More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1613 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 346 aa  685    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0791  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.99 
 
 		 373 aa  179  8e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0747  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.83 
 
 		 405 aa  129  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0830  cation eflux system protein  26.3 
 
 		 368 aa  120  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0187806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  26.92 
 
 		 398 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.65 
 
 		 359 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00335506  normal  0.0890337 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  25.96 
 
 		 399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  28.03 
 
 		 423 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  26.86 
 
 		 418 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.19 
 
 		 397 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  28.44 
 
 		 410 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0322  RND family efflux transporter MFP subunit  24.14 
 
 		 353 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619651 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2732  RND family efflux transporter MFP subunit  27.89 
 
 		 361 aa  106  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844309  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.01 
 
 		 377 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4294  RND family efflux transporter MFP subunit  26.15 
 
 		 361 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0772  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.8 
 
 		 353 aa  103  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000602446  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  27.39 
 
 		 424 aa  102  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2746  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.29 
 
 		 366 aa  102  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.28 
 
 		 376 aa  102  9e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.54 
 
 		 427 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.74 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.12 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0579  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.96 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.087454  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3837  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmvB  24.93 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3502  secretion protein HlyD  27.24 
 
 		 402 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0531156  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  27.65 
 
 		 350 aa  99.8  6e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2567  secretion protein HlyD  26.85 
 
 		 401 aa  99.8  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.06 
 
 		 428 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1144  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.05 
 
 		 368 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000422764  normal  0.160912 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01077  HlyD family secretion protein  24.5 
 
 		 376 aa  97.4  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1342  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.65 
 
 		 365 aa  97.4  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0293  secretion protein HlyD  25.57 
 
 		 514 aa  97.4  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287992  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2684  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.37 
 
 		 409 aa  97.4  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06450  putative lipoprotein  27.46 
 
 		 392 aa  97.4  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.617391  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0146  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.77 
 
 		 394 aa  97.4  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0918  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.23 
 
 		 366 aa  96.3  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2010  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.1 
 
 		 412 aa  95.9  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2279  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5381  RND family efflux transporter MFP subunit  23.82 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.996751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  23.91 
 
 		 379 aa  94.7  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.99 
 
 		 359 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0105666  normal  0.0985719 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  28.78 
 
 		 376 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  27.27 
 
 		 364 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1766  heavy metal efflux system protein, putative  26.74 
 
 		 376 aa  92.8  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02378  cation transporter transmembrane protein  25.86 
 
 		 382 aa  93.2  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1876  secretion protein HlyD  28.37 
 
 		 375 aa  92.8  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.748539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2229  RND family efflux transporter MFP subunit  27.44 
 
 		 405 aa  92.8  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  25.82 
 
 		 379 aa  92.4  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.1 
 
 		 459 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.77 
 
 		 360 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1549  RND family efflux transporter MFP subunit  21.66 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  24 
 
 		 380 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.1 
 
 		 353 aa  90.5  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  24.61 
 
 		 413 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.398677 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  26.22 
 
 		 411 aa  89.7  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0503  secretion protein HlyD  25.68 
 
 		 390 aa  89.7  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11688  cation efflux system protein  26.62 
 
 		 396 aa  89.7  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.600271  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0041  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.65 
 
 		 378 aa  89.7  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89791  normal  0.261432 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.65 
 
 		 372 aa  89  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0273609  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0152  secretion protein HlyD  23.08 
 
 		 382 aa  89  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  29.22 
 
 		 429 aa  89  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  26.95 
 
 		 384 aa  89  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1511  membrane-fusion protein  25.85 
 
 		 422 aa  89.4  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000121317  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  22.16 
 
 		 386 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0686  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.81 
 
 		 380 aa  87.8  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268178 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0175  hypothetical protein  26.73 
 
 		 380 aa  87  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.109936  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5714  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.13 
 
 		 420 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0039  RND family efflux transporter MFP subunit  25.89 
 
 		 403 aa  86.3  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1812  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.14 
 
 		 364 aa  85.9  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6772  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.66 
 
 		 424 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0514  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.09 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.770818  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  24.26 
 
 		 354 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  26.75 
 
 		 365 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.89 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.56 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1476  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.33 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142053  normal  0.195363 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1781  RND family efflux transporter MFP subunit  25.25 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.253325  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2808  membrane fusion protein; cation efflux system protein  27.86 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  25.89 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.53 
 
 		 361 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.52 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1281  RND family efflux transporter MFP subunit  23.58 
 
 		 386 aa  83.2  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3686  RND family efflux transporter MFP subunit  23.42 
 
 		 440 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.95 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000873754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.15 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0816  RND family efflux transporter MFP subunit  25.94 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  24.57 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2831  syringolide efflux protein SyfC  27.46 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.580145  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  25.07 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2220  RND family efflux transporter MFP subunit  25.72 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  25 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.54 
 
 		 358 aa  82  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0123174  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1483  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.09 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.377405 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.29 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2820  RND family efflux transporter MFP subunit  24.6 
 
 		 363 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  0.368522 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.87 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.37122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.02 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1001  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.92 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.612781  normal  0.0455845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2988  hypothetical protein  25.47 
 
 		 416 aa  80.9  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  27.41 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  27.41 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>