253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1474 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  100 
 
 
116 aa  224  4e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  48.19 
 
 
111 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  54.1 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  58.93 
 
 
106 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  40.96 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.76 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  50.82 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  51.85 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  51.85 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  51.85 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  60 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  45.45 
 
 
122 aa  63.9  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.57 
 
 
122 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.67 
 
 
140 aa  62.8  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  47.27 
 
 
214 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  46.15 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  35.24 
 
 
179 aa  61.6  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  53.7 
 
 
126 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.05 
 
 
96 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.57 
 
 
128 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  49.06 
 
 
152 aa  61.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  49.21 
 
 
147 aa  60.8  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  45.45 
 
 
149 aa  60.5  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  44.44 
 
 
229 aa  60.1  0.000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  44.44 
 
 
231 aa  60.1  0.000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  51.06 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  32.99 
 
 
171 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.99 
 
 
171 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  39.74 
 
 
182 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  32.99 
 
 
171 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  32.99 
 
 
171 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  32.99 
 
 
171 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  39.74 
 
 
182 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  39.74 
 
 
182 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  32.99 
 
 
171 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1574  sec-independent translocase  40 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  32.99 
 
 
171 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  32.99 
 
 
171 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  43.08 
 
 
184 aa  58.9  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  39.74 
 
 
182 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  39.74 
 
 
182 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  43.08 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  43.08 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  55.93 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  32.99 
 
 
171 aa  58.2  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  36.27 
 
 
91 aa  57.8  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.14 
 
 
189 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.33 
 
 
203 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  41.54 
 
 
125 aa  57.4  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  33.96 
 
 
125 aa  57.4  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.46 
 
 
190 aa  57  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.68 
 
 
92 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  50 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  34.67 
 
 
115 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0355  sec-independent translocase  34.44 
 
 
176 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.843267  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1093  sec-independent translocase  41.82 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.25 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8412  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  40.74 
 
 
123 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298591  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1982  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.02 
 
 
145 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0382774 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.25 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.29 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  40.68 
 
 
87 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2010  sec-independent translocase  41.82 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0693  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  52.46 
 
 
179 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0696198  normal  0.127411 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.64 
 
 
197 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1807  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  65 
 
 
193 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.988739  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3535  sec-independent translocase  33.33 
 
 
175 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  35.63 
 
 
88 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0340  sec-independent translocase  34.69 
 
 
178 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0793072  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0364  sec-independent translocase  33.33 
 
 
176 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35.29 
 
 
90 aa  54.7  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  42 
 
 
96 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0416  sec-independent translocase  33.33 
 
 
179 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2670  sec-independent translocase  33.33 
 
 
179 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410256  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0437  sec-independent translocase  33.33 
 
 
179 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496787  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  51.06 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  37.31 
 
 
118 aa  54.7  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.08 
 
 
163 aa  54.3  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.64 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0062  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  50 
 
 
118 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.026501  normal  0.0479583 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1739  SEC-independent protein translocase  51.06 
 
 
110 aa  54.3  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  42 
 
 
88 aa  53.9  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  55.32 
 
 
84 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.29 
 
 
234 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3518  twin arginine translocase protein A  54.84 
 
 
108 aa  53.9  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000524898  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2981  sec-independent translocase  32.65 
 
 
175 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  44 
 
 
104 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  45.83 
 
 
90 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  44 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  38.98 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2702  sec-independent translocase  35.37 
 
 
175 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1800  sec-independent translocase  35.37 
 
 
175 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1948  twin arginine-targeting protein translocase  52.08 
 
 
55 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  32.29 
 
 
175 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3712  sec-independent translocase  35.37 
 
 
175 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2747  sec-independent translocase  39.68 
 
 
182 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3654  sec-independent translocase  35.37 
 
 
175 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  38.98 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1344  twin-arginine translocation protein  33.96 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.108227 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3251  sec-independent translocase  35.37 
 
 
175 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>