33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1010 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1010  hypothetical protein  100 
 
 
634 aa  1263    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101857  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2684  hypothetical protein  26.44 
 
 
621 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.427064  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2597  hypothetical protein  27.31 
 
 
619 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1629  hypothetical protein  26.45 
 
 
619 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2515  hypothetical protein  24.66 
 
 
652 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0758792  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1489  hypothetical protein  24.7 
 
 
623 aa  109  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1391  hypothetical protein  26.23 
 
 
619 aa  107  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.86997 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1651  hypothetical protein  25.22 
 
 
624 aa  104  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0333  hypothetical protein  36.13 
 
 
880 aa  94  8e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1794  hypothetical protein  32.97 
 
 
1245 aa  90.9  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.69552  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2017  hypothetical protein  30.33 
 
 
880 aa  90.5  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000248245  normal  0.284056 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2374  hypothetical protein  32.35 
 
 
881 aa  89.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0423348  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0223  hypothetical protein  32.2 
 
 
881 aa  87.8  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2243  hypothetical protein  28.43 
 
 
875 aa  84.3  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0197  hypothetical protein  29.68 
 
 
880 aa  81.6  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2186  hypothetical protein  30.11 
 
 
882 aa  75.5  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000183684  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0932  hypothetical protein  32.65 
 
 
541 aa  73.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.315139  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01380  hypothetical protein  28.02 
 
 
1109 aa  71.2  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.369989  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1626  hypothetical protein  25.77 
 
 
1093 aa  67  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2927  hypothetical protein  26.96 
 
 
1001 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000253968 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4667  hypothetical protein  26.67 
 
 
1076 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0836755  hitchhiker  0.00000000312371 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1844  hypothetical protein  27.27 
 
 
1005 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0832694 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0935  hypothetical protein  24.65 
 
 
531 aa  62  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0051  hypothetical protein  20.94 
 
 
613 aa  61.2  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.062012 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0307  hypothetical protein  24.88 
 
 
993 aa  60.5  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0238  hypothetical protein  22.83 
 
 
947 aa  58.5  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4967  hypothetical protein  23.3 
 
 
991 aa  57.4  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2085  hypothetical protein  23.7 
 
 
989 aa  57  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0968  conserved hypothetical protein, membrane  25.63 
 
 
1103 aa  56.6  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.688922  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1528  hypothetical protein  24.87 
 
 
984 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0809349 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0581  hypothetical protein  24.38 
 
 
1009 aa  55.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.272409  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2144  hypothetical protein  23.3 
 
 
1099 aa  48.5  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1942  hypothetical protein  21.38 
 
 
580 aa  44.3  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0873468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>