More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1321 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1321  undecaprenol kinase  100 
 
 
252 aa  499  1e-140  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2561  undecaprenol kinase  58.78 
 
 
252 aa  301  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000943331  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3622  putative undecaprenol kinase  56.75 
 
 
254 aa  300  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1667  undecaprenol kinase  58.23 
 
 
254 aa  299  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0198  undecaprenol kinase, putative  56.81 
 
 
267 aa  274  9e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0237  undecaprenol kinase, putative  56.81 
 
 
267 aa  274  9e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0215  putative undecaprenol kinase  56.03 
 
 
267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1235  undecaprenol kinase, putative  55.25 
 
 
258 aa  265  4e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0437  putative undecaprenol kinase  55.6 
 
 
258 aa  263  1e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.222159  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0452  undecaprenol kinase  53.67 
 
 
258 aa  254  7e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.825456  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1371  putative undecaprenol kinase  45.85 
 
 
255 aa  248  5e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0409188  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0027  undecaprenol kinase, putative  53.88 
 
 
268 aa  245  6e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1816  undecaprenol kinase, putative  46.06 
 
 
255 aa  236  3e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0882  undecaprenol kinase  51.35 
 
 
259 aa  234  9e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.647913 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3328  putative undecaprenol kinase  46.31 
 
 
254 aa  222  4e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0666  undecaprenol kinase, putative  46.88 
 
 
273 aa  219  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2692  undecaprenyl-diphosphatase  48.03 
 
 
276 aa  219  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2029  undecaprenol kinase  44.49 
 
 
255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2527  undecaprenyl-diphosphatase  48.11 
 
 
269 aa  218  6e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3674  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.12 
 
 
274 aa  218  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3344  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.4 
 
 
277 aa  217  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2286  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.19 
 
 
273 aa  216  4e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3911  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.7 
 
 
274 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971471  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3561  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.21 
 
 
273 aa  214  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0840276 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3460  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.82 
 
 
273 aa  214  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059068  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3395  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.21 
 
 
273 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.501058  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3391  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.21 
 
 
273 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000584329  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.8 
 
 
277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3465  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.21 
 
 
273 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3459  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.21 
 
 
273 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.184869 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.37 
 
 
272 aa  211  7e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00333186  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2602  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.9 
 
 
276 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273889  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3350  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.15 
 
 
270 aa  209  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3520  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.15 
 
 
273 aa  209  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2756  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.12 
 
 
276 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3488  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.15 
 
 
273 aa  209  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0660  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.29 
 
 
266 aa  210  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.484694  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3409  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.55 
 
 
272 aa  210  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.75 
 
 
274 aa  209  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02927  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.15 
 
 
273 aa  209  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00198226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0643  undecaprenol kinase  47.15 
 
 
273 aa  209  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0008288  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3235  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.15 
 
 
273 aa  209  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3568  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.79 
 
 
272 aa  209  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0180564  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4369  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.15 
 
 
273 aa  209  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02877  hypothetical protein  47.15 
 
 
273 aa  209  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00183865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0642  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.15 
 
 
273 aa  209  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000274172  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1120  putative undecaprenol kinase  45.42 
 
 
268 aa  209  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8331  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.36 
 
 
275 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0072  undecaprenol kinase  44.75 
 
 
256 aa  208  6e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0559  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.13 
 
 
272 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000591232  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0297  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.13 
 
 
272 aa  207  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00789183  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1072  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.53 
 
 
274 aa  207  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406664  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2777  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.8 
 
 
268 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.41 
 
 
270 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0949  undecaprenyl-diphosphatase  48.58 
 
 
263 aa  207  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.497251  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0640  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.13 
 
 
272 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192783  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1356  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.86 
 
 
277 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0826661 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0701  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.82 
 
 
293 aa  206  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0205173  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1807  putative undecaprenol kinase  42.19 
 
 
305 aa  206  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3599  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.36 
 
 
274 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4274  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.47 
 
 
267 aa  205  5e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0651  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.91 
 
 
293 aa  205  6e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0689284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2919  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.96 
 
 
276 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151391  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0605  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.35 
 
 
278 aa  205  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.53 
 
 
274 aa  205  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23354  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1339  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.71 
 
 
268 aa  205  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4294  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.63 
 
 
274 aa  204  8e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000020273  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0610  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.91 
 
 
293 aa  204  8e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00505052  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5424  undecaprenol kinase  45.88 
 
 
267 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.36 
 
 
268 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.09 
 
 
293 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0234  undecaprenol kinase  41.75 
 
 
293 aa  204  1e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2862  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.53 
 
 
277 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2289  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.58 
 
 
274 aa  203  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00352871  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.33 
 
 
277 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39190  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.12 
 
 
277 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0708152  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3337  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.9 
 
 
277 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3008  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.74 
 
 
276 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112856  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1803  undecaprenyl-diphosphatase  43.58 
 
 
274 aa  202  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2827  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.36 
 
 
276 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0757  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.82 
 
 
293 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1864  undecaprenol kinase  42.37 
 
 
266 aa  202  6e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114213  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1408  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.4 
 
 
269 aa  201  7e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703456  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3618  undecaprenol kinase  47.15 
 
 
266 aa  201  8e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.359359 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28720  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.33 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3141  undecaprenol kinase, putative  45.35 
 
 
276 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0312713  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1245  undecaprenol kinase  44.08 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.123014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0223  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.79 
 
 
268 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2175  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.1 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0169688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0215  undecaprenol kinase  45.85 
 
 
267 aa  199  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.086247  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0981  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.75 
 
 
268 aa  199  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.75 
 
 
268 aa  199  5e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3184  undecaprenyl-diphosphatase  42.7 
 
 
270 aa  199  5e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.7 
 
 
268 aa  199  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4278  putative undecaprenol kinase  43.14 
 
 
306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000318908  normal  0.0359854 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3591  putative undecaprenol kinase  43.08 
 
 
286 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0184  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.64 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0045  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.14 
 
 
268 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0661  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.41 
 
 
268 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.171076 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0795  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.17 
 
 
273 aa  195  6e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.677527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>