165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1554 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  100 
 
 		 165 aa  328  2e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686318  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0860  TrkA domain-containing protein  43.51 
 
 		 163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  41.77 
 
 		 163 aa  137  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1517  TrkA domain-containing protein  39.1 
 
 		 164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0233  TrkA-C domain protein  40 
 
 		 164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  39.35 
 
 		 165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  39.35 
 
 		 165 aa  127  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  39.35 
 
 		 169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  39.35 
 
 		 169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  39.35 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  39.35 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  37.18 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  39.35 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  38.71 
 
 		 165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  38.71 
 
 		 164 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  0.00000000899247 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  38.71 
 
 		 164 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0407  TrkA-C domain protein  35.48 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4640  TrkA domain-containing protein  36.77 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4475  potasium uptake protein  36.77 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4493  potasium uptake protein  36.77 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4994  TrkA domain-containing protein  36.77 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4864  trkA domain protein  36.77 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4878  trkA domain protein  36.77 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4573  TrkA domain-containing protein  36.13 
 
 		 165 aa  120  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4885  TrkA domain-containing protein  36.13 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4854  trkA domain protein  36.13 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0383  trkA domain protein  35.48 
 
 		 165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0799  TrkA-C domain protein  36.65 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.6922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3109  TrkA-C domain protein  36.77 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196911  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1208  TrkA-C domain protein  34.39 
 
 		 166 aa  110  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0323117  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  32.9 
 
 		 162 aa  104  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  35.85 
 
 		 159 aa  101  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1753  TrkA-C domain-containing protein  35.71 
 
 		 160 aa  90.9  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  31.65 
 
 		 160 aa  87.8  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  32.08 
 
 		 195 aa  86.7  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  31.76 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  29.8 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  29.8 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  29.8 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  28.48 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19010  predicted regulatory ligand binding protein, C-terminal domain of K+ channels like protein  29.41 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.990404  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  30 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  28.57 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  31.25 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  28.48 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4656  TrkA domain-containing protein  29.11 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  25.32 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000259945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  24.68 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  27.85 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  24.68 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  27.85 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0206  TrkA domain-containing protein  26.28 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2691  hypothetical protein  23.27 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.392596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1613  TrkA-C domain protein  25.95 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.634302  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3881  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  24.81 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2801  TrkA-C domain protein  25.81 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  37.68 
 
 		 662 aa  63.9  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  42.86 
 
 		 671 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  40.62 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  38.03 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  38.03 
 
 		 334 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  38.03 
 
 		 330 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  36.99 
 
 		 673 aa  55.5  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  38.03 
 
 		 330 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  38.03 
 
 		 334 aa  54.3  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5523  potassium channel, putative  36.62 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  25 
 
 		 697 aa  53.9  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3112  potassium channel protein  36.59 
 
 		 225 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370735  normal  0.700906 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  35.94 
 
 		 674 aa  53.9  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1635  Ion transport 2 domain protein  37.93 
 
 		 567 aa  53.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0302468  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 672 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  33.8 
 
 		 667 aa  53.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1928  TrkA domain-containing protein  46.43 
 
 		 223 aa  52.4  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  24.37 
 
 		 666 aa  52  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  36.62 
 
 		 652 aa  51.2  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  26.72 
 
 		 668 aa  51.2  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0418  TrkA-N domain protein  38.03 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  35.94 
 
 		 684 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  30.49 
 
 		 674 aa  48.9  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  35.21 
 
 		 330 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  28.99 
 
 		 676 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  32.43 
 
 		 665 aa  48.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  35.71 
 
 		 341 aa  47.8  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  36.36 
 
 		 220 aa  47.4  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1200  TrkA domain-containing protein  38.1 
 
 		 212 aa  47.4  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.228424  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  32.35 
 
 		 332 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  36 
 
 		 650 aa  47  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  36.62 
 
 		 330 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  25.29 
 
 		 350 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  34.55 
 
 		 227 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  29.63 
 
 		 636 aa  46.6  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  32.26 
 
 		 682 aa  46.2  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  28.03 
 
 		 335 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  30.65 
 
 		 568 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4574  sodium/hydrogen exchanger  34.38 
 
 		 764 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  35.71 
 
 		 664 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  34.72 
 
 		 542 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  27.44 
 
 		 335 aa  45.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  36.21 
 
 		 217 aa  45.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>