More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1498 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1498  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
389 aa  786    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1203  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.9 
 
 
388 aa  540  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.699954  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1330  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.38 
 
 
388 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.143594  decreased coverage  0.000414466 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1067  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.32 
 
 
391 aa  535  1e-151  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.575864  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1795  nucleotide sugar dehydrogenase  65.38 
 
 
389 aa  537  1e-151  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3019  nucleotide sugar dehydrogenase  64.87 
 
 
397 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0876853 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1968  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.38 
 
 
389 aa  531  1e-150  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2849  nucleotide sugar dehydrogenase  64.1 
 
 
388 aa  528  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00992  nucleotide sugar dehydrogenase  65.04 
 
 
395 aa  528  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000137814  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1387  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  63.33 
 
 
388 aa  529  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.496605  hitchhiker  0.0000966488 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01930  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.36 
 
 
388 aa  525  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.586017  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1629  nucleotide sugar dehydrogenase  63.36 
 
 
388 aa  525  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00733567  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2641  UDP-glucose 6-dehydrogenase  64.62 
 
 
388 aa  525  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2961  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.61 
 
 
388 aa  527  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000204361 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01916  hypothetical protein  63.36 
 
 
388 aa  525  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1572  nucleotide sugar dehydrogenase  62.56 
 
 
388 aa  524  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1032  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.1 
 
 
388 aa  524  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.366892 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2418  udp-glucose 6-dehydrogenase  62.6 
 
 
388 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233828 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.6 
 
 
388 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0186642 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2259  udp-glucose 6-dehydrogenase  62.6 
 
 
388 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.389868  normal  0.025931 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2306  udp-glucose 6-dehydrogenase  62.34 
 
 
388 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0255325 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0919  nucleotide sugar dehydrogenase  61.79 
 
 
388 aa  521  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00213667  normal  0.147124 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1202  nucleotide sugar dehydrogenase  64.36 
 
 
389 aa  523  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.988641  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2319  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.85 
 
 
388 aa  523  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2205  udp-glucose 6-dehydrogenase  62.6 
 
 
388 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.638468  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.82 
 
 
388 aa  522  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112663  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1614  nucleotide sugar dehydrogenase  62.85 
 
 
388 aa  520  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.812894 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0800  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  62.98 
 
 
391 aa  520  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1373  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.85 
 
 
388 aa  520  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1510  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  62.5 
 
 
390 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2929  nucleotide sugar dehydrogenase  62.82 
 
 
388 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001761  UDP-glucose dehydrogenase  62.56 
 
 
388 aa  515  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00706  nucleotide sugar dehydrogenase  61.79 
 
 
388 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2679  nucleotide sugar dehydrogenase  62.56 
 
 
388 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4687  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.03 
 
 
387 aa  510  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1349  nucleotide sugar dehydrogenase  62.82 
 
 
388 aa  510  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2115  DNA gyrase, subunit A  62.82 
 
 
388 aa  510  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.539484 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1418  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.05 
 
 
388 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3978  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  60.51 
 
 
409 aa  501  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3483  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  61.79 
 
 
389 aa  501  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.956099  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4088  phosphoglycerate mutase  60.51 
 
 
409 aa  499  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0720  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.97 
 
 
388 aa  495  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875671  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3885  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  60 
 
 
409 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0071  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  61.03 
 
 
387 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4273  nucleotide sugar dehydrogenase  60.77 
 
 
387 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1563  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.21 
 
 
397 aa  494  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.03127  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0591  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.26 
 
 
388 aa  489  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4468  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  59.74 
 
 
387 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4328  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  60 
 
 
387 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2850  nucleotide sugar dehydrogenase  56.92 
 
 
388 aa  476  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217055  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3861  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.59 
 
 
398 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0444005  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0900  hypothetical protein  56.64 
 
 
397 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0374108 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1256  transcriptional regulator, XRE family  56.34 
 
 
491 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1737  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.64 
 
 
388 aa  443  1e-123  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.08 
 
 
372 aa  421  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0958685  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0275  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase, dimerisation  52.78 
 
 
422 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0309187  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0592  nucleotide sugar dehydrogenase  43.56 
 
 
389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.887508 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0568  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  43.56 
 
 
389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00339328  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0599  nucleotide sugar dehydrogenase  43.56 
 
 
389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  34.37 
 
 
435 aa  191  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.87 
 
 
437 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0396175  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  32.87 
 
 
438 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5385  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.99 
 
 
457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463781  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  32.87 
 
 
438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  32.58 
 
 
438 aa  184  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  32.58 
 
 
434 aa  184  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.81 
 
 
451 aa  182  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.07 
 
 
460 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  32.3 
 
 
434 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.33 
 
 
436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  32.89 
 
 
464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  32.3 
 
 
434 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1764  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.8 
 
 
425 aa  178  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.796911  normal  0.409605 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  32.02 
 
 
433 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3605  nucleotide sugar dehydrogenase  31.61 
 
 
441 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1502  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.47 
 
 
438 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.842125  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2750  nucleotide sugar dehydrogenase  30.05 
 
 
475 aa  176  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.6 
 
 
451 aa  176  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.21 
 
 
437 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  30.19 
 
 
437 aa  176  8e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  30.19 
 
 
437 aa  176  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  30.87 
 
 
447 aa  175  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.39 
 
 
434 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.39 
 
 
434 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  31.94 
 
 
433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  32.69 
 
 
441 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2477  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.87 
 
 
471 aa  174  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3180  nucleotide sugar dehydrogenase  31.75 
 
 
449 aa  173  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000062373  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0785  nucleotide sugar dehydrogenase  31.06 
 
 
449 aa  172  6.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180354  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  31.09 
 
 
473 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2024  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.85 
 
 
450 aa  172  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.2 
 
 
433 aa  172  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2782  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.23 
 
 
457 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  29.78 
 
 
440 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  32.49 
 
 
442 aa  170  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.04 
 
 
467 aa  170  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  30.23 
 
 
441 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  29.94 
 
 
442 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.56 
 
 
438 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  28.89 
 
 
466 aa  169  6e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>