More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1084 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1084  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 144 aa  282  9e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.784641  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0842  ferric uptake regulator, Fur family  55.32 
 
 		 152 aa  153  7e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  44.29 
 
 		 143 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3863  ferric uptake regulator, Fur family  35.34 
 
 		 160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199126  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3806  ferric uptake regulator family protein  35.82 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3949  ferric uptake regulator, Fur family  35.07 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.234293  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  35.97 
 
 		 167 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  35.97 
 
 		 167 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  35.97 
 
 		 167 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  37.31 
 
 		 176 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  40.94 
 
 		 143 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  42.19 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  40.16 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3924  ferric uptake regulator family protein  35.61 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.567476 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  40.62 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  40.62 
 
 		 143 aa  103  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  39.57 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  40.29 
 
 		 155 aa  100  8e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  34.13 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  36.36 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  36.43 
 
 		 154 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  40.56 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  37.69 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  39.16 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  37.06 
 
 		 157 aa  94.4  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  37.06 
 
 		 157 aa  94.4  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  36.76 
 
 		 157 aa  94  6e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  37.86 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  36.09 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  34.81 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  39.57 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3767  ferric uptake regulator family protein  32.81 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2152  ferric uptake regulator  39.69 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2145  ferric-uptake regulator  33.82 
 
 		 164 aa  91.3  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  34.38 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  33.08 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1315  transcriptional regulator, TrmB  30.99 
 
 		 151 aa  90.9  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  37.98 
 
 		 143 aa  90.1  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1161  ferric uptake regulator family protein  30.77 
 
 		 137 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.13561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2494  FUR family manganese uptake regulator  30.77 
 
 		 137 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0021  ferric uptake regulator, Fur family  35.54 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  32.56 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  38.28 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  38.28 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  34.78 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  35.25 
 
 		 158 aa  89  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0033  ferric uptake regulator, Fur family  34.71 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.968997  normal  0.145253 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  36.23 
 
 		 155 aa  88.6  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0435  ferric uptake regulator  36.89 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  37.5 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1293  ferric uptake regulator family protein  29.53 
 
 		 149 aa  88.2  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  37.01 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0932  ferric uptake regulator family protein  30.77 
 
 		 137 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  36.69 
 
 		 148 aa  88.2  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  37.5 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  36.72 
 
 		 161 aa  88.6  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  36.69 
 
 		 148 aa  88.2  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4578  ferric uptake regulator, Fur family  35.51 
 
 		 166 aa  87.8  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.622664  normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1203  ferric-uptake regulator  32.88 
 
 		 164 aa  87.4  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.43174 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3031  ferric uptake regulator family protein  34.71 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0013  ferric uptake regulator family protein  33.88 
 
 		 135 aa  87  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00124444  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1147  FUR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 135 aa  87  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  33.58 
 
 		 151 aa  87  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  35.51 
 
 		 155 aa  87  8e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  35.94 
 
 		 143 aa  86.7  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  35.94 
 
 		 143 aa  86.7  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  35.94 
 
 		 143 aa  86.7  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  35.94 
 
 		 143 aa  86.7  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3615  ferric uptake regulator family protein  34.11 
 
 		 168 aa  86.3  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  35.04 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  34.78 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  35.04 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  36.72 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3947  FUR family manganese uptake regulator  32.8 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.960435  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1703  ferric uptake regulator protein  33.55 
 
 		 165 aa  86.3  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.341625 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2913  ferric uptake regulator family protein  33.58 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0873  ferric uptake regulator, Fur family protein  37.04 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  36.72 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  31.65 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1593  ferric uptake regulator  36.43 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000083166  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  35.04 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  36.5 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  35.97 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  35.51 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0279  ferric uptake regulator family protein  39.57 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.666463  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0159  ferric uptake regulator, Fur family  33.58 
 
 		 176 aa  85.1  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  35.51 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1649  ferric uptake regulator family protein  28.86 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0556503  hitchhiker  0.00120732 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  35.51 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  31.4 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  35.51 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  35.51 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  30.94 
 
 		 152 aa  84.3  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  31.2 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  35.51 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  35.51 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  35.51 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  35.51 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  35.51 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  35.51 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>