More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1102 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
466 aa  958    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  56.52 
 
 
468 aa  533  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  57.33 
 
 
477 aa  528  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  57.64 
 
 
477 aa  528  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  57.99 
 
 
474 aa  522  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  57.99 
 
 
475 aa  524  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  56.46 
 
 
474 aa  524  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  57.21 
 
 
467 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  56.89 
 
 
466 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  56.8 
 
 
487 aa  502  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1594  amidophosphoribosyltransferase  54.96 
 
 
464 aa  499  1e-140  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  55.8 
 
 
474 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  54.21 
 
 
475 aa  495  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  54.27 
 
 
462 aa  496  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  53.39 
 
 
475 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  54.55 
 
 
482 aa  492  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  53.39 
 
 
481 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  53.39 
 
 
476 aa  491  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1871  amidophosphoribosyltransferase  52.95 
 
 
451 aa  486  1e-136  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.10696  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  54.17 
 
 
472 aa  483  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  51.74 
 
 
463 aa  483  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  54.23 
 
 
484 aa  482  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  50.77 
 
 
461 aa  481  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  52.69 
 
 
488 aa  481  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  52.16 
 
 
490 aa  480  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  53.58 
 
 
488 aa  480  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  53.39 
 
 
469 aa  480  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  53.15 
 
 
485 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2307  amidophosphoribosyltransferase  51.31 
 
 
467 aa  475  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  53.15 
 
 
485 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  52.72 
 
 
462 aa  478  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  53.03 
 
 
485 aa  475  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  52.06 
 
 
470 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  52.28 
 
 
470 aa  477  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0292  amidophosphoribosyltransferase  51.53 
 
 
459 aa  471  1e-132  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2400  amidophosphoribosyltransferase  51.3 
 
 
514 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  52.05 
 
 
471 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  51.96 
 
 
471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  51.96 
 
 
471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  51.96 
 
 
471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  51.96 
 
 
471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  52.28 
 
 
495 aa  468  1.0000000000000001e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  51.96 
 
 
471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1618  amidophosphoribosyltransferase  52.31 
 
 
506 aa  468  1.0000000000000001e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  52.05 
 
 
471 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  52.05 
 
 
471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  50.99 
 
 
465 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  51.63 
 
 
478 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  51.84 
 
 
471 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  52.08 
 
 
465 aa  465  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  52.05 
 
 
503 aa  466  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  51.41 
 
 
480 aa  467  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  51.52 
 
 
471 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  51.3 
 
 
471 aa  462  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2109  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
475 aa  464  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  50.77 
 
 
459 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  51.3 
 
 
499 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2997  amidophosphoribosyltransferase  52.81 
 
 
514 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.807987  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4300  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
491 aa  458  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  0.0484415 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3894  amidophosphoribosyltransferase  50.65 
 
 
491 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5556  amidophosphoribosyltransferase  50.65 
 
 
511 aa  456  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3487  amidophosphoribosyltransferase  51.3 
 
 
503 aa  457  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746658  normal  0.621078 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
487 aa  456  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0405  amidophosphoribosyltransferase  50.11 
 
 
493 aa  455  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
491 aa  458  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  50.65 
 
 
500 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1541  amidophosphoribosyltransferase  49.36 
 
 
502 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267372  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0674  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 
473 aa  451  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0051  amidophosphoribosyltransferase  49.46 
 
 
479 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1523  amidophosphoribosyltransferase  50.55 
 
 
459 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0119394  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3501  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 
509 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
459 aa  450  1e-125  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0026  amidophosphoribosyltransferase  48.37 
 
 
484 aa  451  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
456 aa  451  1e-125  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2878  amidophosphoribosyltransferase  49.57 
 
 
517 aa  450  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.116336 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1147  amidophosphoribosyltransferase  49.04 
 
 
478 aa  450  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218005  normal  0.314166 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0672  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
473 aa  450  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0578  amidophosphoribosyltransferase  49.46 
 
 
486 aa  451  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  50.98 
 
 
474 aa  449  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0299  amidophosphoribosyltransferase  48.46 
 
 
446 aa  449  1e-125  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4407  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
491 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0141  amidophosphoribosyltransferase  50.97 
 
 
484 aa  445  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1152  amidophosphoribosyltransferase  48.7 
 
 
494 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0309  amidophosphoribosyltransferase  53.93 
 
 
473 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2502  amidophosphoribosyltransferase  49.35 
 
 
500 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1130  amidophosphoribosyltransferase  48.7 
 
 
494 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3939  amidophosphoribosyltransferase  49.79 
 
 
499 aa  445  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0008  amidophosphoribosyltransferase  52.74 
 
 
467 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0228  amidophosphoribosyltransferase  48.8 
 
 
470 aa  444  1e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000396195  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  49.47 
 
 
480 aa  441  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0174  amidophosphoribosyltransferase  48.79 
 
 
445 aa  442  1e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.838457  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2452  amidophosphoribosyltransferase  50.53 
 
 
514 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2311  amidophosphoribosyltransferase  50.11 
 
 
501 aa  443  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3044  amidophosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
478 aa  443  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1196  amidophosphoribosyltransferase  49.45 
 
 
472 aa  443  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1415  amidophosphoribosyltransferase  49.01 
 
 
472 aa  438  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0413  amidophosphoribosyltransferase  51.08 
 
 
491 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.577853 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2282  amidophosphoribosyltransferase  51.3 
 
 
503 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.235461  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3787  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 
510 aa  441  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1885  amidophosphoribosyltransferase  48.23 
 
 
502 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00311978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>