More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1157 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  100 
 
 		 217 aa  435  1e-121  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  42.35 
 
 		 242 aa  152  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0517  dethiobiotin synthase  46.77 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0354098  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  41.79 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  35.12 
 
 		 241 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  40.39 
 
 		 211 aa  134  9e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  39 
 
 		 240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  35.64 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  37.57 
 
 		 264 aa  129  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3711  dethiobiotin synthase  36.28 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00204232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  42.86 
 
 		 212 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  36.82 
 
 		 244 aa  125  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0617  dethiobiotin synthase  36.09 
 
 		 249 aa  124  7e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0451088  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  37 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  39.09 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  39.25 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  37.5 
 
 		 239 aa  123  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  36 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  36.09 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  37.31 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  38.38 
 
 		 234 aa  122  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  38.38 
 
 		 234 aa  122  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  34.42 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  38.94 
 
 		 241 aa  121  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  36.57 
 
 		 251 aa  121  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  36.57 
 
 		 262 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  35.5 
 
 		 242 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  35 
 
 		 242 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  36.89 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  35 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1752  dethiobiotin synthase  35.64 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00909358  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  38.59 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  35 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  35 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  33.52 
 
 		 225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  34.5 
 
 		 242 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  35 
 
 		 242 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  35.32 
 
 		 242 aa  115  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4330  dithiobiotin synthetase  31.7 
 
 		 228 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  34.5 
 
 		 242 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  34.62 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  34.07 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0820  dethiobiotin synthase  40.46 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.22019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18711  putative dethiobiotin synthase  36.14 
 
 		 216 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1097  dethiobiotin synthase  39.44 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110147  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  33.52 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  34.34 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  33.52 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  33.52 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  34.25 
 
 		 228 aa  113  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1002  dethiobiotin synthase  35.57 
 
 		 216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0030  dethiobiotin synthase  36.04 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82628  normal  0.806655 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  33.52 
 
 		 225 aa  112  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  32.16 
 
 		 242 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  32.84 
 
 		 248 aa  111  9e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  32.97 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0076  dethiobiotin synthase  38.69 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  33.52 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  32.97 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  32.09 
 
 		 220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  33.65 
 
 		 646 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3096  dethiobiotin synthase  32.52 
 
 		 238 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0304  dethiobiotin synthase  32.85 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2051  dethiobiotin synthase  32.38 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  33.33 
 
 		 227 aa  108  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2835  dethiobiotin synthase  35.42 
 
 		 225 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2946  dethiobiotin synthase  36.89 
 
 		 239 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00040484  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0003  dethiobiotin synthase  40 
 
 		 186 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16731  putative dethiobiotin synthase  35.42 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16511  putative dethiobiotin synthase  37.95 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  33.79 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  34.52 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0088  dethiobiotin synthase  38.04 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.021607  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  34.27 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16611  putative dethiobiotin synthase  35.05 
 
 		 232 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  38.12 
 
 		 226 aa  105  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1842  dithiobiotin synthetase  36.68 
 
 		 244 aa  105  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.709275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2454  dethiobiotin synthase  33.72 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.101684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0472  dethiobiotin synthase  35.98 
 
 		 219 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322044 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2554  dethiobiotin synthase  33.18 
 
 		 287 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0309873  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  36.36 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  31.32 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2815  dithiobiotin synthetase  35.18 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0070  dethiobiotin synthase  39.18 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338425  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04561  putative dethiobiotin synthase  32.99 
 
 		 232 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85593  dethiobiotin synthetase  37.71 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  35.36 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  32.6 
 
 		 228 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2186  dethiobiotin synthase  33.14 
 
 		 227 aa  101  7e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1568  dethiobiotin synthase  31.16 
 
 		 231 aa  101  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248853  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1474  dithiobiotin synthetase  32.82 
 
 		 202 aa  101  9e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  32.6 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  30.77 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1564  dethiobiotin synthase  33.85 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  32.96 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  32.6 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  31.11 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0621  dethiobiotin synthase  31.47 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  34.83 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1052  dethiobiotin synthase  36.96 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.802225  normal  0.0589723 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>