159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1596 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  100 
 
 		 339 aa  694    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  55.52 
 
 		 348 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  54.33 
 
 		 348 aa  395  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  55.79 
 
 		 347 aa  396  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  53.51 
 
 		 348 aa  393  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  54.73 
 
 		 352 aa  392  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  53.85 
 
 		 349 aa  390  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  52.49 
 
 		 350 aa  387  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  54.28 
 
 		 347 aa  387  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  52.49 
 
 		 349 aa  381  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  55.03 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  52.08 
 
 		 349 aa  371  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  51.18 
 
 		 346 aa  369  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  49.55 
 
 		 342 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  50.3 
 
 		 349 aa  342  5e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  47.6 
 
 		 353 aa  340  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  46.75 
 
 		 352 aa  337  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  50.74 
 
 		 624 aa  332  6e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  49.1 
 
 		 334 aa  330  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  47.79 
 
 		 640 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  46.55 
 
 		 639 aa  318  9e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  42.34 
 
 		 334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  42.35 
 
 		 343 aa  306  5.0000000000000004e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  43.23 
 
 		 365 aa  293  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  40.65 
 
 		 348 aa  290  3e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  43.58 
 
 		 631 aa  288  6e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  41.37 
 
 		 351 aa  282  6.000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  42.69 
 
 		 346 aa  275  7e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  36.19 
 
 		 370 aa  253  5.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  37.31 
 
 		 347 aa  252  8.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  37.31 
 
 		 346 aa  250  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  38.35 
 
 		 344 aa  250  3e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  35.19 
 
 		 358 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  35.31 
 
 		 341 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  36.95 
 
 		 357 aa  238  9e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  37.69 
 
 		 351 aa  238  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  36.42 
 
 		 355 aa  237  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  35.96 
 
 		 369 aa  237  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  36.8 
 
 		 327 aa  236  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  36.9 
 
 		 369 aa  236  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  37.57 
 
 		 356 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  36.8 
 
 		 342 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  35.61 
 
 		 344 aa  235  8e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  36.69 
 
 		 343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  36.69 
 
 		 343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  33.99 
 
 		 368 aa  233  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  35.52 
 
 		 367 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  37.69 
 
 		 343 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  35.86 
 
 		 341 aa  230  2e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  33.52 
 
 		 367 aa  231  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  36.76 
 
 		 340 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  34.75 
 
 		 364 aa  229  4e-59  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  33.24 
 
 		 367 aa  229  4e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  35.84 
 
 		 370 aa  229  5e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  32.69 
 
 		 372 aa  226  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  34.01 
 
 		 332 aa  226  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  32.96 
 
 		 370 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  32.77 
 
 		 370 aa  225  7e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  35.43 
 
 		 350 aa  225  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  36.2 
 
 		 342 aa  225  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  32.2 
 
 		 370 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  35.91 
 
 		 346 aa  224  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  32.49 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  32.2 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  34.55 
 
 		 368 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  35.31 
 
 		 386 aa  223  4e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  32.2 
 
 		 370 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  31.92 
 
 		 370 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  33.05 
 
 		 371 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  33.05 
 
 		 371 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  33.05 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3490  agmatine deiminase  39.94 
 
 		 348 aa  220  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  31.64 
 
 		 370 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.59 
 
 		 322 aa  220  3e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  34.45 
 
 		 371 aa  220  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1172  peptidyl-arginine deiminase family protein  37.88 
 
 		 325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  31.64 
 
 		 370 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0897  peptidyl-arginine deiminase family protein  40.18 
 
 		 325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  33.99 
 
 		 368 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  32.68 
 
 		 365 aa  218  7.999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  35.49 
 
 		 355 aa  218  8.999999999999998e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  32.96 
 
 		 365 aa  218  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  34.02 
 
 		 341 aa  217  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0842  peptidyl-arginine deiminase family protein  36.89 
 
 		 322 aa  217  2e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00603168  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0085  peptidyl-arginine deiminase family protein  35.17 
 
 		 348 aa  218  2e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.360574  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  34.17 
 
 		 368 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1755  agmatine deiminase  38.71 
 
 		 348 aa  216  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.807714  normal  0.973962 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  31.36 
 
 		 370 aa  216  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  33.8 
 
 		 374 aa  215  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3203  agmatine deiminase  38.42 
 
 		 348 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.659757  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  34.17 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  31.92 
 
 		 375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  34.27 
 
 		 368 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4219  Agmatine deiminase  34.88 
 
 		 340 aa  213  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1027  peptidyl-arginine deiminase family protein  38.67 
 
 		 325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  34.41 
 
 		 365 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0973  peptidyl-arginine deiminase family protein  38.18 
 
 		 325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4697  agmatine deiminase  35.01 
 
 		 336 aa  213  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.399563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0531  peptidyl-arginine deiminase  37.39 
 
 		 323 aa  212  7.999999999999999e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.709217  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  34.45 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>