46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1353 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1353  protein of unknown function DUF399  100 
 
 		 244 aa  494  1e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000200413  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1357  hypothetical protein  34.6 
 
 		 400 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690238  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  32.08 
 
 		 292 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  32.16 
 
 		 390 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  31.37 
 
 		 282 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  28.5 
 
 		 392 aa  106  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  31.61 
 
 		 285 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  26.73 
 
 		 282 aa  97.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1775  hypothetical protein  27.45 
 
 		 288 aa  96.7  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1702  protein of unknown function DUF399  23.97 
 
 		 411 aa  95.5  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0381555  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2447  protein of unknown function DUF399  28.48 
 
 		 561 aa  95.1  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  24.36 
 
 		 392 aa  94.4  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1736  hypothetical protein  29.63 
 
 		 309 aa  91.3  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.317889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2488  protein of unknown function DUF399  26.09 
 
 		 284 aa  90.5  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0534  protein of unknown function DUF399  28.71 
 
 		 282 aa  90.1  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4646  protein of unknown function DUF399  32.06 
 
 		 400 aa  90.1  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.342836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1083  protein of unknown function DUF399  27.78 
 
 		 386 aa  89.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3346  protein of unknown function DUF399  26.05 
 
 		 411 aa  86.7  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1760  protein of unknown function DUF399  26.79 
 
 		 262 aa  85.9  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0505659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1023  hypothetical protein  25 
 
 		 269 aa  85.5  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  21.68 
 
 		 376 aa  85.5  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  28.88 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2382  PDZ/DHR/GLGF  23.35 
 
 		 436 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0548  protein of unknown function DUF399  27.14 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.79129 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  27.08 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0907  protein of unknown function DUF399  26.94 
 
 		 426 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0724996  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0135  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  21.43 
 
 		 454 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0450111 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002904  uncharacterized iron-regulated protein  24.88 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03054  hypothetical protein  26.76 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3472  hypothetical protein  24.49 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1590  hypothetical protein  23.86 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43594  predicted protein  22.58 
 
 		 553 aa  73.2  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0541  PDZ/DHR/GLGF  22.04 
 
 		 462 aa  72.4  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0149292  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0868  putative lipoprotein  24.42 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295521  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2799  protein of unknown function DUF399  23 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1587  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  23.44 
 
 		 395 aa  65.9  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.397404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1026  hypothetical protein  26.92 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.823473  normal  0.048424 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0011  hypothetical protein  22.82 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113943  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1026  protein of unknown function DUF399  29.73 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.604469  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6096  protein of unknown function DUF399  27.59 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.939733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1409  hypothetical protein  27.78 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776677 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  23.5 
 
 		 322 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  20.18 
 
 		 359 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1348  hypothetical protein  25.37 
 
 		 552 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  20.93 
 
 		 278 aa  45.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  18.87 
 
 		 345 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>