62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1562 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1562  PEGA domain protein  100 
 
 		 533 aa  1073    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00305043  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0086  PEGA domain-containing protein  30.73 
 
 		 456 aa  75.1  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.943488  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0086  PEGA domain-containing protein  30.21 
 
 		 456 aa  73.9  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061684  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0105  PEGA domain-containing protein  32.61 
 
 		 426 aa  73.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1237  PEGA domain protein  27.13 
 
 		 613 aa  70.5  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  28.06 
 
 		 684 aa  64.7  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0951  PEGA domain-containing protein  30.99 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.919574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1891  PEGA domain protein  28.36 
 
 		 460 aa  63.9  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0214  hypothetical protein  26.6 
 
 		 435 aa  63.2  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  27.36 
 
 		 1193 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0463  PEGA domain-containing protein  25.54 
 
 		 497 aa  60.5  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00383577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.32 
 
 		 677 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  28.5 
 
 		 561 aa  56.6  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.66 
 
 		 1481 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.5 
 
 		 1711 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.98 
 
 		 1686 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  24.09 
 
 		 1190 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  24.76 
 
 		 1523 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05850  conserved hypothetical protein  30.65 
 
 		 341 aa  54.7  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  27.51 
 
 		 1652 aa  54.3  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0111  PEGA domain protein  26.95 
 
 		 416 aa  54.3  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  28.26 
 
 		 1552 aa  53.9  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  23.04 
 
 		 1510 aa  53.9  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  26.48 
 
 		 1858 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5122  type IV pilus assembly PilZ  31.43 
 
 		 843 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0427193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  23.04 
 
 		 687 aa  50.8  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  28.44 
 
 		 750 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3597  PEGA domain protein  28.37 
 
 		 727 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.956327  normal  0.0137452 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.41 
 
 		 692 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  29.76 
 
 		 1348 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  26.36 
 
 		 1229 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1516  PEGA domain-containing protein  25 
 
 		 432 aa  48.5  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02997  Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I (eIF3i)(Eukaryotic translation initiation factor 3 39 kDa subunit homolog)(eIF-3 39 kDa subunit homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8Y3]  23.66 
 
 		 336 aa  47.8  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.322368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  21.72 
 
 		 1161 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  23.12 
 
 		 1367 aa  47.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  23.18 
 
 		 1553 aa  47.4  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0016  hypothetical protein  24.6 
 
 		 553 aa  47  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.697123  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  20.59 
 
 		 742 aa  46.2  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1818  PEGA domain protein  30.1 
 
 		 592 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.5 
 
 		 676 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.15 
 
 		 636 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  26.89 
 
 		 1657 aa  46.2  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0195  PEGA domain protein  24.82 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  32.86 
 
 		 1656 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  26.52 
 
 		 696 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  21.27 
 
 		 1161 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2758  hypothetical protein  29.09 
 
 		 546 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  19.54 
 
 		 1100 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.39 
 
 		 1557 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3001  PEGA  24.1 
 
 		 600 aa  45.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  25.26 
 
 		 947 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  21.48 
 
 		 1411 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  23.49 
 
 		 1454 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.65 
 
 		 1760 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1640  PEGA domain-containing protein  40.74 
 
 		 265 aa  44.3  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  28.32 
 
 		 540 aa  44.3  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  26.26 
 
 		 1213 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2682  serine/threonine protein kinase  32.62 
 
 		 752 aa  43.9  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03503  Secreted protein with uncharacterized domain  27.04 
 
 		 660 aa  43.9  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0261  PEGA domain-containing protein  38.33 
 
 		 266 aa  43.9  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00732448 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0483  PEGA  25.64 
 
 		 118 aa  43.9  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  25.96 
 
 		 1789 aa  43.9  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>