More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1012 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1012  fimbrial protein  100 
 
 
154 aa  311  2e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  7.8428e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1011  hypothetical protein  46.62 
 
 
136 aa  116  9e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  6.60577e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  44.76 
 
 
138 aa  70.1  1e-11  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  50.77 
 
 
188 aa  60.5  8e-09  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  40.38 
 
 
182 aa  60.5  8e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0324  hypothetical protein  37.4 
 
 
167 aa  59.7  1e-08  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00212965  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  41.94 
 
 
141 aa  59.3  2e-08  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  65 
 
 
147 aa  58.5  3e-08  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  60 
 
 
111 aa  58.5  3e-08  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  58.54 
 
 
169 aa  58.5  3e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  41.11 
 
 
168 aa  58.2  4e-08  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  61.54 
 
 
179 aa  57.8  5e-08  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0126  Tfp pilus assembly protein PilE-like  46.43 
 
 
151 aa  57  1e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0148502  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  55 
 
 
153 aa  56.6  1e-07  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  58.54 
 
 
139 aa  56.6  1e-07  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  65 
 
 
141 aa  56.6  1e-07  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  40.45 
 
 
174 aa  56.6  1e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.24 
 
 
163 aa  56.6  1e-07  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  56.1 
 
 
133 aa  56.6  1e-07  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  67.57 
 
 
152 aa  56.2  1e-07  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  43.08 
 
 
148 aa  57  1e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0321  hypothetical protein  36.56 
 
 
185 aa  55.5  2e-07  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0183031  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  58.54 
 
 
178 aa  55.8  2e-07  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  58.54 
 
 
168 aa  55.8  2e-07  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  55.81 
 
 
164 aa  56.2  2e-07  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  58.54 
 
 
169 aa  56.2  2e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  56.1 
 
 
196 aa  55.5  3e-07  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  42.25 
 
 
152 aa  55.5  3e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  51.28 
 
 
168 aa  55.5  3e-07  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  62.16 
 
 
139 aa  55.5  3e-07  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  60 
 
 
174 aa  55.1  3e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  51.16 
 
 
157 aa  55.1  4e-07  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  56.1 
 
 
163 aa  54.7  4e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  39.58 
 
 
138 aa  54.7  4e-07  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  6.90325e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  52.27 
 
 
179 aa  54.3  5e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  56.1 
 
 
167 aa  54.7  5e-07  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  57.5 
 
 
173 aa  54.7  5e-07  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  61.54 
 
 
169 aa  54.7  5e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0110  putative major pilin subunit  58.97 
 
 
146 aa  54.3  6e-07  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000976692  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  51.79 
 
 
169 aa  54.3  6e-07  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  58.97 
 
 
146 aa  53.9  7e-07  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  62.16 
 
 
136 aa  53.9  7e-07  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  62.16 
 
 
142 aa  54.3  7e-07  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0114  putative major pilin subunit  58.97 
 
 
146 aa  53.9  7e-07  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00878541  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  56.1 
 
 
160 aa  53.9  7e-07  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  58.97 
 
 
146 aa  53.9  7e-07  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  58.97 
 
 
146 aa  53.9  7e-07  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  58.97 
 
 
146 aa  53.9  7e-07  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00106  hypothetical protein  58.97 
 
 
146 aa  53.9  7e-07  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  60 
 
 
148 aa  53.9  7e-07  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  56.82 
 
 
142 aa  53.9  8e-07  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  54.76 
 
 
138 aa  53.9  9e-07  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  36.59 
 
 
147 aa  53.5  9e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  53.85 
 
 
166 aa  53.5  9e-07  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  30 
 
 
159 aa  53.5  9e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  61.54 
 
 
148 aa  53.1  1e-06  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  56.41 
 
 
179 aa  53.5  1e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  53.49 
 
 
145 aa  53.5  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.320147 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  63.16 
 
 
134 aa  53.1  1e-06  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0157  putative major pilin subunit  57.5 
 
 
145 aa  53.5  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0164  putative major pilin subunit  57.5 
 
 
145 aa  53.5  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268979  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0134  hypothetical protein  36.36 
 
 
139 aa  53.1  1e-06  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  58.97 
 
 
160 aa  53.1  1e-06  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0156  putative major pilin subunit  57.5 
 
 
145 aa  53.5  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  28.93 
 
 
144 aa  53.5  1e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  43.48 
 
 
176 aa  53.5  1e-06  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0236  hypothetical protein  33.64 
 
 
139 aa  53.1  1e-06  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  56.41 
 
 
145 aa  53.5  1e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0161  putative major pilin subunit  57.5 
 
 
145 aa  53.5  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  57.5 
 
 
142 aa  53.1  1e-06  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  51.16 
 
 
173 aa  53.1  1e-06  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  45.61 
 
 
169 aa  53.1  1e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  62.5 
 
 
141 aa  53.5  1e-06  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  57.5 
 
 
142 aa  53.5  1e-06  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.68 
 
 
175 aa  52.8  2e-06  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  3.36485e-10  hitchhiker  7.27713e-08 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  64.86 
 
 
165 aa  52.8  2e-06  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.28 
 
 
165 aa  52.4  2e-06  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  38.75 
 
 
143 aa  52.4  2e-06  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  2.65425e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  56.41 
 
 
162 aa  52.4  2e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  28 
 
 
154 aa  52.8  2e-06  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  47.92 
 
 
135 aa  52.8  2e-06  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  56.41 
 
 
165 aa  52.4  2e-06  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  40.82 
 
 
201 aa  52  3e-06  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  57.89 
 
 
146 aa  52  3e-06  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  50 
 
 
170 aa  52  3e-06  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  66.67 
 
 
70 aa  52  3e-06  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  5.11675e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  41.86 
 
 
195 aa  52  3e-06  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  51.22 
 
 
170 aa  52  3e-06  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  60 
 
 
169 aa  51.6  4e-06  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_142  general secretion pathway protein H  33.64 
 
 
139 aa  51.6  4e-06  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  52.17 
 
 
137 aa  51.6  4e-06  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  35.48 
 
 
134 aa  51.6  4e-06  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3575  putative major pilin subunit  44.26 
 
 
148 aa  51.6  4e-06  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1319  secretory protein  29.82 
 
 
149 aa  51.2  4e-06  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0113151 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  56.41 
 
 
167 aa  51.2  5e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  26.67 
 
 
177 aa  50.8  6e-06  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.27 
 
 
158 aa  50.8  6e-06  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  32.39 
 
 
146 aa  50.8  6e-06  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  40.28 
 
 
141 aa  50.8  6e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  56.41 
 
 
208 aa  50.8  7e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>