294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1355 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1355  exsB protein  100 
 
 
222 aa  457  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618958  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0028  exsB protein  63.33 
 
 
216 aa  283  1.0000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  45.24 
 
 
227 aa  186  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  41.31 
 
 
222 aa  164  9e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  36.41 
 
 
229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  40.09 
 
 
225 aa  159  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1317  exsB protein  39.17 
 
 
230 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1288  exsB protein  40.83 
 
 
226 aa  157  9e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158784  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3075  ExsB  39.15 
 
 
237 aa  156  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520876  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18821  ATPase  37.27 
 
 
224 aa  154  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.855612  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  38.97 
 
 
224 aa  154  8e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  37.14 
 
 
232 aa  154  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228539  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3693  exsB protein  40 
 
 
225 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1784  ExsB  37.56 
 
 
224 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.115928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0483  exsB protein  39.34 
 
 
237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0068  exsB protein  39.62 
 
 
229 aa  152  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0069  exsB protein  39.62 
 
 
229 aa  152  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.955333 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1293  ExsB  38.57 
 
 
225 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2002  exsB protein  39.45 
 
 
225 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19011  ATPase  36.49 
 
 
224 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.422849  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3788  exsB protein  39.53 
 
 
225 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  40 
 
 
251 aa  151  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2027  exsB protein  39.53 
 
 
225 aa  151  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4046  exsB protein  38.39 
 
 
228 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.346738  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18821  ATPase  36.57 
 
 
224 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  38.57 
 
 
224 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  40.19 
 
 
222 aa  149  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21651  ATPase  37.38 
 
 
225 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.328104 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4042  ExsB  37.5 
 
 
225 aa  149  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5203  exsB protein  38.36 
 
 
229 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0731  exsB protein  38.57 
 
 
224 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.372152  normal  0.140663 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0738  putative signal peptide protein  38.1 
 
 
224 aa  149  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593438  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  37.8 
 
 
233 aa  148  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808637  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0272  exsB protein  37.67 
 
 
246 aa  148  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.281019  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  38.07 
 
 
228 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3379  ExsB  35.98 
 
 
236 aa  147  9e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.108829 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0798  ExsB  37.8 
 
 
226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126082  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2362  ExsB  38.03 
 
 
227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000048435  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  42.25 
 
 
237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1984  exsB protein  36.65 
 
 
234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  37.61 
 
 
224 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2602  ExsB  35.48 
 
 
226 aa  145  3e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.175115  normal  0.073954 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2710  ExsB  39.23 
 
 
232 aa  145  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  37.85 
 
 
243 aa  145  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1207  exsB protein  37.44 
 
 
223 aa  146  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000226628  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3059  exsB protein  38.89 
 
 
229 aa  146  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  36.87 
 
 
224 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  37.09 
 
 
226 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2672  ExsB  37.8 
 
 
227 aa  145  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00821244  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  37.61 
 
 
224 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2335  ExsB  39.15 
 
 
229 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000753404  normal  0.063598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51670  hypothetical protein  36.28 
 
 
224 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000703334  hitchhiker  0.000657127 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2225  ExsB ATPase  37.09 
 
 
229 aa  144  9e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1233  exsB protein  37.56 
 
 
223 aa  144  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.583286  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  37.09 
 
 
229 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  37.09 
 
 
230 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18241  PP-loop superfamily ATPase  37.61 
 
 
229 aa  143  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0191  exsB protein  39.81 
 
 
221 aa  143  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  36.79 
 
 
221 aa  142  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2799  hypothetical protein  38.53 
 
 
228 aa  142  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0593  exsB protein  38.32 
 
 
271 aa  143  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.564873  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  37.16 
 
 
484 aa  142  4e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  37.56 
 
 
222 aa  142  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1766  exsB protein  36.28 
 
 
256 aa  142  5e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0777  ExsB  35.65 
 
 
259 aa  142  5e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  35.19 
 
 
227 aa  142  6e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4532  hypothetical protein  35.81 
 
 
224 aa  141  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2945  hypothetical protein  38.53 
 
 
228 aa  141  8e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1957  ExsB  35.62 
 
 
241 aa  141  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115438  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0771  ExsB family transcriptional regulator  35.65 
 
 
285 aa  141  9e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.698325 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  37.44 
 
 
226 aa  140  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29671  ATPase  35.48 
 
 
229 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  36.49 
 
 
224 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0778  exsB protein  35.71 
 
 
233 aa  139  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0837862  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2982  putative transcriptional regulator  37.09 
 
 
230 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2238  ExsB  35.94 
 
 
226 aa  139  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2179  queuosine biosynthesis protein  36.97 
 
 
244 aa  137  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2885  exsB protein  36.74 
 
 
218 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.937408  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1942  exsB protein  35.81 
 
 
244 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.243954  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  37.91 
 
 
220 aa  136  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4380  exsB protein  36.24 
 
 
229 aa  136  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0149  ExsB  36.36 
 
 
224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0104  ExsB protein  36.87 
 
 
223 aa  135  4e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.132302  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1333  ExsB  36.02 
 
 
231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0539  exsB protein  34.88 
 
 
235 aa  135  7.000000000000001e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1885  exsB protein  38.07 
 
 
223 aa  134  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2105  exsB protein  36.15 
 
 
219 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266539 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1355  ExsB  34.53 
 
 
227 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.748  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2961  exsB protein  34.6 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3115  exsB protein  37.74 
 
 
221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543639  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2420  exsB protein  34.74 
 
 
243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.107202 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1618  hypothetical protein  36.49 
 
 
222 aa  132  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0016  ExsB  37.38 
 
 
224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.877177  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02725  putative regulator protein  34.42 
 
 
218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3137  ExsB  34.7 
 
 
233 aa  132  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129626  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0043  exsB protein  37.38 
 
 
224 aa  131  6e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.228871  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01572  ExsB protein  37.26 
 
 
224 aa  131  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.779183  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0016  exsB protein  37.38 
 
 
224 aa  131  7.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.981241  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0752  exsB protein  36.82 
 
 
222 aa  131  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0736  exsB protein  36.82 
 
 
222 aa  131  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.52345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>