More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1576 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  100 
 
 		 223 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  52.05 
 
 		 217 aa  236  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  52.51 
 
 		 226 aa  236  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  46.64 
 
 		 239 aa  231  9e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  50.23 
 
 		 235 aa  230  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  50.23 
 
 		 227 aa  229  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1250  putative ATP-binding component of a transport system  49.77 
 
 		 227 aa  229  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.40949e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 248 aa  223  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  48.85 
 
 		 227 aa  224  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  47.98 
 
 		 227 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  49.77 
 
 		 237 aa  222  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  46.15 
 
 		 230 aa  221  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  46.61 
 
 		 228 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  45.66 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3973  ABC transporter related protein  49.09 
 
 		 275 aa  219  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  48.65 
 
 		 240 aa  219  3e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.66 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  45.66 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  46.08 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  47.03 
 
 		 224 aa  218  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  47.06 
 
 		 230 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.66 
 
 		 233 aa  218  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.66 
 
 		 233 aa  218  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.66 
 
 		 233 aa  218  5e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.66 
 
 		 233 aa  218  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.66 
 
 		 233 aa  218  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.8 
 
 		 242 aa  218  6e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.8 
 
 		 242 aa  218  6e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  46.19 
 
 		 227 aa  218  6e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.33 
 
 		 238 aa  218  7e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0461  ABC transporter-related protein  49 
 
 		 227 aa  218  7e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.880159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.66 
 
 		 233 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  44.29 
 
 		 230 aa  218  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1061  ABC transporter related  53.47 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.691054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.75 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  46.58 
 
 		 256 aa  217  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08621  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  51.34 
 
 		 222 aa  217  1e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1692  ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.623229 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  43.89 
 
 		 244 aa  216  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  46.58 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2018  ABC transporter related  49.1 
 
 		 238 aa  216  2e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0341  ABC transporter related  49.1 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.09 
 
 		 230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  48.18 
 
 		 248 aa  215  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  48.18 
 
 		 248 aa  215  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.55 
 
 		 239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3016  ABC transporter related  46.36 
 
 		 227 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 		 227 aa  215  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8342  ABC transporter related  48.4 
 
 		 234 aa  215  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  48 
 
 		 228 aa  215  5e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.91 
 
 		 234 aa  214  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  48.4 
 
 		 234 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  48.4 
 
 		 234 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45 
 
 		 234 aa  214  5.9999999999999996e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.91 
 
 		 234 aa  214  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.91 
 
 		 234 aa  214  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  45.66 
 
 		 235 aa  214  7e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  44.75 
 
 		 230 aa  214  7e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0473  ABC transporter related  48.65 
 
 		 238 aa  214  8e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  48.2 
 
 		 231 aa  214  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  47.11 
 
 		 242 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  49.32 
 
 		 229 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3572  ABC transporter, ATPase subunit  49.48 
 
 		 201 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0982  ABC transporter related protein  47.95 
 
 		 220 aa  214  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.452379 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  48 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  45.66 
 
 		 229 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0238  ABC transporter related  48.6 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.145385 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1251  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.84 
 
 		 238 aa  213  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  50.23 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.21 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.21 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.21 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0425  ABC transporter related  51.76 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  49.77 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.21 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1739  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.95 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2735  ABC transporter related  48.18 
 
 		 223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.31749  normal  0.728727 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  47.73 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.21 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  44.75 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4456  ABC transporter related protein  46.82 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2200  ABC transporter-related protein  47.95 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  45.33 
 
 		 237 aa  212  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  47.03 
 
 		 223 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 221 aa  212  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  47.47 
 
 		 226 aa  212  2.9999999999999995e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2625  lipoprotein ABC transporter, ATP-binding protein LolD  50.75 
 
 		 224 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  46.33 
 
 		 287 aa  211  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.24 
 
 		 233 aa  211  4.9999999999999996e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  49.06 
 
 		 224 aa  211  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1796  ABC transporter related protein  48.84 
 
 		 229 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1034  ABC transporter related  46.58 
 
 		 232 aa  211  4.9999999999999996e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  47.22 
 
 		 242 aa  211  4.9999999999999996e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.84 
 
 		 236 aa  211  5.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  46.12 
 
 		 225 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  45.95 
 
 		 240 aa  211  7e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.14 
 
 		 237 aa  211  7e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  47.03 
 
 		 242 aa  211  7.999999999999999e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.24 
 
 		 233 aa  210  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.5 
 
 		 249 aa  210  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.658094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>