More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1048 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1048  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 187 aa  388  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0018  GTP cyclohydrolase I  63.89 
 
 		 182 aa  249  2e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00365351  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  56.61 
 
 		 198 aa  213  9.999999999999999e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  56.45 
 
 		 189 aa  213  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  57.61 
 
 		 247 aa  212  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  58.7 
 
 		 239 aa  209  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  58.7 
 
 		 239 aa  209  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  55.38 
 
 		 188 aa  206  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  58.99 
 
 		 235 aa  206  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  57.07 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  56.22 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  57.14 
 
 		 218 aa  206  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  59.02 
 
 		 235 aa  204  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  55.68 
 
 		 190 aa  204  8e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  55.14 
 
 		 214 aa  202  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1408  GTP cyclohydrolase I  54.59 
 
 		 192 aa  202  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0190569  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  55.14 
 
 		 214 aa  202  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  51.61 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  58.24 
 
 		 220 aa  201  4e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1481  GTP cyclohydrolase I  55.56 
 
 		 190 aa  200  9.999999999999999e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0225  GTP cyclohydrolase I  55.56 
 
 		 190 aa  199  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  55.03 
 
 		 190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  54.89 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  52.38 
 
 		 188 aa  199  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  55.14 
 
 		 243 aa  198  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  54.95 
 
 		 219 aa  197  5e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  53.23 
 
 		 200 aa  197  6e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  55.62 
 
 		 218 aa  197  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0204  GTP cyclohydrolase I  54.5 
 
 		 190 aa  196  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4315  GTP cyclohydrolase  54.59 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0297  GTP cyclohydrolase I  53.51 
 
 		 257 aa  195  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172833 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0466  GTP cyclohydrolase I  53.48 
 
 		 188 aa  195  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  55.49 
 
 		 223 aa  195  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  51.89 
 
 		 202 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  53.01 
 
 		 223 aa  194  6e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  54.49 
 
 		 216 aa  194  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1116  GTP cyclohydrolase I  50.81 
 
 		 187 aa  194  8.000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0977  GTP cyclohydrolase I  52.43 
 
 		 207 aa  194  8.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  51.09 
 
 		 213 aa  193  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  51.61 
 
 		 207 aa  193  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2153  GTP cyclohydrolase I  52.94 
 
 		 188 aa  193  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314147  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  52.2 
 
 		 226 aa  193  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  50.81 
 
 		 194 aa  193  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0644  GTP cyclohydrolase I  50.28 
 
 		 206 aa  193  2e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.343443  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  51.34 
 
 		 187 aa  192  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1233  GTP cyclohydrolase I  52.43 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  51.09 
 
 		 213 aa  192  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0849  GTP cyclohydrolase I  49.2 
 
 		 220 aa  191  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.989382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1911  GTP cyclohydrolase I  50.54 
 
 		 200 aa  191  5e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493644  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04920  GTP cyclohydrolase I, putative  53.55 
 
 		 435 aa  191  6e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0748  GTP cyclohydrolase I  46.56 
 
 		 227 aa  191  6e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1363  GTP cyclohydrolase I  52.66 
 
 		 188 aa  191  7e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.0760374 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  51.43 
 
 		 202 aa  190  8e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  51.08 
 
 		 193 aa  190  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  50.81 
 
 		 202 aa  190  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  52.78 
 
 		 216 aa  190  1e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  48.95 
 
 		 199 aa  190  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  52.69 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  51.35 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  51.35 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  51.35 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  51.37 
 
 		 210 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4064  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 197 aa  188  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.999809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  49.74 
 
 		 195 aa  187  5.999999999999999e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4743  GTP cyclohydrolase I  49.47 
 
 		 219 aa  187  9e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12810  GTP cyclohydrolase I  52.13 
 
 		 188 aa  187  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0017  GTP cyclohydrolase I  50.55 
 
 		 224 aa  186  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3739  GTP cyclohydrolase I  51.41 
 
 		 190 aa  187  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  53.55 
 
 		 212 aa  186  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2007  GTP cyclohydrolase  50 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.39333  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  50.79 
 
 		 202 aa  186  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1096  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  52.22 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  50.54 
 
 		 200 aa  185  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24770  GTP cyclohydrolase I  50.53 
 
 		 195 aa  186  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4307  GTP cyclohydrolase I  47.34 
 
 		 219 aa  185  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1274  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000261815  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  52.25 
 
 		 225 aa  185  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1234  GTP cyclohydrolase I  49.2 
 
 		 189 aa  184  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00505478  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  45.99 
 
 		 211 aa  184  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1638  GTP cyclohydrolase I  49.2 
 
 		 189 aa  184  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00226958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1421  GTP cyclohydrolase I  49.2 
 
 		 189 aa  184  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0305505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1393  GTP cyclohydrolase I  49.2 
 
 		 189 aa  184  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000458724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1393  GTP cyclohydrolase I  49.2 
 
 		 189 aa  184  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000162982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3778  GTP cyclohydrolase I  49.2 
 
 		 189 aa  184  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1674  GTP cyclohydrolase I  49.2 
 
 		 189 aa  184  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000600048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1532  GTP cyclohydrolase I  49.2 
 
 		 189 aa  184  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0324228  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2817  GTP cyclohydrolase I  50.27 
 
 		 206 aa  184  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3782  GTP cyclohydrolase I  50.28 
 
 		 189 aa  184  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1605  GTP cyclohydrolase I  49.2 
 
 		 189 aa  184  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212521 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1567  GTP cyclohydrolase I  49.2 
 
 		 189 aa  184  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.293736  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  52.2 
 
 		 270 aa  184  5e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1435  GTP cyclohydrolase I  49.2 
 
 		 189 aa  184  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0775791  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24880  GTP cyclohydrolase I  52.72 
 
 		 194 aa  184  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2932  GTP cyclohydrolase I  51.35 
 
 		 201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0900198 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35640  GTP cyclohydrolase I  49.21 
 
 		 222 aa  183  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01250  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 		 206 aa  183  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1238  GTP cyclohydrolase I  50.27 
 
 		 205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  46.74 
 
 		 209 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2203  GTP cyclohydrolase I  50.27 
 
 		 187 aa  182  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>