More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1228 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1228  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 302 aa  613  9.999999999999999e-175  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000631212  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1366  branched-chain amino acid aminotransferase  56.95 
 
 		 305 aa  355  6.999999999999999e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0782  branched-chain amino acid aminotransferase  51.36 
 
 		 322 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1665  branched-chain amino acid aminotransferase  49.33 
 
 		 307 aa  317  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.908145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0191  branched-chain amino acid aminotransferase  48.84 
 
 		 322 aa  316  3e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2479  branched-chain amino acid aminotransferase  48.66 
 
 		 310 aa  310  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2544  branched-chain amino acid aminotransferase  47.99 
 
 		 308 aa  308  5e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.0975839 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0009  branched-chain amino acid aminotransferase  47.65 
 
 		 306 aa  300  2e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3362  branched-chain amino acid aminotransferase  44.75 
 
 		 311 aa  298  5e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135741  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0009  branched-chain amino acid aminotransferase  47.32 
 
 		 306 aa  297  1e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_9  branched-chain amino acid aminotransferase  47.32 
 
 		 306 aa  298  1e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3128  branched chain amino acid aminotransferase  46.49 
 
 		 318 aa  280  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  42.71 
 
 		 303 aa  270  2e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  44.07 
 
 		 303 aa  264  2e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1122  branched-chain amino acid aminotransferase  43.19 
 
 		 304 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0347625  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09601  branched-chain amino acid aminotransferase  44.15 
 
 		 304 aa  252  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0365373  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4800  branched-chain amino acid aminotransferase  44.04 
 
 		 304 aa  252  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  41.83 
 
 		 304 aa  251  8.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08861  branched-chain amino acid aminotransferase  43.42 
 
 		 305 aa  249  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.399627  hitchhiker  0.00000896946 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0248  branched-chain amino acid aminotransferase  42.14 
 
 		 305 aa  248  7e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14901  branched-chain amino acid aminotransferase  40.13 
 
 		 306 aa  248  7e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09811  branched-chain amino acid aminotransferase  43.33 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  40.86 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  40.46 
 
 		 307 aa  246  3e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  40.46 
 
 		 307 aa  246  3e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0922  branched-chain amino acid aminotransferase  43.81 
 
 		 304 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09831  branched-chain amino acid aminotransferase  43.33 
 
 		 304 aa  245  6e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  39.46 
 
 		 308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  42.33 
 
 		 317 aa  242  6e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10051  branched-chain amino acid aminotransferase  42.81 
 
 		 304 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.299148 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  38.94 
 
 		 309 aa  240  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2802  branched-chain amino acid aminotransferase  41.81 
 
 		 304 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3298  branched-chain amino acid aminotransferase  41.81 
 
 		 304 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.325063  normal  0.320727 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  42.28 
 
 		 306 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  43.14 
 
 		 307 aa  238  8e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0332  branched-chain amino acid aminotransferase  42.47 
 
 		 304 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0235876  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  41.83 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1720  branched-chain amino acid aminotransferase  38.49 
 
 		 316 aa  236  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  41.06 
 
 		 307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  41.81 
 
 		 307 aa  235  9e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1218  branched-chain amino acid aminotransferase  39.93 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.204453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  41.06 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  41.5 
 
 		 307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  41.5 
 
 		 307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1099  branched-chain amino acid aminotransferase  40.4 
 
 		 307 aa  233  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  38.13 
 
 		 311 aa  232  6e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  42.14 
 
 		 307 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  41.06 
 
 		 307 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  40.13 
 
 		 307 aa  231  9e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  38.8 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  37.54 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  38.54 
 
 		 312 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  42.3 
 
 		 307 aa  231  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  37.95 
 
 		 310 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  38.28 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  41.18 
 
 		 307 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1039  branched-chain amino acid aminotransferase  35.97 
 
 		 320 aa  229  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  41 
 
 		 307 aa  229  5e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1029  branched-chain amino acid aminotransferase  38.83 
 
 		 304 aa  229  5e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  37.95 
 
 		 309 aa  229  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4013  branched-chain amino acid aminotransferase  38.16 
 
 		 309 aa  228  7e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  40.86 
 
 		 304 aa  228  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  41.61 
 
 		 307 aa  228  7e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  38.87 
 
 		 307 aa  228  9e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  40.86 
 
 		 304 aa  228  9e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  40.52 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2033  branched-chain amino acid aminotransferase  39.6 
 
 		 304 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  40.52 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  37.95 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  40.53 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  39.8 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  39.74 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  40.2 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  39.74 
 
 		 319 aa  226  4e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  38.21 
 
 		 309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  38.21 
 
 		 309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  38.21 
 
 		 309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  38.21 
 
 		 309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4113  branched-chain amino acid aminotransferase  38.21 
 
 		 309 aa  225  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0180  branched-chain amino acid aminotransferase  40.54 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  36.96 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  36.96 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  37.54 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  36.96 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  36.96 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  36.96 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  36.96 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  36.96 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  36.96 
 
 		 309 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  36.96 
 
 		 309 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  37.54 
 
 		 312 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  37.95 
 
 		 305 aa  222  7e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  37.12 
 
 		 307 aa  222  7e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3631  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  37.04 
 
 		 308 aa  222  8e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  37.67 
 
 		 308 aa  221  9e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  37.21 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  37.67 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  40.26 
 
 		 307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  36.51 
 
 		 308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>