More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1137 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1137  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
304 aa  610  1e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.72741e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  43.51 
 
 
447 aa  142  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  6.74118e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1895  Lytic transglycosylase catalytic  35.74 
 
 
693 aa  142  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0489  Lytic transglycosylase catalytic  35.78 
 
 
487 aa  138  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.73639e-08 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0472  lytic transglycosylase catalytic protein  34.18 
 
 
484 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  33.45 
 
 
547 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  34.29 
 
 
733 aa  137  3e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4010  lytic transglycosylase, catalytic  30.88 
 
 
507 aa  134  1e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  2.41761e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0695  Lytic transglycosylase catalytic  33.76 
 
 
499 aa  132  8e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000410524  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0393  lytic transglycosylase, catalytic  34.86 
 
 
498 aa  132  1e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00582053  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  37.38 
 
 
498 aa  132  1e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1010  Slt family transglycosylase  32.31 
 
 
506 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0077  Lytic transglycosylase catalytic  33.86 
 
 
322 aa  130  4e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1082  lytic transglycosylase, catalytic  34.88 
 
 
379 aa  129  7e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  31.69 
 
 
620 aa  128  1e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 
523 aa  127  2e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2556  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic  31.72 
 
 
499 aa  126  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000626959  hitchhiker  4.59399e-08 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1334  Lytic transglycosylase catalytic  40.26 
 
 
451 aa  125  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  33.92 
 
 
495 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  35.71 
 
 
618 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_002950  PG0139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  33.04 
 
 
451 aa  124  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.518176 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1354  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.35 
 
 
372 aa  123  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.401236  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0305  Lytic transglycosylase catalytic  30.77 
 
 
440 aa  123  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2744  Lytic transglycosylase catalytic  33.61 
 
 
448 aa  123  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.42143e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03310  Peptidoglycan-binding LysM  32.75 
 
 
523 aa  123  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1043  lytic transglycosylase, catalytic  32.77 
 
 
281 aa  123  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0755702  hitchhiker  0.000682757 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  32.91 
 
 
544 aa  122  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0380  Lytic transglycosylase catalytic  36.69 
 
 
555 aa  121  2e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0661  Lytic transglycosylase catalytic  30.77 
 
 
415 aa  121  2e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.398223  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  32.5 
 
 
587 aa  120  2e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  32.64 
 
 
595 aa  120  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  3.24493e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0748  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  31.51 
 
 
372 aa  120  4e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0673  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  31.51 
 
 
372 aa  119  7e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3834  Lytic transglycosylase catalytic  36.5 
 
 
405 aa  117  2e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0976  lytic transglycosylase, catalytic  31.6 
 
 
610 aa  116  4e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.773866  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1379  peptidoglycan-binding LysM  30.86 
 
 
556 aa  116  6e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0965  Lytic transglycosylase catalytic  32.24 
 
 
570 aa  115  7e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  29.66 
 
 
612 aa  115  9e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.66 
 
 
612 aa  115  9e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  34.88 
 
 
1079 aa  114  2e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  32.66 
 
 
442 aa  112  9e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1189  SLT:MLTD_N  29.17 
 
 
507 aa  110  2e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.103616 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  35.57 
 
 
1021 aa  111  2e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1087  lytic transglycosylase, catalytic  31.78 
 
 
650 aa  111  2e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.106498  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  35.57 
 
 
1001 aa  111  2e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  4.30428e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  32.92 
 
 
546 aa  110  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0499  Lytic transglycosylase catalytic  38.1 
 
 
279 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4145  lytic murein transglycosylase D  30.5 
 
 
476 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895478  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1720  MltD domain-containing protein  30.5 
 
 
476 aa  109  7e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131331  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  32.18 
 
 
661 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.33 
 
 
530 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0420  Slt family transglycosylase  34.4 
 
 
487 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00605393  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1767  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  34.4 
 
 
499 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.247006  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3717  MltD domain-containing protein  29.93 
 
 
476 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0908  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.44 
 
 
475 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  33.33 
 
 
534 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1205  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  32.24 
 
 
426 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.627815  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0654  peptidoglycan-binding LysM:Lytic transglycosylase, catalytic (SLT family)  26.19 
 
 
383 aa  107  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0645436  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0549  lytic transglycosylase, catalytic  32.55 
 
 
638 aa  106  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357331  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  31.45 
 
 
515 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0798  lytic transglycosylase catalytic  38.85 
 
 
351 aa  105  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.44501  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2183  lytic transglycosylase, catalytic  33.48 
 
 
492 aa  105  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.96919  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2650  lytic transglycosylase, catalytic  31.55 
 
 
514 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.012845 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  33.49 
 
 
534 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2028  membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative  38.62 
 
 
562 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0216  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.33 
 
 
452 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.806422  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1987  Dyp-type peroxidase  29.33 
 
 
403 aa  103  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0215  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.33 
 
 
452 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00533886  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00204  predicted membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.33 
 
 
452 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3454  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.33 
 
 
452 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0207  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.33 
 
 
452 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00209  hypothetical protein  30.33 
 
 
452 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.133083  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  30.87 
 
 
580 aa  103  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0225  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.37 
 
 
406 aa  103  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459174  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  27.95 
 
 
617 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.30746e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1976  Lytic transglycosylase catalytic  32.99 
 
 
504 aa  103  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0300  regulatory protein dnir  34.18 
 
 
321 aa  103  4e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.89505  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  31.75 
 
 
596 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0223  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.37 
 
 
406 aa  103  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1742  lytic transglycosylase, catalytic  32.99 
 
 
504 aa  102  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.785643  normal  0.0879149 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4898  lytic transglycosylase catalytic  32.98 
 
 
511 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2278  lytic transglycosylase, catalytic  42.06 
 
 
467 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  29.05 
 
 
543 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  4.44434e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0298  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.55 
 
 
406 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.349591  normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000744  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  36.18 
 
 
248 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0290  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.55 
 
 
406 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1522  Lytic transglycosylase catalytic  30.21 
 
 
561 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00867161  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0590  lytic transglycosylase, catalytic  31.41 
 
 
515 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0283  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.55 
 
 
406 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632709  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0285  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.55 
 
 
406 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02472  murein hydrolase D  31.75 
 
 
387 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1677  lytic transglycosylase, catalytic  39.84 
 
 
524 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.728963 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  30.92 
 
 
498 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2337  Lytic transglycosylase catalytic  35.14 
 
 
538 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.627607  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1603  putative exported transglycosylase protein  27.8 
 
 
552 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1499  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  27.8 
 
 
530 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261564  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0766  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  27.8 
 
 
530 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0745  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.73 
 
 
455 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.551604  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0559  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  27.8 
 
 
530 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0592  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  27.8 
 
 
553 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>