235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1376 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1376  putative transcriptional acitvator, Baf family  100 
 
 
252 aa  498  1e-140  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0638474  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0064  pantothenate kinase  40.96 
 
 
262 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0065  pantothenate kinase  40.96 
 
 
262 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0061  pantothenate kinase  40.96 
 
 
262 aa  207  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0061  pantothenate kinase  40.96 
 
 
262 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0065  pantothenate kinase  40.96 
 
 
262 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0074  pantothenate kinase  40.96 
 
 
262 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.335209 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0077  pantothenate kinase  40.96 
 
 
262 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.02884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5243  pantothenate kinase  40.56 
 
 
262 aa  206  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.141011 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0073  pantothenate kinase  40.16 
 
 
262 aa  206  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0061  pantothenate kinase  40.56 
 
 
262 aa  205  5e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0061  pantothenate kinase  39.76 
 
 
262 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0086  pantothenate kinase  38.55 
 
 
256 aa  195  8.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000411745  normal  0.0255424 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0065  pantothenate kinase  37.6 
 
 
258 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000107258  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0063  pantothenate kinase  38.4 
 
 
258 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0801  pantothenate kinase  36.95 
 
 
255 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  38.4 
 
 
254 aa  186  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  38.1 
 
 
254 aa  186  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4446  putative transcriptional acitvator, Baf family  37.35 
 
 
261 aa  185  6e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  36.14 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1934  pantothenate kinase  39.61 
 
 
255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.690584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2816  pantothenate kinase  39.6 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000416191  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0109  Baf family transcriptional regulator  38.55 
 
 
255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00933818  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0146  pantothenate kinase  35.34 
 
 
254 aa  182  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  39.5 
 
 
255 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0171  Baf family transcriptional activator  35.74 
 
 
264 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00680  pantothenate kinase  37.45 
 
 
257 aa  180  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  36.44 
 
 
258 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1791  Baf family transcriptional activator  36.99 
 
 
269 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0544  pantothenate kinase  36.61 
 
 
262 aa  176  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  35.34 
 
 
255 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.13 
 
 
254 aa  175  6e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  37.39 
 
 
274 aa  174  9e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0126  Baf family transcriptional activator  38.6 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000054908  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  31.73 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  35.2 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1480  pantothenate kinase  35.86 
 
 
254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0377381  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0424  Baf family transcriptional activator  34.4 
 
 
255 aa  170  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00396752  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2817  pantothenate kinase  34.39 
 
 
261 aa  170  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  33.47 
 
 
263 aa  169  4e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  34.94 
 
 
266 aa  167  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2784  pantothenate kinase  35.43 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2470  pantothenate kinase  35.43 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0160  pantothenate kinase  36.95 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144798  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2533  pantothenate kinase  34.39 
 
 
257 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0151685  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  34.82 
 
 
253 aa  166  4e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1193  pantothenate kinase  34.39 
 
 
257 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  35.2 
 
 
254 aa  166  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1570  pantothenate kinase  34.12 
 
 
257 aa  164  9e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  32.66 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2186  Baf family transcriptional activator  32.93 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  33.06 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1989  pantothenate kinase  33.99 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.755587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  35.59 
 
 
254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0246  putative transcriptional acitvator, Baf family  34.96 
 
 
254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1265  putative transcriptional acitvator, Baf family  36.4 
 
 
262 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1477  pantothenate kinase  33.2 
 
 
255 aa  162  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148615  normal  0.127378 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2387  pantothenate kinase  33.47 
 
 
254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10195  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1868  putative transcriptional acitvator, Baf family  34.8 
 
 
254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0248735  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1477  pantothenate kinase  33.47 
 
 
254 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123819  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1572  pantothenate kinase  33.47 
 
 
254 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0625  putative transcriptional acitvator, Baf family  35.94 
 
 
263 aa  160  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0136  pantothenate kinase  34.8 
 
 
255 aa  159  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000027573  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1296  Baf family transcriptional activator  32.13 
 
 
255 aa  159  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1370  pantothenate kinase  31.17 
 
 
259 aa  159  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.682147  normal  0.0338763 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23250  transcriptional activator, putative, Baf family  31.85 
 
 
256 aa  159  5e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2229  pantothenate kinase  33.6 
 
 
259 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2217  pantothenate kinase  33.6 
 
 
263 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  34.8 
 
 
255 aa  154  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1331  pantothenate kinase  31.62 
 
 
256 aa  154  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181075  normal  0.0140716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4483  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.89 
 
 
262 aa  153  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3611  Baf family transcriptional activator  32.1 
 
 
264 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0973  pantothenate kinase  39.36 
 
 
256 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0943  pantothenate kinase  39.36 
 
 
256 aa  149  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1198  pantothenate kinase  33.6 
 
 
259 aa  149  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2882  pantothenate kinase  30.83 
 
 
258 aa  148  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0215  pantothenate kinase  30.56 
 
 
256 aa  149  6e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.113786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0081  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.27 
 
 
255 aa  148  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1220  putative transcriptional acitvator, Baf family  36.9 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4983  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.1 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.442209  normal  0.98893 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1811  pantothenate kinase  35.15 
 
 
262 aa  145  9e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0762  pantothenate kinase  32.02 
 
 
260 aa  143  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2285  pantothenate kinase  30.04 
 
 
260 aa  142  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9156  pantothenate kinase  29.92 
 
 
260 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166595  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3000  pantothenate kinase  31.73 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4379  pantothenate kinase  30.98 
 
 
250 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.174078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8379  pantothenate kinase  31.37 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1294  pantothenate kinase  28.74 
 
 
261 aa  139  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1063  pantothenate kinase  28.05 
 
 
255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.156837 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2660  pantothenate kinase  33.06 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0920  pantothenate kinase  30.65 
 
 
256 aa  139  6e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3423  putative Baf family transcriptional acitvator  32.3 
 
 
260 aa  139  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.354519  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1724  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.8 
 
 
266 aa  138  7e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.345789  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0452  pantothenate kinase  32.67 
 
 
275 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1772  pantothenate kinase  36.36 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0113  putative transcriptional acitvator, Baf family  33.46 
 
 
260 aa  135  4e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.164132 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  30.98 
 
 
264 aa  136  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0835  pantothenate kinase  32.94 
 
 
268 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2715  putative transcriptional activator, Baf family  36.61 
 
 
255 aa  133  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000282067  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0196  pantothenate kinase  30.98 
 
 
253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.699479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>