More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1558 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  100 
 
 
573 aa  1143    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  53.73 
 
 
576 aa  628  1e-179  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  53.55 
 
 
576 aa  627  1e-178  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  54.23 
 
 
583 aa  620  1e-176  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  50.35 
 
 
587 aa  609  1e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  51.64 
 
 
566 aa  607  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  52.16 
 
 
566 aa  606  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  53.31 
 
 
577 aa  606  9.999999999999999e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  51.46 
 
 
566 aa  605  1.0000000000000001e-171  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  50.78 
 
 
574 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  49.04 
 
 
575 aa  548  1e-155  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  49.21 
 
 
554 aa  540  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  49.3 
 
 
542 aa  527  1e-148  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  49.13 
 
 
542 aa  524  1e-147  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  47.54 
 
 
539 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  45.45 
 
 
556 aa  516  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  47.22 
 
 
540 aa  508  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  45.64 
 
 
552 aa  510  1e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  44.58 
 
 
546 aa  503  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0771  hypothetical protein  48.52 
 
 
536 aa  504  1e-141  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0800  hypothetical protein  48.16 
 
 
536 aa  501  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  44.93 
 
 
567 aa  497  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  45.52 
 
 
567 aa  498  1e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  45.3 
 
 
538 aa  492  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  44.91 
 
 
540 aa  494  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  44.41 
 
 
567 aa  495  9.999999999999999e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  44.3 
 
 
584 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  45.36 
 
 
545 aa  490  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  45.09 
 
 
540 aa  488  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  42.93 
 
 
566 aa  486  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  44.35 
 
 
538 aa  485  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  44.91 
 
 
540 aa  488  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  45.09 
 
 
540 aa  488  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  43.63 
 
 
543 aa  482  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  45.02 
 
 
546 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  44.79 
 
 
539 aa  479  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0246  NAD+ synthetase  43.65 
 
 
571 aa  480  1e-134  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126728  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  43.03 
 
 
591 aa  481  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  44.89 
 
 
545 aa  478  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  43.03 
 
 
591 aa  478  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  43.86 
 
 
541 aa  478  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  43.95 
 
 
564 aa  472  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0590  NAD+ synthetase  43.08 
 
 
549 aa  473  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  44.14 
 
 
577 aa  472  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0428  glutamine-dependent NAD+ synthetase  43.08 
 
 
549 aa  473  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2272  NAD synthetase  43.67 
 
 
609 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1089  NAD synthetase  43.83 
 
 
566 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34657  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1084  NAD synthetase  43.83 
 
 
566 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.589136  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1242  NAD synthetase  43.83 
 
 
566 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1409  NAD synthetase  46.3 
 
 
561 aa  469  1.0000000000000001e-131  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1585  NAD synthetase  43.67 
 
 
609 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.274333  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  42.41 
 
 
597 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  42.47 
 
 
552 aa  469  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  41.58 
 
 
561 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  43.49 
 
 
554 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1759  NAD synthetase  42.11 
 
 
542 aa  465  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  43.49 
 
 
554 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0741  NAD synthetase  43.67 
 
 
566 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.233333  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1011  NAD synthetase  41.81 
 
 
545 aa  465  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0196449  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3396  NAD synthetase  44.46 
 
 
562 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  42.71 
 
 
539 aa  465  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  41.58 
 
 
561 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3012  NAD synthetase  43.67 
 
 
566 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0804097  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0290  NAD synthetase  43.34 
 
 
560 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.950907 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  43.57 
 
 
561 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0807  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  43.51 
 
 
537 aa  462  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148145  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1117  NAD synthetase  43.67 
 
 
566 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0882  NAD synthetase  43.12 
 
 
561 aa  464  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  45.09 
 
 
545 aa  464  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2524  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  42.44 
 
 
556 aa  465  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.421348 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0572  NAD+ synthetase  41.27 
 
 
552 aa  462  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.323116  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  41.21 
 
 
571 aa  465  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  44.52 
 
 
543 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2038  NAD+ synthetase  42.93 
 
 
564 aa  461  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2416  NAD synthetase  43.73 
 
 
572 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00518413 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  45.09 
 
 
545 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  41.95 
 
 
598 aa  462  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0925  NAD+ synthetase  41.78 
 
 
590 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2322  NAD synthetase  43.11 
 
 
576 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509077  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  41.39 
 
 
561 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0887  NAD synthetase  41.64 
 
 
545 aa  461  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  41.18 
 
 
599 aa  461  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  41.55 
 
 
561 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2457  NAD synthetase  43.28 
 
 
576 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0627806  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  42.02 
 
 
577 aa  456  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5739  NAD synthetase  43.52 
 
 
568 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.630816  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1800  NAD synthetase  43.56 
 
 
572 aa  458  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4955  NAD+ synthetase  41.85 
 
 
586 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2412  NAD synthetase  43.56 
 
 
572 aa  458  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  42.51 
 
 
547 aa  456  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0878  NAD synthetase  43.62 
 
 
566 aa  458  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07390  NAD+ synthetase  42.2 
 
 
577 aa  456  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3217  NAD+ synthetase  42.11 
 
 
557 aa  458  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2113  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  43.54 
 
 
559 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1494  NAD+ synthetase  40.93 
 
 
582 aa  452  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0582262  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  43.84 
 
 
577 aa  452  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  42.76 
 
 
562 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  41.26 
 
 
567 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  41.82 
 
 
561 aa  450  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1765  NAD+ synthetase  40.2 
 
 
601 aa  450  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0678882  hitchhiker  0.000901061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>