More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1535 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  100 
 
 		 269 aa  543  1e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5272  Thioredoxin domain protein  45.72 
 
 		 272 aa  254  8e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127007 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  43.7 
 
 		 272 aa  247  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  43.7 
 
 		 272 aa  247  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2864  thioredoxin domain-containing protein  44.91 
 
 		 272 aa  237  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.499317  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  39.15 
 
 		 285 aa  196  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  41.28 
 
 		 293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  41.7 
 
 		 293 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  38.25 
 
 		 289 aa  185  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  38.25 
 
 		 289 aa  185  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  35.31 
 
 		 286 aa  181  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  35.82 
 
 		 310 aa  178  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  35.69 
 
 		 291 aa  175  8e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  38.04 
 
 		 280 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  36.12 
 
 		 277 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  37.59 
 
 		 280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  35.9 
 
 		 274 aa  172  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  37.79 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  35.34 
 
 		 281 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  34.28 
 
 		 287 aa  168  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  35.11 
 
 		 287 aa  166  4e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  35.09 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  33.45 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  35.29 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  36.26 
 
 		 282 aa  162  7e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  34.4 
 
 		 282 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  34.63 
 
 		 289 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  32.27 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  33.68 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  35.74 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  33.56 
 
 		 330 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1199  thioredoxin  34.83 
 
 		 268 aa  156  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0979  thioredoxin domain-containing protein  33.6 
 
 		 263 aa  156  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.248497  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  34.26 
 
 		 324 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  33.68 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  34.62 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  35.19 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  31.83 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  34.26 
 
 		 324 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1093  thioredoxin  34.35 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0251638  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  32.87 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  31.83 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  32.4 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  34.69 
 
 		 282 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  32.65 
 
 		 305 aa  149  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  32.76 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  33.95 
 
 		 282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  31.14 
 
 		 306 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  34.26 
 
 		 286 aa  145  8.000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  31.21 
 
 		 286 aa  145  8.000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1467  thioredoxin  35.09 
 
 		 268 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  32.06 
 
 		 290 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  30.69 
 
 		 302 aa  145  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  32.53 
 
 		 317 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  32.06 
 
 		 304 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  33.95 
 
 		 282 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  31.47 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  33.22 
 
 		 286 aa  143  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  31.8 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  31.82 
 
 		 290 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  32.06 
 
 		 290 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  31.47 
 
 		 290 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  32.72 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  33.21 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1229  thioredoxin  32.7 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.223518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  31.63 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  30.99 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  32.3 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  31.83 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  28.95 
 
 		 302 aa  139  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  30.87 
 
 		 302 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  31.72 
 
 		 302 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1155  thioredoxin domain-containing protein  33.8 
 
 		 294 aa  139  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  32.88 
 
 		 302 aa  139  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1052  Thioredoxin domain protein  32.62 
 
 		 286 aa  138  8.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  32.88 
 
 		 302 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  32.39 
 
 		 289 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  32.62 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  30.43 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  32.06 
 
 		 287 aa  136  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  29.63 
 
 		 302 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  35.56 
 
 		 235 aa  135  9e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  31.14 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3007  Thioredoxin domain protein  32.98 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  33.21 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  29.02 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  32.47 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  33.21 
 
 		 282 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  28.67 
 
 		 321 aa  132  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  33.82 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  33.82 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  33.82 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  30.1 
 
 		 329 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  32.87 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  32.87 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  32.87 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  33.82 
 
 		 918 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  31.03 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3195  Thioredoxin domain protein  33.33 
 
 		 286 aa  129  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1120  Thioredoxin domain protein  32.62 
 
 		 286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>