More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1171 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1171  Rhodanese domain protein  100 
 
 
305 aa  619  1e-176  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  9.63951e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0944  Rhodanese domain protein  36.25 
 
 
307 aa  187  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  2.1463e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4850  rhodanese-like protein  32.29 
 
 
300 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.146616 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  36.25 
 
 
270 aa  140  2e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0224  rhodanese domain-containing protein  34.96 
 
 
272 aa  137  3e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0198439  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2209  Rhodanese domain protein  31.27 
 
 
285 aa  132  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5416  putative thiosulfate sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  31.16 
 
 
291 aa  129  8e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  32.2 
 
 
293 aa  129  9e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2858  Rhodanese domain protein  29.58 
 
 
305 aa  128  1e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2614  rhodanese domain-containing protein  32.12 
 
 
287 aa  127  2e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.155894 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  32.63 
 
 
258 aa  126  5e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  33.58 
 
 
291 aa  125  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  35.21 
 
 
321 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  29.78 
 
 
280 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  35.21 
 
 
321 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  31.94 
 
 
277 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  31.94 
 
 
277 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  31.94 
 
 
277 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  31.63 
 
 
286 aa  122  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  34.19 
 
 
281 aa  122  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2079  rhodanese domain-containing protein  33.59 
 
 
340 aa  122  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0306  rhodanese-like protein  33.46 
 
 
293 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  33.97 
 
 
355 aa  122  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4507  rhodanese-like protein  31.03 
 
 
286 aa  120  2e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  31.73 
 
 
281 aa  120  2e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  31.18 
 
 
288 aa  120  2e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  31.99 
 
 
283 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  28.72 
 
 
277 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  32.03 
 
 
295 aa  118  1e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1030  Thiosulfate sulfurtransferase  30.8 
 
 
283 aa  118  1e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0259593 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  30.58 
 
 
282 aa  118  2e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6245  rhodanese domain-containing protein  31.12 
 
 
295 aa  117  2e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293222  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  33.84 
 
 
308 aa  116  4e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  33.45 
 
 
285 aa  116  4e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1253  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.28 
 
 
289 aa  116  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  33.44 
 
 
285 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2817  Rhodanese domain protein  32.96 
 
 
325 aa  115  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  31.72 
 
 
277 aa  115  7e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  31.72 
 
 
277 aa  115  7e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0622  rhodanese domain-containing protein  33.59 
 
 
271 aa  115  8e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07450  Rhodanese  30.55 
 
 
271 aa  115  1e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  33.58 
 
 
279 aa  115  1e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 
286 aa  115  1e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4699  rhodanese domain-containing protein  30.6 
 
 
269 aa  114  2e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0965  rhodanese-like protein  29.13 
 
 
290 aa  114  2e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4907  rhodanese domain protein  31.93 
 
 
269 aa  114  2e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  28.95 
 
 
297 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  31.14 
 
 
277 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1183  rhodanese-like protein  28.47 
 
 
286 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4642  Rhodanese domain protein  30.69 
 
 
275 aa  112  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  32.07 
 
 
279 aa  112  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4960  rhodanese domain-containing protein  31.36 
 
 
269 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  30.1 
 
 
277 aa  112  1e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  28.76 
 
 
297 aa  111  1e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  29.1 
 
 
285 aa  112  1e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  31.18 
 
 
288 aa  110  2e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
278 aa  110  2e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1897  thiosulfate sulfurtransferase  28.62 
 
 
273 aa  111  2e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.060194  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1161  Rhodanese domain protein  28.03 
 
 
314 aa  110  2e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.459743  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.9 
 
 
289 aa  111  2e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2528  thiosulfate sulfurtransferase  27.92 
 
 
276 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.211267  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  31.54 
 
 
290 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2678  fused rhodanese domain-containing protein/phosphatidylserine decarboxylase  28.68 
 
 
276 aa  110  4e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4532  rhodanese-like protein  27.93 
 
 
298 aa  109  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.79 
 
 
284 aa  109  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  32.94 
 
 
283 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1689  rhodanese-like protein  31.58 
 
 
320 aa  109  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.120717 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  32.43 
 
 
286 aa  109  7e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0441  rhodanese domain-containing protein  30.26 
 
 
281 aa  108  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  8.83325e-05 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  29.89 
 
 
292 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4783  rhodanese domain-containing protein  30.88 
 
 
269 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  30.42 
 
 
291 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  31.42 
 
 
284 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0510  rhodanese-like protein  31.23 
 
 
271 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.628271  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6828  Rhodanese domain protein  29.07 
 
 
281 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1183  Rhodanese domain protein  35.32 
 
 
279 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.915724  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  29.93 
 
 
280 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  29.76 
 
 
281 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5685  thiosulfate sulfurtransferase  30.15 
 
 
271 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  27.45 
 
 
297 aa  106  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6169  rhodanese domain-containing protein  30.53 
 
 
277 aa  106  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845163  normal  0.179847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  34.08 
 
 
613 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  34.23 
 
 
610 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0296  rhodanese domain-containing protein  28.62 
 
 
301 aa  105  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.64 
 
 
284 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0449  rhodanese-like protein  29.58 
 
 
277 aa  104  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  28.12 
 
 
279 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  29.25 
 
 
286 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2873  Rhodanese domain protein  32.21 
 
 
327 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1659  Rhodanese domain protein  34.3 
 
 
307 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35994e-11 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  33.2 
 
 
277 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  32.02 
 
 
285 aa  104  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  30.21 
 
 
279 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65480  thiosulfate sulfurtransferase  30.29 
 
 
271 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.54 
 
 
289 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  29.9 
 
 
277 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  33.2 
 
 
277 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.61696e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  32.05 
 
 
284 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  31.4 
 
 
284 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  31.32 
 
 
290 aa  103  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>