294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1306 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1306  Redoxin domain protein  100 
 
 
170 aa  338  2e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0035  Redoxin domain protein  67.47 
 
 
168 aa  237  5e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1778  thiol peroxidase  61.21 
 
 
172 aa  209  1e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1822  Redoxin domain protein  59.41 
 
 
179 aa  209  2e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1783  thiol peroxidase (scavengase P20)  62.65 
 
 
181 aa  207  5e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0132  thiol peroxidase  61.08 
 
 
167 aa  201  4e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0323  thiol peroxidase (scavengase P20)  57.74 
 
 
174 aa  199  1.9999999999999998e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0000438204  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0870  thiol peroxidase  62.42 
 
 
175 aa  193  1e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0445504  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0800  thiol peroxidase  62.42 
 
 
175 aa  193  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.341037  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1232  thiol peroxidase  61.78 
 
 
175 aa  191  4e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0783  thiol peroxidase  62.42 
 
 
174 aa  190  8e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0630  thiol peroxidase  50 
 
 
169 aa  184  7e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0146681  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0642  thiol peroxidase (scavengase P20)  52.38 
 
 
175 aa  181  3e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3537  thiol peroxidase  54.22 
 
 
169 aa  177  4e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.515371 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2534  Redoxin domain protein  53.09 
 
 
167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0865  redoxin domain-containing protein  49.4 
 
 
167 aa  170  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0949069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3035  thiol peroxidase  52.41 
 
 
166 aa  170  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2625  thiol peroxidase  52.41 
 
 
166 aa  169  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963895  normal  0.840008 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1620  thiol peroxidase  52.12 
 
 
166 aa  169  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000227815  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0528  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  50.6 
 
 
166 aa  168  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2633  redoxin domain-containing protein  50.6 
 
 
166 aa  168  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0879  Redoxin domain protein  49.7 
 
 
167 aa  168  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.980796  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0830  thiol peroxidase  52.12 
 
 
166 aa  168  4e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0875  Redoxin domain protein  49.7 
 
 
167 aa  168  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0828  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  49.7 
 
 
187 aa  167  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2790  thiol peroxidase  52.41 
 
 
166 aa  167  9e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.071312  normal  0.970816 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3430  Redoxin domain protein  50 
 
 
166 aa  167  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0131471 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0091  Redoxin domain protein  50.6 
 
 
166 aa  164  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2710  Redoxin domain protein  51.9 
 
 
166 aa  163  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2971  thiol peroxidase  49.7 
 
 
165 aa  163  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.535001  normal  0.296496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2140  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  50 
 
 
166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000663162  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2783  redoxin domain-containing protein  49.1 
 
 
167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0729  Redoxin domain protein  50.63 
 
 
166 aa  160  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0841  redoxin domain-containing protein  45.24 
 
 
199 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.227128  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4010  Redoxin domain protein  49.69 
 
 
167 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000420392  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2467  Redoxin domain protein  50.91 
 
 
171 aa  159  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000376738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4103  Redoxin domain protein  49.69 
 
 
167 aa  159  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0527  redoxin domain-containing protein  48.5 
 
 
167 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.790405 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2959  Redoxin domain protein  49.7 
 
 
171 aa  158  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0503  redoxin domain-containing protein  48.5 
 
 
167 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2340  redoxin domain-containing protein  48.5 
 
 
171 aa  157  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0726108  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4470  redoxin domain-containing protein  48.81 
 
 
166 aa  157  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4748  thiol peroxidase  48.21 
 
 
166 aa  157  9e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1159  thiol peroxidase  47.31 
 
 
167 aa  156  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4373  thiol peroxidase  48.21 
 
 
166 aa  155  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2505  thiol peroxidase  47.31 
 
 
167 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155608  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3507  thiol peroxidase  47.31 
 
 
167 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1285  thiol peroxidase  47.31 
 
 
167 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.850808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2481  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.78 
 
 
166 aa  155  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.318431  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3504  thiol peroxidase  47.31 
 
 
167 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3279  thiol peroxidase  47.31 
 
 
167 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0950  thiol peroxidase  45.45 
 
 
166 aa  155  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0426  thiol peroxidase  47.31 
 
 
167 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0487  thiol peroxidase  48.21 
 
 
166 aa  155  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.309589 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1247  Redoxin domain protein  46.67 
 
 
173 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00450523  normal  0.919673 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3684  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  47.31 
 
 
167 aa  154  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.484477  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0570  redoxin domain-containing protein  47.31 
 
 
167 aa  154  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.913258  hitchhiker  0.00016403 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3469  thiol peroxidase  46.71 
 
 
167 aa  153  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0601  redoxin domain-containing protein  47.31 
 
 
167 aa  154  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0730  thiol peroxidase  46.99 
 
 
187 aa  153  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.543369 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2185  redoxin domain-containing protein  45.78 
 
 
166 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0352  thiol peroxidase  45.12 
 
 
171 aa  152  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0118  redoxin  46.71 
 
 
167 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0211  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.63 
 
 
165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1262  redoxin domain-containing protein  47.53 
 
 
165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.828642 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3734  redoxin  46.67 
 
 
164 aa  151  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.085288  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2328  redoxin domain-containing protein  46.39 
 
 
166 aa  151  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0833  thiol peroxidase  46.67 
 
 
173 aa  151  5e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.734828  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3587  redoxin domain protein  45.18 
 
 
166 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3798  redoxin domain-containing protein  44.85 
 
 
165 aa  150  7e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.247869  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1193  redoxin domain-containing protein  44.24 
 
 
165 aa  150  7e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2803  redoxin domain-containing protein  45.78 
 
 
166 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.919062  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11961  thiol peroxidase  47.88 
 
 
165 aa  150  8.999999999999999e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196708  normal  0.378209 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2752  thiol peroxidase  45.18 
 
 
166 aa  149  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.376703  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0624  thiol peroxidase  47.88 
 
 
168 aa  150  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000437492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2901  redoxin domain-containing protein  47.27 
 
 
169 aa  150  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000419182  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1795  thiol peroxidase  45.73 
 
 
167 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1903  thiol peroxidase  45.73 
 
 
167 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3312  redoxin domain-containing protein  48.73 
 
 
166 aa  149  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5269  Redoxin domain protein  46.95 
 
 
232 aa  149  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1081  Redoxin domain protein  48.78 
 
 
171 aa  149  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2520  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  45.78 
 
 
166 aa  148  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0980441 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4775  thiol peroxidase  48.1 
 
 
166 aa  147  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1011  Redoxin domain protein  46.88 
 
 
167 aa  147  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4757  thiol peroxidase  48.1 
 
 
166 aa  147  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4537  thiol peroxidase  48.1 
 
 
166 aa  147  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.451168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4383  thiol peroxidase  48.1 
 
 
166 aa  147  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4890  thiol peroxidase  48.1 
 
 
166 aa  147  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4774  thiol peroxidase  48.1 
 
 
166 aa  147  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3068  thiol peroxidase  46.39 
 
 
166 aa  147  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1717  Redoxin domain protein  42.42 
 
 
175 aa  147  9e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0532  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  42.94 
 
 
166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2616  thiol peroxidase  46.34 
 
 
167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.758954 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2322  Redoxin domain protein  45.12 
 
 
168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00106183  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1535  thiol peroxidase  45.12 
 
 
168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2869  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  46.99 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166383  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2313  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  48.73 
 
 
171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.262276  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31810  thiol peroxidase  46.06 
 
 
165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230308  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2301  thiol peroxidase  45.12 
 
 
168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1439  thiol peroxidase  45.12 
 
 
168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>