More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1503 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 211 aa  436  1e-121  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  47.89 
 
 		 212 aa  210  1e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  37.31 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  40.3 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  36.82 
 
 		 213 aa  148  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  36.82 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  37.31 
 
 		 213 aa  138  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  40.3 
 
 		 206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  34.5 
 
 		 205 aa  135  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  37.44 
 
 		 214 aa  135  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 208 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 202 aa  134  9e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  39.46 
 
 		 233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 222 aa  132  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  37.5 
 
 		 222 aa  132  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  31.84 
 
 		 213 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  37.63 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  36 
 
 		 200 aa  125  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  32.68 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  35.15 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  35.15 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  35.5 
 
 		 200 aa  121  6e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  35.5 
 
 		 200 aa  121  6e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  34.78 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.84 
 
 		 442 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  39.22 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  34.78 
 
 		 203 aa  118  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.84 
 
 		 442 aa  118  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.68 
 
 		 443 aa  117  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  33.7 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  33.7 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  34.12 
 
 		 214 aa  115  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  33.65 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  33.7 
 
 		 203 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  34.24 
 
 		 203 aa  115  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.86 
 
 		 442 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  32.57 
 
 		 445 aa  115  6.9999999999999995e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  33.7 
 
 		 203 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  33.33 
 
 		 196 aa  114  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  33.15 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  34.3 
 
 		 447 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  34.15 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.35 
 
 		 442 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.16 
 
 		 369 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.73 
 
 		 442 aa  113  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.83 
 
 		 356 aa  112  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.25 
 
 		 444 aa  112  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  34.67 
 
 		 200 aa  112  5e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  34.18 
 
 		 363 aa  112  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  33.66 
 
 		 209 aa  111  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 		 211 aa  111  9e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 448 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  32.94 
 
 		 217 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 448 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.35 
 
 		 442 aa  108  5e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  28.14 
 
 		 370 aa  108  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.92 
 
 		 449 aa  108  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  34.07 
 
 		 240 aa  107  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 		 440 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  34.92 
 
 		 225 aa  106  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.86 
 
 		 442 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.24 
 
 		 365 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.24 
 
 		 365 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.24 
 
 		 365 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 		 220 aa  105  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  32.37 
 
 		 218 aa  104  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33 
 
 		 382 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  31.67 
 
 		 447 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 		 411 aa  102  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  29.25 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.2 
 
 		 378 aa  102  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  33 
 
 		 207 aa  102  6e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  34.03 
 
 		 412 aa  102  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 		 214 aa  102  6e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  33 
 
 		 207 aa  101  7e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  30.66 
 
 		 459 aa  101  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  29.9 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  32.97 
 
 		 402 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  32.49 
 
 		 378 aa  99.8  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  32.42 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.65 
 
 		 427 aa  99  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  32.5 
 
 		 452 aa  99.4  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 		 207 aa  98.6  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 212 aa  98.6  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  31.55 
 
 		 383 aa  99  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  31.86 
 
 		 452 aa  99  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  31.09 
 
 		 237 aa  98.6  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  36.25 
 
 		 200 aa  98.6  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  31.72 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  28.79 
 
 		 207 aa  98.2  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13280  fructose-2,6-bisphosphatase  34.84 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 		 207 aa  96.7  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  30.61 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 188 aa  96.3  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.58 
 
 		 547 aa  95.9  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>