203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1254 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1254  DNA replication protein DnaC  100 
 
 		 242 aa  489  1e-137  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.014499  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0552  DNA replication protein DnaC  41.33 
 
 		 311 aa  132  3.9999999999999996e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000116033  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0060  DNA replication protein, DNAC-like  29.89 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  29.38 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3728  DNA replication protein-like protein  25 
 
 		 299 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3709  DNA replication protein-like protein  26.54 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3654  DNA replication protein-like protein  25 
 
 		 297 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3588  DNA replication protein-like  25 
 
 		 297 aa  99.4  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  30.08 
 
 		 275 aa  99.4  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1621  primosomal protein DnaI  27.89 
 
 		 300 aa  89.4  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0089  IstB ATP binding domain-containing protein  30.45 
 
 		 266 aa  88.6  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1499  IstB domain protein ATP-binding protein  28.42 
 
 		 247 aa  86.7  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0674056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1816  IstB domain protein ATP-binding protein  33.17 
 
 		 280 aa  85.1  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  25.78 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  25.78 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  25.78 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  25.78 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4220  IstB domain protein ATP-binding protein  28.99 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2013  AAA ATPase  26.48 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0083652  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  26.87 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0538  ATP-binding protein  37.96 
 
 		 426 aa  82.4  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.436507  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3170  DNA replication protein-like protein  27.12 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  26.89 
 
 		 247 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  28.79 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_479  DNA replication protein  39.84 
 
 		 470 aa  79.7  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1242  replicative DNA helicase loader DnaI  29.24 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118645  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0514  IstB ATP binding domain-containing protein  37.23 
 
 		 469 aa  79  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1802  hypothetical protein  35.53 
 
 		 275 aa  78.6  0.00000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  31.66 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1184  IstB-like ATP-binding protein  27.71 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.580215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  29.33 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1319  IstB ATP binding domain-containing protein  24 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18880  phage DNA replication protein (predicted replicative helicase loader)  30 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.614946  normal  0.0813321 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2340  IstB domain protein ATP-binding protein  32.49 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0243849  decreased coverage  0.0019144 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2467  hypothetical protein  33.77 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1552  IstB domain protein ATP-binding protein  25.52 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000031305 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  26.61 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4452  IstB domain protein ATP-binding protein  29.94 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0893  IstB ATP binding domain-containing protein  30.56 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02920  hypothetical protein  27.27 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000406909  hitchhiker  2.4308e-42 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  24.47 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1803  DNA replication protein-like protein  26.71 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.810263  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1416  primosomal protein DnaI  24.87 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0273394  hitchhiker  0.000000000000115155 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0607  IstB domain protein ATP-binding protein  26.44 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0806  AAA ATPase  27.42 
 
 		 343 aa  68.6  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23130  AAA ATPase  24.67 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0524  IstB ATP binding domain-containing protein  27.75 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0355335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4474  primosomal protein DnaI  27.94 
 
 		 312 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4309  primosomal protein DnaI  27.94 
 
 		 312 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0309734  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4320  primosomal protein DnaI  27.94 
 
 		 312 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4822  primosomal protein DnaI  27.94 
 
 		 312 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0550  primosomal protein DnaI  27.94 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000173374  unclonable  3.70822e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4703  primosomal protein DnaI  27.94 
 
 		 312 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000143247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4688  primosomal protein DnaI  27.94 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000410016  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3956  IstB ATP binding domain-containing protein  26.02 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4693  primosomal protein DnaI  27.94 
 
 		 312 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.23235e-61 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0795  primosomal protein DnaI  24.88 
 
 		 313 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4409  primosomal protein DnaI  27.23 
 
 		 312 aa  67  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0232524  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4709  primosomal protein DnaI  27.23 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140063  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0122  primosomal protein DnaI  27.78 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0444634  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0785  IstB domain protein ATP-binding protein  23.97 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.910617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2663  primosomal protein DnaI  24.51 
 
 		 312 aa  65.5  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.150188  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1404  IstB ATP binding domain-containing protein  33.85 
 
 		 267 aa  65.1  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2046  DNA replication protein DnaC  28.1 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000831596  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3438  IstB ATP binding domain-containing protein  26.42 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228593  unclonable  9.96626e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3264  primosomal protein DnaI  25.23 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0423883  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2958  DNA replication protein-like protein  23.37 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0796  primosomal protein DnaI  27.81 
 
 		 293 aa  58.5  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl579  chromosomal replication initiator protein  33.04 
 
 		 311 aa  57  0.0000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0531  replicative DNA helicase loader DnaI  27.15 
 
 		 315 aa  57  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296741  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0358  primosomal protein DnaI  26.62 
 
 		 300 aa  57  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0503  hypothetical protein  24.02 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000358381  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3580  IstB domain protein ATP-binding protein  23.75 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0305217  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1247  primosomal protein DnaI  24.28 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.126779  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0678  replicative DNA helicase loader DnaI  28.48 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2606  DNA replication protein-like protein  27.23 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000882358 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04238  DNA biosynthesis protein  25 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3636  AAA ATPase  25 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000285217  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4005  hypothetical protein  22.96 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04204  hypothetical protein  25 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000534515  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5874  DNA replication protein DnaC  25 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000300612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4593  DNA replication protein DnaC  25 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000805827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4954  DNA replication protein DnaC  25 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163404  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3694  DNA replication protein DnaC  25 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000380442  hitchhiker  0.00426992 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4901  DNA replication protein DnaC  25 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000247783  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4864  DNA replication protein DnaC  23.5 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4898  DNA replication protein DnaC  23.5 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.953972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4951  DNA replication protein DnaC  23.5 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4797  DNA replication protein DnaC  23.5 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.849133 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4957  DNA replication protein DnaC  23.5 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2615  DNA replication protein-like protein  25.21 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00158711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4906  DNA replication protein DnaC  25 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000177661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0638  IstB ATP binding domain-containing protein  21.12 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.965458  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1434  DNA replication protein DnaC, putative  23.38 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0633  hypothetical protein  30.91 
 
 		 311 aa  53.5  0.000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0700177  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0516  DNA replication protein DnaC  23.5 
 
 		 245 aa  53.1  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591707 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1741  primosomal protein DnaI  23.48 
 
 		 306 aa  53.1  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3454  AAA ATPase  25.96 
 
 		 276 aa  52.8  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1775  primosomal protein DnaI  23.48 
 
 		 306 aa  53.1  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2283  putative replication protein  29.57 
 
 		 249 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552648  normal  0.146717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>