More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1555 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1555  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
391 aa  740    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000544506  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0861  sodium/hydrogen exchanger  40.85 
 
 
395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0891  sodium/hydrogen exchanger  38.79 
 
 
381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.155242  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0798  sodium/hydrogen exchanger  31.59 
 
 
403 aa  162  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.539065  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4775  Na+/H+ antiporter  33.51 
 
 
399 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.169433  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0232  sodium/hydrogen exchanger  31.28 
 
 
412 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.568377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4911  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.25 
 
 
399 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5156  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.25 
 
 
399 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3609399999999994e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5286  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.25 
 
 
399 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4756  Na+/H+ antiporter  33.25 
 
 
399 aa  150  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.586497  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4853  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.63 
 
 
407 aa  149  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4871  sodium/hydrogen exchanger  33.24 
 
 
399 aa  149  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.813703  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2065  Sodium/hydrogen exchanger  29.02 
 
 
408 aa  149  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0630296 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5201  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.24 
 
 
399 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5193  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.98 
 
 
399 aa  149  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.147358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0056  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.98 
 
 
399 aa  149  9e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0399092  hitchhiker  0.000000129264 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5187  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.62 
 
 
399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3108  sodium/hydrogen exchanger  29.88 
 
 
400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.315718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4474  Na+/H+ antiporter  32.17 
 
 
407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4863  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.11 
 
 
407 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4639  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.17 
 
 
393 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3239  sodium/hydrogen exchanger  31.54 
 
 
405 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4877  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.11 
 
 
407 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4993  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.17 
 
 
393 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.850719  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0384  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.44 
 
 
407 aa  146  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4572  sodium/hydrogen exchanger  32.98 
 
 
407 aa  145  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4492  Na+/H+ antiporter  31.58 
 
 
407 aa  145  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4884  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.58 
 
 
407 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1158  sodium/hydrogen exchanger  33.94 
 
 
388 aa  140  6e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.637442  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3663  sodium/hydrogen exchanger  31.62 
 
 
393 aa  139  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1612  sodium/hydrogen exchanger  29.57 
 
 
393 aa  136  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.716831  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1518  sodium/hydrogen exchanger  30.64 
 
 
411 aa  136  8e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1889  hypothetical protein  29.97 
 
 
403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993371  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  29.64 
 
 
666 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2190  sodium/hydrogen exchanger  31.59 
 
 
427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1752  sodium/hydrogen exchanger  28.24 
 
 
409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3876  sodium/hydrogen exchanger  31.55 
 
 
396 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0363  sodium/hydrogen exchanger  30.62 
 
 
414 aa  117  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.624328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0084  sodium/hydrogen exchanger  28.43 
 
 
436 aa  117  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1207  sodium/hydrogen exchanger  27.72 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000156939  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  26.85 
 
 
656 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  27.22 
 
 
710 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4477  sodium/hydrogen exchanger  30.18 
 
 
400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92242  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0918  sodium/hydrogen exchanger  29.37 
 
 
394 aa  113  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272174  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  30.48 
 
 
665 aa  113  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  29.16 
 
 
674 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3880  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.49 
 
 
386 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  29.37 
 
 
666 aa  110  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  27.99 
 
 
660 aa  109  7.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.14 
 
 
587 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  27.43 
 
 
586 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  27.38 
 
 
660 aa  107  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.14 
 
 
587 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  27.14 
 
 
586 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  27.64 
 
 
666 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  26.78 
 
 
667 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  27.14 
 
 
586 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  28.23 
 
 
658 aa  106  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  26.57 
 
 
586 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  26.29 
 
 
585 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 
668 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  27.7 
 
 
741 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  26.57 
 
 
585 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3551  sodium/hydrogen exchanger  26.78 
 
 
741 aa  102  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.994377  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  28.18 
 
 
657 aa  102  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  27.84 
 
 
747 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  27.48 
 
 
585 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  27.45 
 
 
585 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  31.14 
 
 
665 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  27.35 
 
 
663 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  26.57 
 
 
587 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  28.31 
 
 
672 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  27.48 
 
 
585 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2225  sodium/hydrogen exchanger  28.43 
 
 
404 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  28.15 
 
 
678 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0446  sodium/hydrogen exchanger  30.5 
 
 
441 aa  100  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000379549 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  27.07 
 
 
663 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  27.25 
 
 
667 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.46 
 
 
669 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.46 
 
 
669 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  27.46 
 
 
669 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.46 
 
 
669 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.46 
 
 
669 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.46 
 
 
669 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  27.43 
 
 
586 aa  99.8  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  27.68 
 
 
668 aa  99.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  26.83 
 
 
385 aa  99.8  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  27.68 
 
 
668 aa  99.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  27.68 
 
 
668 aa  99.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  26.01 
 
 
659 aa  99.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  26.51 
 
 
658 aa  99  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  25.43 
 
 
674 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.5 
 
 
697 aa  98.2  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  29.54 
 
 
666 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  26.91 
 
 
648 aa  97.8  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0767  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.57 
 
 
539 aa  97.8  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529307  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1893  sodium/hydrogen exchanger  29.69 
 
 
395 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.285532  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  29.51 
 
 
745 aa  97.1  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  28.23 
 
 
670 aa  96.7  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  28.23 
 
 
670 aa  96.7  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.135864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>