More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1393 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0044  Integrase catalytic region  97.87 
 
 
375 aa  710    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000337574  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1393  Integrase catalytic region  100 
 
 
374 aa  763    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000348935  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0940  hypothetical protein  95.91 
 
 
234 aa  424  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000789536  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2869  Integrase catalytic region  27.3 
 
 
359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.513593  normal  0.876471 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1853  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
385 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.657807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0891  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
379 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.233948  normal  0.0447709 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3104  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
356 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.350781  normal  0.299563 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0748  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
390 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000105818  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0375  Integrase catalytic region  27.3 
 
 
431 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0171  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
374 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2064  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
365 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2198  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
364 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3080  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
371 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2762  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0455  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
371 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.664001 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0729  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00154402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1497  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  hitchhiker  0.000449962 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1564  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1702  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
364 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.431472  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1152  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1238  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0115541  normal  0.0835857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1366  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
361 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000904408  decreased coverage  0.0000712993 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1541  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
356 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000437148  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1690  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
358 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2691  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149975  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0779  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
409 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.89745  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3167  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
373 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.179309  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0876  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
367 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.506232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0896  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
359 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.366884  normal  0.0325311 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3181  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
362 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.299267  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1159  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.565735  decreased coverage  0.00186464 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1071  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
369 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000428907  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0711  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
359 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000332452  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0321  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
373 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0118  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
411 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1978  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal  0.284491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1990  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0292285  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2305  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.96472  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2429  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3500  hypothetical protein  27.79 
 
 
364 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000943241  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3325  hypothetical protein  27.79 
 
 
361 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.683157  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1779  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
378 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3091  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0808941 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2491  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0709755 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3369  TROVE domain protein  27.79 
 
 
359 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2677  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
371 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000537558  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2719  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
356 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00913617  normal  0.77965 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2964  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
356 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3016  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
356 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2732  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1352  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
379 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1178  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
379 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2714  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
362 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal  0.786621 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0721  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
360 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208316  decreased coverage  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0088  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
364 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2449  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
390 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.708832  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2485  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
364 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.151437 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1394  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
376 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.295612  normal  0.0489416 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3517  hypothetical protein  27.79 
 
 
362 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573832 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0006  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
385 aa  113  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000397696  normal  0.219937 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1815  Integrase catalytic region  27.79 
 
 
383 aa  113  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953859  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0527  Integrase catalytic region  26.35 
 
 
349 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0690  Integrase catalytic region  29.6 
 
 
321 aa  104  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168341  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5595  integrase catalytic region  28.16 
 
 
320 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3364  integrase catalytic region  28.16 
 
 
320 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2520  integrase catalytic region  28.16 
 
 
320 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3514  hypothetical protein  28.76 
 
 
310 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0359697 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1806  Integrase catalytic region  28.81 
 
 
336 aa  98.6  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.842149 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0520  putative transposase  28.74 
 
 
327 aa  88.6  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.693676  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0341  putative transposase  28.74 
 
 
327 aa  88.6  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0538  Integrase catalytic region  28.66 
 
 
325 aa  86.7  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.189416 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1950  Integrase catalytic region  29.41 
 
 
325 aa  86.7  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0529  Integrase catalytic region  28.66 
 
 
325 aa  86.7  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.247566  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4857  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
338 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5102  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
339 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3309  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
338 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5758  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
338 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0647167 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  25.45 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  25.45 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  25.45 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  26.05 
 
 
463 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  21.14 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  21.14 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  21.14 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  21.14 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  21.14 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  21.14 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  21.14 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  25 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  25 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  25 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  25 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1273  hypothetical protein  25.32 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0999856 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  21.79 
 
 
463 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0952  hypothetical protein  24.06 
 
 
320 aa  72  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  26.51 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1128  integrase catalytic subunit  22.48 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  28.28 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  28.28 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000845152  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1401  integrase catalytic subunit  21.98 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>