More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1153 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 250 aa  513  1.0000000000000001e-145  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1356  triosephosphate isomerase  52.87 
 
 		 246 aa  262  4e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.688667  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  52.61 
 
 		 251 aa  251  6e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  54.25 
 
 		 253 aa  251  8.000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  56.39 
 
 		 243 aa  249  3e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  55.95 
 
 		 243 aa  248  5e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  51.39 
 
 		 250 aa  248  6e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  54.43 
 
 		 655 aa  245  6e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  48.56 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  50.61 
 
 		 650 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  47.97 
 
 		 250 aa  241  6e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  47.76 
 
 		 253 aa  241  9e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  48.57 
 
 		 253 aa  236  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  51.02 
 
 		 249 aa  236  3e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 248 aa  234  9e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  48.02 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  45.71 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  47.98 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  48.21 
 
 		 256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  50.62 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  52.17 
 
 		 250 aa  232  5e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  46.94 
 
 		 251 aa  231  6e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 251 aa  230  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  48.37 
 
 		 251 aa  230  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  46.96 
 
 		 253 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  50.43 
 
 		 255 aa  229  4e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  46.5 
 
 		 251 aa  228  7e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  48.36 
 
 		 254 aa  228  8e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  46.53 
 
 		 251 aa  228  8e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  48.18 
 
 		 248 aa  228  9e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  46.53 
 
 		 251 aa  228  9e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  46.53 
 
 		 251 aa  228  9e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  46.53 
 
 		 251 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  46.53 
 
 		 251 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  47.18 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  46.53 
 
 		 251 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  48.99 
 
 		 257 aa  227  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0738  Triose-phosphate isomerase  52.42 
 
 		 243 aa  226  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000147069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  46.53 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  46.53 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  46.53 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  46.96 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  46.12 
 
 		 251 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 254 aa  224  8e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  45.97 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  46.15 
 
 		 253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  46.8 
 
 		 250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  48.56 
 
 		 251 aa  221  8e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  44.72 
 
 		 250 aa  220  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  48.77 
 
 		 249 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  46.94 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.18 
 
 		 646 aa  219  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  53.1 
 
 		 240 aa  219  3e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  44.9 
 
 		 248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  44.9 
 
 		 248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  46.15 
 
 		 253 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  46.12 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  46.15 
 
 		 253 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  47.62 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  47.56 
 
 		 253 aa  217  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  47.56 
 
 		 253 aa  217  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  44.49 
 
 		 251 aa  215  5e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0056  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 253 aa  214  9e-55  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_649  triose-phosphate isomerase  46.56 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  45.71 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  46.51 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.18 
 
 		 654 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  47.76 
 
 		 252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  45.71 
 
 		 250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0742  triosephosphate isomerase  44.98 
 
 		 251 aa  211  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2017  triosephosphate isomerase  48.73 
 
 		 256 aa  210  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.283793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 255 aa  210  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  44.4 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4528  triosephosphate isomerase  49.38 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0604  triosephosphate isomerase  44.72 
 
 		 270 aa  206  2e-52  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.783409  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 		 257 aa  207  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  46.53 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10411  triosephosphate isomerase  44.72 
 
 		 241 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  43.03 
 
 		 252 aa  205  5e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  43.55 
 
 		 249 aa  205  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09041  triosephosphate isomerase  44.72 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.535393  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  41.06 
 
 		 246 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0382  triosephosphate isomerase  44.13 
 
 		 246 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0851  triosephosphate isomerase  45.16 
 
 		 275 aa  202  3e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10411  triosephosphate isomerase  44.72 
 
 		 241 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10641  triosephosphate isomerase  43.72 
 
 		 246 aa  202  4e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0590544 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  43.5 
 
 		 256 aa  202  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2838  triosephosphate isomerase  41.49 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2707  triosephosphate isomerase  41.49 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  44.08 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1236  triosephosphate isomerase  46.77 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000124491  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  43.9 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1549  triosephosphate isomerase  42.06 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.42091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  42.11 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 		 275 aa  199  3e-50  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0971  triosephosphate isomerase  44.31 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>