 
265 aa  77.4  2e-13  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  24.38 
 
 
261 aa  77.4  2e-13  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1091  flagellar biosynthesis protein FliR  29.63 
 
 
256 aa  76.3  4e-13  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  22.73 
 
 
250 aa  76.3  5e-13  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  22.78 
 
 
258 aa  76.3  5e-13  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2574  flagellar biosynthesis protein FliR  29.41 
 
 
253 aa  76.3  5e-13  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0553295 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  24.29 
 
 
261 aa  76.3  5e-13  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2260  type III secretion system inner membrane R protein  25.66 
 
 
239 aa  75.9  6e-13  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  29.11 
 
 
262 aa  75.9  6e-13  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00968  flagellar biosynthetic protein FliR  26.7 
 
 
257 aa  75.9  7e-13  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0109707  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06198  flagellar biosynthetic protein FliR  26.7 
 
 
257 aa  75.9  7e-13  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.305081  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2604  flagellar biosynthetic protein FliR  26.97 
 
 
258 aa  74.7  1e-12  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.406904 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2130  type III secretion system inner membrane R protein  27.95 
 
 
259 aa  75.1  1e-12  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  26.54 
 
 
247 aa  73.9  2e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  27.23 
 
 
260 aa  73.9  2e-12  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  27.36 
 
 
267 aa  74.3  2e-12  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0961  type III secretion system inner membrane R protein  26.09 
 
 
255 aa  74.3  2e-12  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3442  putative flagellar biosynthetic protein FliR  23.5 
 
 
253 aa  73.9  2e-12  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0547  flagellar biosynthesis protein FliR  26.84 
 
 
253 aa  74.3  2e-12  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00458922  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0065  flagellar protein FliR  25.5 
 
 
269 aa  73.6  3e-12  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  20.59 
 
 
266 aa  73.6  3e-12  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1700  flagellar biosynthetic protein FliR  25.5 
 
 
269 aa  73.6  3e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  1.23329e-05 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  25.79 
 
 
256 aa  73.2  4e-12  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5073  type III secretion apparatus protein SpaR/YscT/HrcT  29.94 
 
 
258 aa  72.8  5e-12  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal  0.0268532 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  23.67 
 
 
260 aa  72.8  5e-12  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0773  flagellar biosynthesis protein FliR  25 
 
 
250 aa  72.8  5e-12  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  25.93 
 
 
260 aa  72.8  5e-12  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>