117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1011 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1011  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  266  8e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  6.60577e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1012  fimbrial protein  44.7 
 
 
154 aa  76.6  1e-13  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  7.8428e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  37.72 
 
 
135 aa  53.9  8e-07  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  29.66 
 
 
168 aa  53.5  9e-07  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  50 
 
 
188 aa  53.1  1e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  54.05 
 
 
138 aa  50.4  9e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0126  Tfp pilus assembly protein PilE-like  44.44 
 
 
151 aa  48.9  2e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0148502  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  45.65 
 
 
160 aa  48.5  3e-05  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  34.15 
 
 
160 aa  48.1  4e-05  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  45.24 
 
 
163 aa  47.8  5e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  45.24 
 
 
168 aa  47.4  6e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  42.86 
 
 
169 aa  47  8e-05  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  28.44 
 
 
148 aa  47  8e-05  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  45.24 
 
 
169 aa  47  8e-05  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  48.65 
 
 
133 aa  47.4  8e-05  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  47.22 
 
 
179 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  57.14 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  52.78 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  40.68 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  36.99 
 
 
147 aa  45.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  31.48 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  33.33 
 
 
162 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  47.22 
 
 
179 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  32.69 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  6.90325e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0114  putative major pilin subunit  40.68 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00878541  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  28.46 
 
 
178 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  48.65 
 
 
111 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  40.68 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  40.43 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  39.22 
 
 
174 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  40.68 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0110  putative major pilin subunit  40.68 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000976692  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00106  hypothetical protein  40.68 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  40.68 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  40.68 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.94 
 
 
193 aa  44.7  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0324  hypothetical protein  37.78 
 
 
167 aa  44.7  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00212965  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  42.5 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  47.22 
 
 
179 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3575  putative major pilin subunit  41.3 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  42.86 
 
 
167 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  37.31 
 
 
138 aa  44.3  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  29.87 
 
 
139 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  39.02 
 
 
174 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  38.1 
 
 
196 aa  44.7  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  30.49 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  29.27 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  40.48 
 
 
170 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  27.18 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0321  hypothetical protein  30 
 
 
185 aa  44.3  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0183031  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  39.13 
 
 
165 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  40 
 
 
166 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  47.22 
 
 
169 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  41.18 
 
 
174 aa  43.9  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3385  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  35.71 
 
 
199 aa  43.9  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  42.5 
 
 
136 aa  43.9  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  37.7 
 
 
141 aa  43.9  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  47.5 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.44 
 
 
163 aa  43.5  0.0009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  39.66 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.320147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  40.74 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0157  putative major pilin subunit  48.65 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0161  putative major pilin subunit  48.65 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0164  putative major pilin subunit  48.65 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268979  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  29.27 
 
 
136 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0156  putative major pilin subunit  48.65 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  30.85 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  43.24 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1757  hypothetical protein  51.43 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0738  general secretion pathway protein H  32.61 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.607595  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1281  putative general secretion pathway protein H, GspH  28.95 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  44.12 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0666  putative major pilin subunit  42.59 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  47.06 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  44.12 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1041  putative major pilin subunit  50 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.131052 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3498  putative major pilin subunit  50 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3370  putative major pilin subunit  50 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.981789  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0721  hypothetical protein  55.56 
 
 
70 aa  41.6  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.873488 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  43.59 
 
 
182 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  43.24 
 
 
137 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  36.92 
 
 
169 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  47.06 
 
 
146 aa  41.6  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.84 
 
 
171 aa  41.6  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0627  putative major pilin subunit  37.7 
 
 
147 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  45.95 
 
 
172 aa  41.2  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  25 
 
 
201 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  47.22 
 
 
165 aa  41.6  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  42.86 
 
 
173 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08271  hypothetical protein  40.54 
 
 
168 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.125475  hitchhiker  4.13407e-05 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  24.8 
 
 
178 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  42.5 
 
 
167 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  45.71 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  44.12 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  50 
 
 
174 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  52.94 
 
 
221 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  40.48 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  52.94 
 
 
208 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  35 
 
 
150 aa  40.8  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  44.74 
 
 
174 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0726397 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>